患者招募与分组
收集COVID-19患者和健康对照的临床数据及血浆样本,根据严重程度分组。
纳入97例COVID-19患者(分为非重症37例和重症60例)和53例健康志愿者,记录基线资料、实验室指标,随访90天死亡率。
Prognostic Value of C-Reactive Protein, Procalcitonin, and Interferon-Alpha in COVID-19 and Their Association with PANoptosis: A Cohort Study in Guangxi, China.
包含临床队列分析(97例患者和53例健康者)及体外细胞实验(流式、免疫荧光、Western blot),但缺乏动物模型、类器官等证据层级,功能验证仅限于细胞水平。
COVID-19患者队列(97例,严重与非严重分组) 健康对照(53例) 外周血中性粒细胞、淋巴细胞和血小板 人外周血细胞(刺激模型)
生物标志物检测:IL-6、IL-8、IL-10、IFN-α、PCT、CRP的检测方法及入组时采样时间(入院24小时内) 细胞刺激条件:CRP 5 µg/mL、PCT 0.65 µg/mL、IFN-α 160 ng/mL,刺激时间(LYMs和PLTs 8小时,NEUs 24小时) 细胞死亡检测:PI染色流式细胞术,重复三次,每次三重复 PANoptosis标志物检测:Western blot检测cleaved-caspase3、GSDMD、p-MLKL/MLKL,免疫荧光检测p-MLKL、GSDMD、cleaved-caspase3 临床分组标准:依据出院诊断分为非重症和重症,90天死亡率随访
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集COVID-19患者和健康对照的临床数据及血浆样本,根据严重程度分组。
纳入97例COVID-19患者(分为非重症37例和重症60例)和53例健康志愿者,记录基线资料、实验室指标,随访90天死亡率。
全面评估多种生物标志物与COVID-19严重程度的关联。
通过CBA法检测IL-6、IL-8、IL-10,通过ELISA检测其他标志物,结合医院实验室指标,共评估41项标志物。
确定有效标志物的最佳临界值及其预测严重程度和死亡的能力。
通过ROC曲线确定AUC和Cut-off值,并利用Kaplan-Meier曲线分析不同标志物水平对90天生存率的影响。
评估筛选出的生物标志物单独或组合对外周血细胞存活的影响。
从健康志愿者外周血中分离中性粒细胞、淋巴细胞和血小板,用标志物单独或组合刺激,检测细胞死亡比例。
确认标志物诱导的细胞死亡是否为PANoptosis。
通过Western blot和免疫荧光检测凋亡、焦亡、坏死性凋亡的标志物表达,并检测中性粒细胞NETs释放。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血液样本处理 | Percoll | GE Healthcare | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞刺激 | 人C反应蛋白 | Sigma-Aldrich | C4063 |
| 重组人降钙素原蛋白 | Abcam | ab92843 | |
| 白细胞介素-6 | MCE | HY-P7044 | |
| 白细胞介素-8 | MCE | HY-P722044 | |
| 白细胞介素-10 | MCE | HY-P7030 | |
| 干扰素-α | MCE | HY-P7022 | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 免疫荧光 | p-MLKL抗体 | NOVUSBIO | 954724 |
| GSDMD抗体 | Invitrogen | PA5-119680 | |
| Cleaved-Caspase-3抗体 | CST | 9664S | |
| DAPI染料 | -- | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1 | |
| Cleaved-Caspase-3抗体 | CST | 9664S | |
| GSDMD抗体 | Invitrogen | PA5-119680 | |
| N-GSDMD抗体 | Abcam | ab215203 | |
| MLKL抗体 | Proteintech | 21066-1-AP | |
| p-MLKL抗体 | NOVUSBIO | 954724 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
| 免疫荧光 | 激光共聚焦显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列纳入与分组 | COVID-19诊断标准(阳性SARS-CoV-2检测)、年龄≥18岁、排除孕产妇;严重程度分类依据出院诊断(非重症/重症);样本量(97例患者,53例对照);随访90天死亡率 阅读提示:Materials and Methods: Study Populations; Results: Patient Characteristics and Table 1 |
| 血浆标志物检测 | 采血时间(入院24小时内)、离心条件(3000 rpm, 10 min, 4°C)、检测方法(CBA for IL-6/8/10; ELISA for IFN-α等)、试剂盒及货号(如IL-6 Flex Set 558276等) 阅读提示:Materials and Methods: Plasma Samples; Marker Levels Detection |
| 生物标志物预测价值分析 | ROC曲线分析确定AUC及最佳cut-off值(如IL-8 cut-off 9.980 pg/mL等)、Kaplan-Meier生存分析分组(低/高表达组) 阅读提示:Results: The Predictive Capacity...; Table 3; Figure 4 |
| 外周血细胞分离与刺激 | 健康志愿者来源、分离方法(Percoll用于中性粒细胞,淋巴细胞分离液用于淋巴细胞,血小板分离步骤)、细胞培养条件(RPMI 1640, 10% FBS, 1% P/S, 0.1 M HEPES) 阅读提示:Materials and Methods: Peripheral Blood Cells Isolation and Cultivation; Cells Treatment |
| 细胞刺激与PANoptosis检测 | 刺激物浓度(CRP 5 µg/mL, PCT 0.65 µg/mL, IFN-α 160 ng/mL等)、刺激时间(8h或24h)、检测方法(PI染色流式细胞术,Western blot,免疫荧光)、重复次数(三次,三重复) 阅读提示:Materials and Methods: Cells Treatment; Flow Cytometry Analysis; Immunofluorescence Assay; Western-Blot |