构建转基因寄生虫株
获得具有青蒿素耐药性的虫株模型
利用SLI方法在3D7背景引入Kelch13 C580Y突变和过表达人VPS34,构建3D7-PfKelch13WT、3D7-PfKelch13C580Y和3D7VPS34株。
PfPI3K inhibition reversed artemisinin resistance by increasing ROS and ubiquitinated protein levels in Plasmodium falciparum.
包含转基因寄生虫构建、体外药敏实验、RSA、机制验证(ROS、抗氧化、蛋白稳态)等多层级实验。
恶性疟原虫3D7转基因株(3D7-PfKelch13WT、3D7-PfKelch13C580Y、3D7VPS34)
转基因寄生虫株:3D7-PfKelch13WT、3D7-PfKelch13C580Y、3D7VPS34 DHA和idelalisib的IC50及联合给药浓度 环状体存活试验(RSA)条件:700 nM DHA、5 μM idelalisib、6小时暴露 PI3P水平检测方法:Echelon PI3P Mass ELISA Kit (K-3300)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得具有青蒿素耐药性的虫株模型
利用SLI方法在3D7背景引入Kelch13 C580Y突变和过表达人VPS34,构建3D7-PfKelch13WT、3D7-PfKelch13C580Y和3D7VPS34株。
验证转基因株对DHA的耐药性及与PI3P水平的关系
进行72小时药敏实验测定IC50,环状体存活试验(RSA)测定耐药性,并测量PI3P水平。
筛选与DHA有协同作用的PfPI3K抑制剂
测定五种候选抑制剂的IC50,并通过两种共培养方法评估与DHA联合的抗疟活性,计算CI值。
探究联合治疗是否通过增加ROS积累并削弱抗氧化能力发挥抗疟作用
检测ROS水平、血红蛋白内吞和分级、抗氧化酶基因表达和活性、谷胱甘肽含量及线粒体膜电位和DNA断裂。
验证联合治疗是否导致泛素化蛋白积累和ER应激
检测泛素化蛋白水平、eIF2α磷酸化及UPR通路基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 寄生虫培养 | RPMI 1640培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| Albumax II | Invitrogen | -- | |
| D-山梨醇 | -- | -- | |
| Percoll | -- | -- | |
| 药物处理 | 艾德拉尼 | -- | -- |
| 厄布利塞 | -- | -- | |
| 他塞利塞 | -- | -- | |
| AZD6482 | -- | -- | |
| 库潘利塞 | -- | -- | |
| 药物筛选 | WR99210 | -- | -- |
| DSM1 | -- | -- | |
| 杀稻瘟菌素S盐酸盐 | -- | -- | |
| 电转 | Bio-Rad Gene Pulser Xcell电转仪 | Bio-Rad | -- |
| 质粒构建 | pCMV-Myc-VPS34质粒 | MiaoLingBio | P1799 |
| pSLI-N-sandwich-loxP (K13)质粒 | Addgene | 85793 | |
| p1xNLS-FRB-mCherry-hsp86-BSD质粒 | Addgene | 85795 | |
| PI3P检测 | PI3P定量ELISA试剂盒 | Echelon Biosciences | K-3300 |
| 激酶活性检测 | III类PI3激酶试剂盒 | Echelon Biosciences | K-3000 |
| ROS检测 | 二氢乙啶 | Elabscience | -- |
| 抗氧化检测 | 总抗氧化能力比色法试剂盒 | Elabscience | E-BC-K136-M |
| 总超氧化物歧化酶活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K019-S | |
| 谷胱甘肽还原酶活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K099-M | |
| 硫氧还蛋白还原酶活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K548-M | |
| 线粒体膜电位检测 | 四甲基罗丹明乙酯 | Beyotime | -- |
| DNA断裂检测 | TUNEL试剂盒 | Elabscience | -- |
| RNA提取 | TRIgent | Mei5bio | -- |
| 逆转录 | HiScript III逆转录预混液(+gDNA去除)试剂盒 | Vazyme | -- |
| qPCR | ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| 免疫印迹 | 抗GFP抗体 | Abclonal | AE078 |
| 抗mCherry抗体 | Abclonal | AE127 | |
| 抗β-actin抗体 | Abclonal | AC038 | |
| 抗泛素抗体 | Abclonal | A0162 | |
| 抗磷酸化eIF2α抗体 | Abclonal | AP0692 | |
| 抗eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | L57A5 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白酶抑制剂混合物 | MCE | -- |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | -- | -- | |
| 化学发光检测 | Bio-Rad ChemiDocTM MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 流式分析 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman | -- |
| Beckman Navios流式细胞仪 | Beckman | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 9.0 | -- | -- |
| CompuSyn | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 寄生虫培养 | RPMI 1640培养基配方、Albumax II浓度、培养气体条件、红细胞来源 阅读提示:Methods: P. falciparum culture and synchronization |
| 转基因株构建 | 质粒构建、转染方法、药物筛选浓度(WR99210、DSM1、blasticidin)、克隆筛选 阅读提示:Methods: Cloning and generation of constructs, P. falciparum transfection and selection |
| 药敏试验 | DHA和抑制剂的IC50值、寄生虫时期(2-4h环状体)、培养时间72小时、SYBR Green I检测 阅读提示:Methods: In vitro 72-h susceptibility assays |
| RSA | 环状体时期(0-3h)、寄生虫血症、红细胞压积、DHA浓度700 nM、idelalisib浓度5 μM、暴露时间6小时 阅读提示:Methods: Ring-stage survival assay |
| PI3P检测 | 药物处理浓度和时间(IC50,24h)、寄生虫数量、脂质提取方法、ELISA试剂盒 阅读提示:Methods: Measurement of PI3P levels |
| 激酶活性检测 | 免疫沉淀步骤、蛋白量、试剂盒(K-3000)、药物处理条件 阅读提示:Methods: Generation of anti-PfPI3K antibody and PI3-kinase assay |