建立吉非替尼耐药细胞模型
模拟临床中吉非替尼获得性耐药的发生过程,获得耐药细胞系。
将PC9细胞暴露于梯度浓度吉非替尼(从0.01μM递增至10μM),持续15个月,筛选获得耐药株PC9GR,并通过CCK-8、PI/DAPI染色、流式凋亡、Western blot及CETSA验证耐药特征。
CEMIP promotes gefitinib resistance in lung cancer with EGFR-mutation possibly through forming a stable complex CEMIP/c-MYC.
包含体外细胞模型、体内异种移植模型,及Co-IP、CHX追踪、双荧光素酶、蛋白质对接等机制验证。
PC9细胞及耐药株PC9GR HEK293t细胞 裸鼠皮下异种移植模型
吉非替尼耐药细胞系PC9GR的建立:0.01μM至10μM梯度诱导15个月 CEMIP过表达或敲低对吉非替尼IC50的影响 c-MYC调控CEMIP表达的双荧光素酶报告基因验证 CEMIP与c-MYC直接相互作用的结构域(1-177aa)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟临床中吉非替尼获得性耐药的发生过程,获得耐药细胞系。
将PC9细胞暴露于梯度浓度吉非替尼(从0.01μM递增至10μM),持续15个月,筛选获得耐药株PC9GR,并通过CCK-8、PI/DAPI染色、流式凋亡、Western blot及CETSA验证耐药特征。
验证CEMIP表达水平对吉非替尼敏感性和细胞增殖、迁移能力的影响。
在PC9细胞中过表达CEMIP(PC9 OE),在PC9GR细胞中敲低CEMIP(PC9GR shCEMIP),通过CCK-8、克隆形成、流式凋亡、Transwell和伤口愈合等实验检测细胞增殖、凋亡和迁移变化。
证明c-MYC是否转录调控CEMIP,以及CEMIP与c-MYC在耐药中的协同作用。
通过双荧光素酶报告基因实验验证c-MYC结合CEMIP启动子;在PC9 OE中敲低c-MYC,在PC9GR shCEMIP中过表达c-MYC,检测IC50、迁移和凋亡变化。
确定CEMIP与c-MYC的直接结合区域及其对蛋白稳定性的影响。
使用Co-IP实验检测内源及外源相互作用,通过截短体Co-IP确定结合域;使用CHX追踪实验检测蛋白半衰期;通过hDOCK蛋白质对接模拟预测结合界面。
检测CEMIP/c-MYC表达变化是否影响上皮间质转化标志物的表达。
通过qPCR和Western blot检测EMT标志物(E-cadherin、N-cadherin、Twist1、Vimentin)在PC9、PC9GR及其CEMIP/c-MYC修饰细胞中的表达。
在动物模型中验证CEMIP表达对肿瘤生长和吉非替尼疗效的影响。
将PC9GR shNC或shCEMIP细胞皮下接种至裸鼠,5天后给予吉非替尼(20mg/kg灌胃)或溶剂对照,监测肿瘤生长,并通过HE、IHC(Ki-67、CEMIP、c-MYC)、TUNEL染色分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 吉非替尼 | AladdinCo. | G125799 |
| 细胞增殖检测 | 细胞增殖毒性检测试剂盒 | DOJINDO | CK04 |
| 动物实验 | 基质胶 | BD | 356234 |
| 免疫印记 | Flag标签抗体 | Abmart | M20008S |
| 细胞凋亡检测 | 碘化丙啶 | Solarbio | C0080 |
| 细胞核染色 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Thermo Fischer | R37605 |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G磁性微珠 | MCE | HY-K0202 |
| 细胞染色 | 0.1%结晶紫 | Solarbio | G1063 |
| 蛋白印迹检测 | ECL显影液 | 4A BIOTECH | 4AW011 |
| 细胞转染 | 脂质体转染试剂2000 | Thermo Fischer | 52887 |
| 动物麻醉 | 异氟烷 | RWD Life Science | 2024031201 |
| 蛋白印迹 | CEMIP多克隆抗体(兔IgG) | ProteinTech | 31106-1-AP |
| 免疫共沉淀/免疫组化/免疫荧光 | CEMIP单克隆抗体(小鼠IgG) | Abmart | M018113S |
| 蛋白印迹 | β-肌动蛋白单克隆抗体(小鼠IgG) | ProteinTech | 66009-1-Ig |
| 蛋白印迹/免疫组化/免疫荧光 | c-MYC多克隆抗体(兔IgG) | ZEN-BIO | 343250 |
| 免疫共沉淀 | c-MYC单克隆抗体(小鼠IgG) | ProteinTech | 67447-1-Ig |
| 蛋白印迹 | E-钙黏蛋白多克隆抗体(兔IgG) | ProteinTech | 20874-1-AP |
| 波形蛋白单克隆抗体(小鼠IgG) | ProteinTech | 60330-1-Ig | |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG(H+L) | ProteinTech | SA00001-2 | |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗小鼠IgG(H+L) | ProteinTech | SA00001-1 | |
| EGFR单克隆抗体(小鼠IgG) | ProteinTech | 66455-1-Ig | |
| 磷酸化EGFR多克隆抗体(兔IgG) | Abcam | ab40815 | |
| 免疫组化 | Ki-67多克隆抗体(兔IgG) | ZSCB-BIO | 22051754 |
| 免疫荧光 | Cy5.5标记山羊抗兔IgG | Shangon | D110071 |
| Alexa 488标记山羊抗小鼠IgG | Shangon | D11061-0100 | |
| 免疫共沉淀 | 兔IgG | Beyotime | A7016 |
| 小鼠IgG | Beyotime | A7028 | |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Beyotime | C1091 |
| 组织消化 | 蛋白酶K | Beyotime | ST535 |
| RNA提取 | RNAiso Plus总RNA提取试剂 | TAKARA | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green荧光染料 | TAKARA | -- |
| 罗氏LightCycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 蛋白印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | 文中未明确说明 | -- |
| RIPA裂解液 | 文中未明确说明 | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | 文中未明确说明 | -- | |
| ECL底物 | Vazyme | E412 | |
| 天能Tanon 4600成像系统 | Tanon | -- | |
| 细胞增殖检测 | Synergy2酶标仪 | BioTek | -- |
| 流式分析 | GUAVA流式细胞仪 | Millipore | -- |
| 荧光显微 | EVOS Flt荧光显微镜 | Life | -- |
| 细胞计数 | 400目尼龙筛网 | 文中未明确说明 | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 动物实验 | R500小动物麻醉机 | RWD Life Science | R500IP |
| 组织染色 | 伊红 | 文中未明确说明 | -- |
| 免疫组化 | 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 耐药细胞系建立 | 吉非替尼浓度梯度(0.01-10μM)、诱导时间(15个月)、培养条件和IC50评估方法 阅读提示:Methods 2.3节 |
| 细胞增殖和活性检测 | 细胞接种密度(5×10^3细胞/孔)、吉非替尼浓度范围(0-50μM)、处理时间(24,48,72h)、CCK-8工作浓度(10%) 阅读提示:Methods 2.4节 |
| 细胞凋亡检测 | 吉非替尼浓度(PC9:0.02μM,PC9GR:10μM)、处理时间(48h)、染色条件(Annexin V-APC/7-AAD) 阅读提示:Methods 2.5节 |
| CEMIP稳定过表达或敲低 | 慢病毒载体(OE-CEMIP或shCEMIP)、筛选药物(Blasticidin 10μg/mL或Puromycin 5μg/mL)、筛选时间(14天) 阅读提示:Methods 2.8节 |
| c-MYC转染 | siRNA或质粒量(siRNA 2.5μg)、Lipofectamine 2000用量(5μL)、转染时间(48h) 阅读提示:Methods 2.8节 |
| 蛋白互作验证 | Co-IP抗体(抗CEMIP、c-MYC、Flag)、磁珠用量(30μL)、蛋白量(300μg) 阅读提示:Methods 2.15节 |
| 蛋白半衰期检测 | CHX浓度(75μg/mL)、样本收集时间点(0,10,30,45,60min)、蛋白提取条件 阅读提示:Methods 2.16节 |
| 双荧光素酶报告基因 | 报告基因载体(pMIR-REPORT-CEMIP-WT/MUT)、细胞系(HEK293t)、转染试剂(Lipofectamine 2000) 阅读提示:Methods 2.17节 |
| 体内异种移植实验 | 细胞接种量(1×10^6)、Matrigel与细胞混合比例、吉非替尼给药剂量(20mg/kg)和途径(口服灌胃)、给药起始时间(接种后5天) 阅读提示:Methods 2.18节 |