建立体外铁死亡模型并检测HSPA4表达
观察HSPA4在铁死亡过程中的表达变化,以探究其潜在相关性。
用不同浓度erastin处理SH-SY5Y细胞,通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测HSPA4的mRNA和蛋白水平。
HSPA4 restrains transferrin in dopaminergic neurons to attenuate ferroptosis in a Parkinson's disease model.
包含体外细胞实验(SH-SY5Y、原代神经元)和体内动物模型(MPTP诱导PD小鼠),并进行功能验证(过表达/敲低)和机制验证(pull-down、co-IP、docking等)。
SH-SY5Y细胞 原代多巴胺能神经元 MPTP诱导的PD模型小鼠
HSPA4过表达和敲低后,在erastin诱导的铁死亡模型中对细胞活力、LDH释放和铁死亡标志物的影响 HSPA4与转铁蛋白的相互作用及对转铁蛋白分泌和细胞内铁水平的影响 AAV-HSPA4在SNpc的注射量、时间及MPTP处理剂量和时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察HSPA4在铁死亡过程中的表达变化,以探究其潜在相关性。
用不同浓度erastin处理SH-SY5Y细胞,通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测HSPA4的mRNA和蛋白水平。
验证HSPA4过表达是否能减轻erastin诱导的铁死亡。
用质粒过表达Hspa4后,用erastin处理,检测细胞活力、LDH释放、线粒体膜电位、线粒体氧化应激、脂质ROS、GSH、MDA、Fe2+水平及GPX4、FTH1、xCT蛋白水平。
验证HSPA4敲低是否加剧erastin诱导的铁死亡。
用siRNA敲低Hspa4后,用erastin处理,检测细胞活力、LDH释放、线粒体膜电位、脂质ROS、GSH、MDA、Fe2+水平及GPX4、FTH1、xCT蛋白水平。
验证HSPA4在体内是否改善PD症状并减轻铁死亡。
通过立体定位注射AAV-HSPA4到SNpc,然后MPTP处理诱导PD,进行行为学测试(rotarod、pole、traction、嗅觉测试)、TH染色、铁死亡相关蛋白检测、普鲁士蓝染色、电镜观察线粒体、胶质细胞激活检测。
阐明HSPA4抗铁死亡的分子机制。
通过SP-tag pull-down和LC-MS/MS鉴定HSPA4相互作用蛋白,用蛋白质对接分析预测结合,用pull-down和co-IP验证相互作用,用免疫荧光检测共定位,并检测HSPA4对转铁蛋白分泌和细胞内铁水平的影响。
排除HSPA4通过其他途径影响铁摄取的可能性。
检测转铁蛋白受体表达,以及外源holo-transferrin对细胞活力的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965084 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 药物处理 | Erastin | MCE | HY-15763 |
| 细胞培养 | 全转铁蛋白 | Sigma-Aldrich | 11096-37-0 |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX | ThermoFisher Scientific | 13778030 |
| 原代神经元培养 | 胰蛋白酶 | Sigma-Aldrich | 9002-07-7 |
| 多聚赖氨酸 | Sigma-Aldrich | 25988-63-0 | |
| Neurobasal培养基 | Gibco | 2916968 | |
| NeuroCult SM1神经元添加剂 | STEMCELL | 05711 | |
| 原代神经元转染 | NEPA21电转仪 | NEPA GENE | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| qRT-PCR | Prime Script RT预混液 | Bio-Rad | RR036A |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFisher Scientific | 23225 |
| PVDF膜 | Merck | IPVH00010 | |
| 抗FTH1抗体 | Cell Signaling Technology | 4393 | |
| 抗GPX4抗体 | Cell Signaling Technology | 59735 | |
| 抗xCT抗体 | Cell Signaling Technology | 29650 | |
| 抗HSPA4抗体 | Proteintech | 21206-1-AP | |
| 抗转铁蛋白受体抗体 | Cell Signaling Technology | 13113 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-1g | |
| ECL底物检测试剂盒 | Elabscience | E-IR-R308 | |
| LDH检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染色试剂盒 | Beyotime | C2006 |
| 线粒体氧化应激分析 | Lipo8000转染试剂 | Beyotime | C0533 |
| ROS检测 | BODIPY (581/591) C11检测试剂盒 | Beyotime | S0043S |
| GSH检测 | 谷胱甘肽检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A006-2-1 |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A003-4-1 |
| Fe2+检测 | 铁检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M |
| 动物实验 | MPTP | Sigma-Aldrich | M0896 |
| AAV-HSPA4 | Obio Technology | -- | |
| 行为学测试 | 转棒仪 | Panlab | LE8500 |
| 免疫荧光 | 抗TH抗体 | Abcam | ab6211 |
| 抗GFAP抗体 | Abcam | ab7260 | |
| 抗Iba-1抗体 | Abcam | ab5076 | |
| 二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| DAPI | Beyotime | P0131 | |
| 普鲁士蓝染色 | 普鲁士蓝染色试剂盒 | Solarbio | G1428 |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | mlBio | ml098415 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | mlBio | ml066159 | |
| 小鼠IL-8 ELISA试剂盒 | mlBio | ml063162 | |
| 转染 | Lipofectamine转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| pull-down | S蛋白琼脂糖 | Novagen | 3226253 |
| SDS-PAGE | 考马斯亮蓝染料 | Beyotime | P0017 |
| LC-MS/MS | 胰蛋白酶 | Promega | V5111 |
| C18固相萃取柱 | Sigma | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | Millipore | 16-156 |
| 抗轻链特异性抗体 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-174 | |
| 转铁蛋白检测 | 转铁蛋白ELISA试剂盒 | MultiScience | EK1201 |
| Amicon Ultra-0.5离心过滤器 | Merck | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | SH-SY5Y细胞系来源(ATCC)、培养条件(DMEM+10%FBS+1%PS)、erastin浓度(5 μM)和处理时间(24小时)、HSPA4过表达质粒浓度(1 μg)和转染时间(24小时)、siRNA转染时间(48小时) 阅读提示:Methods: Cell culture, transfection and treatments |
| 原代神经元培养 | 胚胎大鼠(E14-18)、解剖区域(SNpc和纹状体)、胰蛋白酶消化时间(7分钟)、poly-L-lysine包被浓度(0.1 mg/mL)、Neurobasal培养基和添加剂、电穿孔转染条件 阅读提示:Methods: Culture of primary dopaminergic neurons |
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6)、年龄(10月龄)、性别(雄性)、AAV立体定位注射坐标(AP: -3.2 mm, ML: -1.3 mm, DV: -4.3 mm)、AAV注射量(1 μl)和时间(28天)、MPTP剂量(20 mg/kg/day)和给药方式(腹腔注射)持续时间(7天) 阅读提示:Methods: Mice |
| 行为学测试 | rotarod测试加速模式(4-40 rpm)和时间(5分钟)、pole test的杆尺寸(直径16mm,高60cm)、嗅觉测试禁食时间(20小时)和寻找时间限制(5分钟)、traction test的评分标准 阅读提示:Methods: Behavioral tests |
| 机制验证 | HSPA4 pull-down的细胞系(SH-SY5Y)、SP-tag质粒、转染时间(24小时)、LC-MS/MS分析条件、co-IP抗体(anti-HSPA4)和用量(1 μg)、转铁蛋白ELISA试剂盒 阅读提示:Methods: HSPA4 pull-down, LC-MS/MS analysis, Co-immunoprecipitation, Transferrin assay |