患者微生物组分析
比较良性子宫疾病、子宫内膜增生和EC患者的子宫内膜、宫颈和阴道微生物组成及多样性差异。
收集10例良性子宫疾病、10例子宫内膜增生和10例EC患者的子宫、宫颈和阴道分泌物样本,提取DNA后进行16S rRNA基因测序,分析α多样性和β多样性,并比较各组微生物组成。
Atopobium vaginae advances endometrial cancer growth via macrophage function in mouse models.
研究包含患者样本16S测序、细胞共培养功能实验、ELISA检测及小鼠体内肿瘤模型,并进行了功能验证和机制验证。
EC患者子宫内膜和血液样本 KLE细胞系 ARK1细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
患者样本分组:良性子宫疾病、子宫内膜增生、EC,每组各10例 细胞实验:KLE或ARK1细胞与Atopobium vaginae共培养,再与THP-1来源巨噬细胞共培养,检测吞噬和M2极化 动物实验:BALB/c裸鼠皮下注射KLE细胞(2×10^6),分成Atopobium vaginae处理组和PBS对照组,每组6只 Atopobium vaginae处理:热灭活细菌(OD600=1),每次100 μL,每周3次,接种于肿瘤附近 检测指标:肿瘤体积(第10、14、18天)、巨噬细胞M2比例、IL-6和IL-10水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较良性子宫疾病、子宫内膜增生和EC患者的子宫内膜、宫颈和阴道微生物组成及多样性差异。
收集10例良性子宫疾病、10例子宫内膜增生和10例EC患者的子宫、宫颈和阴道分泌物样本,提取DNA后进行16S rRNA基因测序,分析α多样性和β多样性,并比较各组微生物组成。
评估不同疾病状态下患者血液中炎症因子IL-6和IL-10的表达水平。
采集患者血液样本,使用ELISA检测IL-6和IL-10的表达水平,比较良性、增生和EC组之间的差异。
验证Atopobium vaginae对巨噬细胞吞噬功能和极化的直接影响。
将热灭活的Atopobium vaginae与CFSE标记的KLE或ARK1细胞共孵育,再加入THP-1来源的巨噬细胞,通过流式细胞术检测吞噬率、M2极化比例,并通过ELISA检测上清中IL-6和IL-10水平。
在体内验证Atopobium vaginae对子宫内膜癌进展的影响。
BALB/c裸鼠皮下接种KLE细胞建立肿瘤模型,随机分为Atopobium vaginae处理组和PBS对照组,按计划注射热灭活菌液,定期测量肿瘤体积,并通过流式细胞术和ELISA检测巨噬细胞极化和炎症因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式细胞术 | FITC抗小鼠/人CD11b抗体(M1/70) | Elabscience | E-AB-F1081C |
| PE抗小鼠CD86(GL-1) | Elabscience | E-AB-F0994D | |
| PE抗人CD86(BU63) | Elabscience | E-AB-F1012D | |
| APC抗小鼠CD206(C068C2) | Elabscience | E-AB-F1135E | |
| APC抗人CD206(15-2) | Elabscience | E-AB-F1161E | |
| 细菌培养 | 脱纤维羊血 | Dalynn Biologicals | -- |
| 细菌灭活 | IMDM培养基 | ATCC | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 16S-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript逆转录试剂 | TaKaRa | -- | |
| ABI 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | ATCC | -- |
| RPMI培养基 | -- | -- | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | -- | -- | |
| 吞噬实验 | CFSE | Yeasen | -- |
| PerCP抗人CD11b | Elabscience | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | 样本量:每组10例;分组:良性子宫疾病、子宫内膜增生、EC;采样部位:子宫腔、宫颈、阴道;患者筛选标准:年龄≥18岁,无放疗化疗史,子宫完整,近2周未使用抗生素 阅读提示:见STAR★Methods的Study population和Sample collection |
| 细胞共培养 | 细胞系:KLE和ARK1;细菌:热灭活Atopobium vaginae 2×10^8 CFU;肿瘤细胞:2×10^6 CFSE标记;巨噬细胞:THP-1来源,2×10^6;共孵育时间:各2小时 阅读提示:见STAR★Methods的Measurement of macrophage engulfment activity |
| 小鼠肿瘤模型 | 小鼠品系:BALB/c裸鼠(雌性,10周龄);细胞注射:2×10^6 KLE细胞,两个位点;治疗:100 μL热灭活菌(OD600=1),每周3次;测量时间:第10、14、18天 阅读提示:见STAR★Methods的Development of mouse tumor model |
| 巨噬细胞极化检测 | 流式抗体:CD11b-FITC, CD86-PE, CD206-APC;M1标记:CD86;M2标记:CD206 阅读提示:见STAR★Methods的Flow cytometry detection of macrophage polarization |
| 炎症因子检测 | ELISA检测IL-6和IL-10;样本:患者血清、小鼠血清、共培养上清 阅读提示:见STAR★Methods的Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) |