结直肠癌肠道微生物群和短链脂肪酸的研究及生物标志物的检测

结直肠癌（CRC）是全球最常见的癌症之一，也是一个重大的全球健康问题。人类肠道微生物群是一个复杂的生态系统，容纳着细菌、病毒、真菌和原生动物等多种微生物，发挥着至关重要的作用。越来越多的证据表明，肠道微生物群参与CRC的发病机制。本研究分析了新诊断的CRC患者和健康对照者的肠道微生物群谱、短链脂肪酸、连蛋白和脂多糖结合蛋白水平，以阐明CRC与肠道微生物群之间的关系。该研究包括16名新诊断的CRC患者和16名健康个体。对于微生物群分析，使用Quick-DNA™ Fecal/Soil Microbe Miniprep Kit从粪便样本中提取DNA，然后使用MinION设备进行测序。数据处理使用Guppy软件（版本6.5.7）和Python（3.12）编程语言进行。使用Elabscience的ELISA试剂盒分析LBP和连蛋白血清水平。使用配备火焰离子化检测器和DB-FFAP柱的GC-MS/MS分析粪便短链脂肪酸。使用Shannon和Simpson指数评估的微生物α多样性在CRC患者中低于健康对照（p = 0.045, 0.017）。两组之间的微生物β多样性存在显著差异（p = 0.004）。在门水平上，Bacteroidota在CRC患者中减少（p = 0.027）。潜在生物标志物候选包括Enterococcus faecium, Ruminococcus bicirculans, Enterococcus gilvus, Enterococcus casseliflavus, Segatella oris和Akkermansia muciniphila。CRC患者的血清连蛋白水平较高（CRC = 70.1 ± 26.14, Control = 53.93 ± 17.33, p = 0.048）。肠道微生物群与CRC之间存在显著关系。对这种关系的多因素评估可能为潜在的生物标志物鉴定和CRC新治疗方案的开发提供线索。