谷氨酰胺剥夺诱导铁死亡抵抗和EMT
验证谷氨酰胺剥夺是否使TNBC细胞获得铁死亡抵抗并发生EMT。
将TNBC细胞(MDA-MB-231、4T-1)在无谷氨酰胺培养基中培养2-3天,检测铁死亡诱导剂(RSL3、Erastin)的细胞毒性,并通过Western blot检测EMT标志物(E-cadherin、Snail)表达。
Glutamine synthetase shields triple-negative breast cancer cells from ferroptosis in metastasis triggered by glutamine deprivation.
包括体外细胞实验(GS敲低/过表达、铁死亡诱导剂处理)、转录组学与蛋白质组学分析、体内肺转移小鼠模型及患者样本分析。
MDA-MB-231细胞 4T-1细胞 BALB/c小鼠肺转移模型 乳腺癌患者组织样本
谷氨酰胺剥夺时间(2-3天) GS siRNA转染浓度(30 nM)及敲低效果 铁死亡诱导剂(RSL3、Erastin)剂量及处理时间 小鼠模型中4T-1细胞注射量(5×10^5)及分组(Gln+, Gln-, GS siRNA+Gln-) 青蒿琥酯给药剂量(400 mg/kg)及方式(灌胃)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证谷氨酰胺剥夺是否使TNBC细胞获得铁死亡抵抗并发生EMT。
将TNBC细胞(MDA-MB-231、4T-1)在无谷氨酰胺培养基中培养2-3天,检测铁死亡诱导剂(RSL3、Erastin)的细胞毒性,并通过Western blot检测EMT标志物(E-cadherin、Snail)表达。
确定GS在谷氨酰胺剥夺条件下对铁死亡敏感性的作用。
通过siRNA敲低GS表达,或使用GS抑制剂MSO处理,检测GS蛋白表达变化及铁死亡诱导剂处理后的细胞活力。
评估GS在体内对TNBC细胞肺转移能力的作用。
将GFP标记的4T-1细胞(5×10^5)尾静脉注射入BALB/c小鼠,分为Gln+、Gln-、GS siRNA+Gln-组,通过活体成像和HE染色观察肺转移结节。
识别GS在谷氨酰胺剥夺条件下调控的基因和信号通路。
对MDA-MB-231细胞进行RNA-seq,比较不同谷氨酰胺剥夺时间及GS敲低条件下的基因表达差异,并进行GO和GSEA富集分析。
验证GS通过ATF4-NUPR1-LCN2通路和TFRC调节铁代谢。
通过qPCR和Western blot检测ATF4、NUPR1、LCN2、TFRC的表达变化,并在GS敲低或过表达情况下观察其变化。
探究mTORC1信号通路在GS介导的铁死亡抵抗和EMT中的作用。
使用雷帕霉素抑制mTORC1,观察GS诱导的EMT、迁移和铁死亡抵抗的变化,并检测SREBP1/SCD1和LCN2/TFRC的表达。
评估青蒿素衍生物是否通过诱导铁死亡抑制GS介导的转移。
在体外用DHA处理谷氨酰胺剥夺的TNBC细胞,检测GS表达、EMT和迁移;在体内用青蒿琥酯处理小鼠,观察肺转移结节数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | BI | -- |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 谷氨酰胺剥夺 | 无谷氨酰胺1640培养基 | Gibco | -- |
| 谷氨酰胺定量 | 谷氨酰胺比色法检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 质粒转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000008 |
| 质粒提取 | 无内毒素中提试剂盒 | CWBIO | CW21055 |
| 质粒定量 | Nanodrop One微量分光光度计 | Thermo Fisher | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| DNase I | TaKara Bio | #2270A | |
| cDNA合成 | SuperScript双链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | #11917001 |
| 转录组测序 | Illumina HiSeq xten/NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 脂质ROS检测 | C11-BODIPY探针 | Invitrogen | D3861 |
| 细胞培养 | LB培养基 | -- | -- |
| 药物处理 | 青蒿琥酯 | -- | -- |
| 铁死亡诱导 | RSL3 | -- | -- |
| Erastin | -- | -- | |
| FINO2 | -- | -- | |
| 抑制剂 | 雷帕霉素 | -- | -- |
| 甲硫氨酸亚砜亚胺 | -- | -- | |
| 抗氧化剂 | Liproxstatin-1 | -- | -- |
| 凋亡检测 | CCK-8检测试剂盒 | -- | -- |
| Western blot | 一抗 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与谷氨酰胺剥夺 | 细胞系来源和培养条件(RPMI 1640 + 10% FBS);谷氨酰胺剥夺时间(2-3天);培养基更换频率(每日) 阅读提示:Methods: Cell culture; Gln deprivation and measurements |
| siRNA转染 | siRNA序列(Table S1和S2);转染浓度(30 nM);转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX)和转染时间(6-8小时) 阅读提示:Methods: Small interference RNA transfection |
| 铁死亡诱导和检测 | 铁死亡诱导剂(RSL3、Erastin)剂量和时间;C11-BODIPY探针浓度和孵育时间;GSH/GSSG检测方法 阅读提示:Methods: Cell death and viability, western blotting...; Reactive oxygen species (ROS) and GSH measurement |
| 体内肺转移模型 | 小鼠品系、性别和年龄(雌性BALB/c,4-6周龄);细胞注射量(5×10^5);分组(Gln+、Gln-、GS siRNA+Gln-);转移结节计数方法 阅读提示:Methods: Animal studies |
| 青蒿琥酯治疗 | 给药剂量(400 mg/kg)、途径(灌胃)和疗程(三天);对照组(PBS) 阅读提示:Methods: Animal studies |