数据库分析与通路筛选
筛选GDM相关基因并识别关键信号通路。
通过CTD、DisGeNet、GeneCards数据库获取GDM相关基因,经jvenn分析取交集,得到INSR、PPARG、SLC2A4、TNF和LEPR五个基因;利用STRING数据库进行KEGG通路富集分析。
Enhanced SLC2A4 expression mitigates insulin resistance in gestational diabetes mellitus via the FoxO signaling pathway in vitro.
包含体外细胞模型(HTR-8/SVneo)的功能验证(转染、葡萄糖摄取、细胞活力)和机制验证(FoxO通路蛋白检测),但缺乏动物或临床样本验证。
HTR-8/SVneo滋养层细胞(高糖诱导的GDM体外模型)
细胞系:HTR-8/SVneo(来源:Honorgene) 高糖处理:25 mM葡萄糖,24小时 转染质粒:pc-SLC2A4和pc-FoxO1(浓度5 μg/ml,使用Lipofectamine™ 2000,比例1:2.5,转染24小时) 检测终点:RT-qPCR和Western blot检测SLC2A4、INS、INSR、FoxO1、FoxO3a表达;葡萄糖摄取实验;CCK-8细胞活力 实验分组:Control、HG、HG+pc-NC、HG+pc-SLC2A4、HG+pc-SLC2A4+pc-FoxO1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选GDM相关基因并识别关键信号通路。
通过CTD、DisGeNet、GeneCards数据库获取GDM相关基因,经jvenn分析取交集,得到INSR、PPARG、SLC2A4、TNF和LEPR五个基因;利用STRING数据库进行KEGG通路富集分析。
模拟GDM的高糖环境,评估细胞应激和SLC2A4表达变化。
HTR-8/SVneo细胞在含25mM葡萄糖的RPMI-1640培养基中培养24小时,对照组含5mM葡萄糖;检测LDH水平评估细胞应激,并通过RT-qPCR和Western blot检测SLC2A4表达。
验证SLC2A4过表达是否改善高糖诱导的INS信号受损和细胞功能障碍。
转染pc-SLC2A4或pc-NC至高糖处理的HTR-8/SVneo细胞,通过RT-qPCR和Western blot检测SLC2A4、INS、INSR表达,并检测葡萄糖摄取和细胞活力。
探究SLC2A4过表达是否通过抑制FoxO信号通路发挥作用。
在SLC2A4过表达基础上共转染pc-FoxO1,检测FoxO1、FoxO3a及其磷酸化水平,以及INS、INSR表达、葡萄糖摄取和细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| 胎牛血清 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| HTR-8/SVneo细胞系 | Honorgene (Changsha Abiwei Biotechnology Co., Ltd.) | -- | |
| 转染 | pcDNA3.1载体 | Anhui General Bio Co., Ltd. | -- |
| Lipofectamine® 2000 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| LDH检测 | LDH检测缓冲液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| LDH检测试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | C0016 | |
| 葡萄糖摄取实验 | 葡萄糖摄取荧光检测试剂盒 | Elabscience® | E-BC-F041 |
| 细胞活力 | 细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| RNA提取和RT-qPCR | Trizol试剂 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| RT-qPCR | BeyoRT™II第一链cDNA合成试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | D7168S |
| ABI 7900 RT-qPCR系统 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| PVDF膜 | Sigma-Aldrich; Merck KGaA | ISEQ00010 | |
| Pierce无蛋白封闭缓冲液 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 37573 | |
| SLC2A4抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 2213S | |
| INSR抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 3025S | |
| INS抗体 | Abcam | ab181547 | |
| 磷酸化FoxO1抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 9461S | |
| FoxO1抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 2880S | |
| 磷酸化FoxO3a抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 13129S | |
| FoxO3a抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 12829S | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | 97166 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0208 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0216 | |
| SignalFire Plus ECL试剂 | Cell Signaling Technology, Inc. | 12630S | |
| 数据分析 | SPSS软件 | IBM Corp. | -- |
| ImageJ V1.8.0软件 | National Institutes of Health | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与高糖处理 | 细胞系来源;培养基成分(RPMI-1640+5%FBS);高糖浓度(25 mM)和处理时间(24小时);对照组葡萄糖浓度(5 mM) 阅读提示:见Materials and methods中的Cell culture and treatment |
| 转染 | 质粒构建(pc-SLC2A4、pc-FoxO1、pc-NC)基于pcDNA3.1;质粒浓度(5 μg/ml);转染试剂(Lipofectamine® 2000)与质粒比例(1:2.5);转染时间(24小时);转染效率验证见Fig. S1 阅读提示:见Materials and methods中的Cell culture and treatment和Supplementary Material |
| 分子表达检测 | RT-qPCR引物序列;PCR条件(94℃20秒、55℃20秒、72℃20秒,40循环);Western blot抗体及稀释比例(1:1000)、蛋白上样量(60 μg)、内参(GAPDH) 阅读提示:见Materials and methods中的RT-qPCR和Western blotting |
| 功能检测 | 葡萄糖摄取实验:细胞密度(2000细胞/孔)、饥饿处理(无血清过夜)、2-DG浓度(10 mmol/l)、孵育时间(30分钟);CCK-8实验:细胞密度(1x10^4细胞/孔) 阅读提示:见Materials and methods中的Glucose uptake assay和Cell viability |