网络药理学靶点预测与富集分析
预测OMT治疗CPSP的潜在靶点和主要生物过程。
通过公共数据库(SwissTargetPrediction、SuperPred、BATMAN-TCM、GeneCards、OMIM)获取OMT和CPSP靶点,取交集后使用STRING构建PPI网络,使用DAVID进行GO富集分析。
Oxymatrine Alleviates Central Post-Stroke Pain in Rats by Reducing the Inflammatory Response.
包含网络药理学预测、行为学测试、ELISA和免疫荧光等实验,但缺乏功能验证和基因操作。
雄性SD大鼠CPSP模型 VPL注射IV型胶原酶诱导的丘脑出血模型
IV型胶原酶剂量:0.025 U/0.25 μL OMT给药剂量:100、200、400 mg/kg OMT给予时间:术后第7天至第14天 PWMT测量时间:给药后每30分钟,持续至270分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
预测OMT治疗CPSP的潜在靶点和主要生物过程。
通过公共数据库(SwissTargetPrediction、SuperPred、BATMAN-TCM、GeneCards、OMIM)获取OMT和CPSP靶点,取交集后使用STRING构建PPI网络,使用DAVID进行GO富集分析。
通过VPL注射IV型胶原酶诱导丘脑出血模型,模拟CPSP。
SD大鼠麻醉后固定于脑立体定位仪,在特定坐标注射IV型胶原酶或生理盐水。
评估CPSP模型和OMT治疗后的机械痛阈值变化。
使用Von Frey纤维丝测定缩爪机械阈值。
验证CPSP模型是否成功建立,观察丘脑损伤。
术后第7天取脑组织,固定、包埋、切片、HE染色,在光镜下观察。
检测丘脑周围炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)的表达水平。
收集丘脑组织,匀浆后离心,用ELISA试剂盒测定。
检测小胶质细胞和星形胶质细胞在丘脑周围的激活情况。
脑组织切片与GFAP、IBA-1、NeuN抗体孵育,荧光显微镜观察,ImageJ定量阳性面积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 氧化苦参碱 | Gelipu Biotechnology Company, Chengdu | -- |
| 模型建立 | IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| ELISA | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R0015c | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R2856c | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R0012c | |
| 免疫荧光 | 抗GFAP抗体 | Cell Signaling Technology | #34001S |
| 抗IBA-1抗体 | Cell Signaling Technology | #17198 | |
| 抗NeuN抗体 | -- | ab177487 | |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG二抗 | Proteintech | SA00009-2 | |
| 组织病理学 | Nikon Eclipse Ci-L光学显微镜 | Nikon | -- |
| 免疫荧光 | Olympus FV1000共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 大鼠品系、周龄、体重、麻醉剂量、注射坐标、胶原酶剂量和注射体积 阅读提示:Materials and Methods: Preparation of the CPSP Animal Model; Figure 1 |
| 药物处理 | OMT剂量、给药途径、给药时间窗(术后第7至14天) 阅读提示:Materials and Methods: Experimental Design and Drug Administration; Figure 1 |
| 行为学测试 | Von Frey细丝强度范围、测试时间、阳性反应定义、阈值计算方式 阅读提示:Materials and Methods: Mechanical Pain Sensitivity Testing; Figure 5 |
| ELISA检测 | 组织来源、匀浆方法、BCA定量、所用ELISA试剂盒品牌及货号 阅读提示:Materials and Methods: ELISA; Figure 6 |
| 免疫荧光检测 | 切片厚度、抗体稀释比例、孵育条件、图像采集与分析参数 阅读提示:Materials and Methods: Immunofluorescence; Figure 7 |