TSAC化学成分鉴定
鉴定TSAC中的化学成分和入血原型成分。
采用UPLC-Q Exactive Orbitrap-MS分析TSAC,并通过血清药物化学方法在大鼠血清中鉴定入血原型化合物。
Unlocking the Anti-Breast Cancer Potential of Aralia chinensis L.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、基因和蛋白表达)及分子对接和网络药理学分析,但缺乏动物体内药效学和机制验证。
MCF-7乳腺癌细胞系 Sprague Dawley大鼠模型
TSAC给药剂量:3.6 g/kg体重,每天两次,连续4天 MCF-7细胞处理浓度:0-0.5 mg/mL,处理24和48小时 RT-qPCR和Western blot验证:SRC、PIK3CA、EGFR基因和蛋白表达 分子对接验证:araloside A和elatoside L与SRC、PIK3R1、PIK3CA、STAT3、EGFR的结合能量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定TSAC中的化学成分和入血原型成分。
采用UPLC-Q Exactive Orbitrap-MS分析TSAC,并通过血清药物化学方法在大鼠血清中鉴定入血原型化合物。
预测入血原型成分的靶点及相关通路。
利用SwissTargetPrediction预测22个入血成分的靶点,与乳腺癌相关基因取交集,进行GO和KEGG富集分析,构建PPI网络。
验证核心靶点与入血成分的结合亲和力。
使用Schrödinger软件将22个入血成分与SRC、PIK3R1、PIK3CA、STAT3、EGFR进行分子对接,计算结合能。
评估TSAC对乳腺癌细胞增殖、迁移的影响。
使用CCK-8实验检测细胞活力,克隆形成实验检测增殖,划痕实验检测迁移。
验证TSAC对关键靶点基因和蛋白表达的影响。
RT-qPCR检测SRC、PIK3CA、EGFR的mRNA表达,Western blot检测Src、PI3K、EGFR的蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样品制备 | AB-8大孔吸附树脂 | -- | -- |
| 化学成分分析 | ACQUITY UPLC I-Class plus超高效液相色谱系统 | Waters | -- |
| Q Exactive Orbitrap质谱仪 | Thermo | -- | |
| ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| 细胞培养 | MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Fuheng Biotechnology | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | MedChemExpress | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Servicebio | -- |
| 氯仿 | Sinopharm | -- | |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| FastStart Universal SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| SLAN实时荧光定量PCR系统 | Hongshitech | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | -- | |
| PVDF膜 | Merck | -- | |
| Src抗体 | Proteintech | 60315-1-Ig | |
| PI3K抗体 | Proteintech | 82796-4-RR | |
| EGFR抗体 | Proteintech | 66455-1-Ig | |
| β-Actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Elabscience | E-AB-1003 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | Elabscience | E-AB-1001 | |
| 增强化学发光试剂盒 | -- | -- | |
| ChemiDoc数字凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 分子对接 | PyMOL软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物给药与血清采集 | 大鼠品系、性别、周龄、体重;TSAC给药剂量(3.6 g/kg)、给药频率(每天两次)、给药天数(4天);采血时间点(0.5、1、1.5、2、3、4、5、6小时) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.4和2.5节 |
| 细胞培养与处理 | 细胞系(MCF-7);培养条件(MEM+10%FBS+1%青霉素/链霉素);TSAC处理浓度(0-0.5 mg/mL)和处理时间(24/48小时) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.9.1和2.9.2节 |
| 基因表达检测 | TSAC处理浓度(0、0.3、0.4 mg/mL)和处理时间(24小时);引物序列(见表1);RT-qPCR内参基因(β-actin) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.10节和Table 1 |
| 蛋白表达检测 | TSAC处理浓度(0、0.3、0.4 mg/mL)和处理时间(24小时);抗体稀释比例和货号 阅读提示:参见Materials and Methods 2.11节 |