体外细胞活力与死亡检测
评估DHA和EPA对胃和小肠上皮细胞在常氧和缺氧下的活力影响
NGEC和HIEC在常氧或缺氧条件下培养,给予DMSO或不同浓度DHA/EPA,通过结晶紫染色、CCK-8和台盼蓝染色检测细胞活力和死亡。
DHA and EPA exacerbate hypoxia-induced ferroptosis in gastric and small intestinal mucosa by disrupting the balance between SLC7A11 upregulation and PUFA-PL accumulation.
包含体外细胞实验、体内小鼠模型、脂质组学分析及机制验证(cAMP/PKA/ATF3通路),多层级证据支持结论。
正常人胃上皮细胞系(NGEC) 正常人小肠上皮细胞系(HIEC) C57BL/6J小鼠缺氧模型
细胞系为NGEC和HIEC,来源Otwo Biotech 缺氧条件为1% O2,处理24小时 DHA和EPA浓度(1-50 μM)及体内剂量(50 mg/kg) 铁死亡抑制剂Fer-1(5 μM)和Lip-1(1 μM)使用 缺氧处理时间(24小时体外,3天体内)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估DHA和EPA对胃和小肠上皮细胞在常氧和缺氧下的活力影响
NGEC和HIEC在常氧或缺氧条件下培养,给予DMSO或不同浓度DHA/EPA,通过结晶紫染色、CCK-8和台盼蓝染色检测细胞活力和死亡。
确认DHA和EPA加剧的细胞死亡是否由铁死亡介导
使用铁死亡抑制剂Fer-1和Lip-1处理细胞,检测细胞活力和死亡恢复情况,并通过4-HNE、MDA定量和TEM观察线粒体形态验证铁死亡特征。
探究DHA和EPA上调SLC7A11的分子通路
通过Western blot检测SLC7A11、ATF3等蛋白表达,ELISA检测cAMP水平和PKA活性,使用PKA抑制剂H89和ATF3过表达验证通路。
分析DHA和EPA对PUFA-PL种类和水平的影响
对HIEC进行脂质组学分析,比较常氧和缺氧下DHA/EPA处理对PUFA-PC、PI、PE、PS、PG水平的影响。
验证DHA和EPA对缺氧小鼠胃肠黏膜铁死亡的影响
C57BL/6J小鼠在缺氧舱中暴露3天,饲喂DHA/EPA,评估体重、食物摄入、粪便性状、胃肠道形态、组织学、TEM、LPO和4-HNE等指标。
排除坏死和凋亡,确认铁死亡是主要死亡方式
使用Nec-1和Z-VAD处理细胞,检测细胞死亡是否逆转,并检测凋亡坏死标志物;体内使用Fer-1验证铁死亡依赖性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Corning | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Corning | -- | |
| 低氧培养箱 | NAWORDE | GC-C01 | |
| 药物处理 | 二十二碳六烯酸 | MedChemExpress | HY-B2167 |
| 二十碳五烯酸 | MedChemExpress | HY-B0660 | |
| 玉米油 | MedChemExpress | HY-Y1888 | |
| Ferrostatin-1 | MedChemExpress | HY-100579 | |
| Liproxstatin-1 | MedChemExpress | HY-12726 | |
| Z-VAD-FMK | MedChemExpress | HY-16658B | |
| Necrostatin-1 | MedChemExpress | HY-15760 | |
| H-89 | MedChemExpress | HY-15979 | |
| 齐留通 | MedChemExpress | HY-14164 | |
| GLX351322 | MedChemExpress | HY-100111 | |
| FITC-葡聚糖 | MedChemExpress | HY-128868E | |
| HG106 | Selleck | E1080 | |
| Erastin | Selleck | S7242 | |
| 细胞染色 | 结晶紫溶液 | Beyotime Biotechnology | C0121 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Dojindo Laboratories | CK04 |
| 细胞死亡检测 | 台盼蓝溶液 | Beyotime Biotechnology | C1313S |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白质定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ELISA | cAMP试剂盒 | Abclonal | RK04812 |
| PKA活性试剂盒 | Abcam | ab139435 | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab222503 | |
| 脂质过氧化检测 | 4-HNE检测试剂盒 | Elabscience | E-EL-0128c |
| MDA检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K028-M | |
| LPO检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K176-M | |
| Western blot | SLC7A11抗体 | Abcam | ab307601 |
| HIF-1α抗体 | Abcam | ab179483 | |
| ATF3抗体 | HUABIO | ER1903-99 | |
| NOX4抗体 | ABclonal | A22149 | |
| ALOX5抗体 | ABclonal | A2877 | |
| GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| Caspase-3抗体 | ABclonal | A19654 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| FITC标记二抗 | Millipore | -- | |
| 显微成像 | Epson V850P扫描仪 | Epson | -- |
| 细胞计数分析 | 自动细胞分析仪 | Ruiyu Biotech | Countstar |
| TEM分析 | 透射电子显微镜 | FEI Company | TECNAI |
| Western blot | 凝胶成像系统 | SinSage Technology Co., Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与缺氧处理 | 细胞系为NGEC和HIEC,培养基为DMEM+10%FBS+1%青霉素-链霉素;缺氧条件为1% O2和5% CO2,常氧为5% CO2;处理时间:预缺氧24小时,加药后24小时。 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture, Cell treatment |
| 药物处理 | DHA和EPA浓度(1-50 μM),溶剂对照DMSO;抑制剂浓度:Fer-1(5 μM),Lip-1(1 μM),HG106(20 μM),H89(10 μM),Zileuton(10 μM),GLX351322(10 μM);处理时间:与DHA/EPA同时加药24小时。 阅读提示:Materials and Methods, Cell treatment, Reagents and chemicals |
| 动物实验 | 小鼠品系C57BL/6J,6-8周龄,雌雄各半,每组n=10;缺氧条件为65%海平面氧浓度,持续3天;DHA/EPA剂量50 mg/kg,灌胃,第1、2天给药;Fer-1剂量1 mg/kg,腹腔注射,第1天给药。 阅读提示:Materials and Methods, Animal experiments |
| 脂质过氧化检测 | 使用4-HNE、MDA、LPO检测试剂盒,具体操作按说明书;检测组织或细胞裂解液。 阅读提示:Materials and Methods, Assays for the measurement of lipid peroxidation |
| 脂质组学分析 | HIEC细胞在缺氧或常氧下处理,DHA/EPA浓度50 μM,处理24小时;脂质提取和检测按照文献引用的协议。 阅读提示:Materials and Methods, Lipidomic analysis |