临床症状与生化指标收集与分组
比较T2DN与T2DM患者的临床特征,确定两组间差异指标。
回顾性收集250例T2DM患者,分为T2DN组(n=74)和T2DM组(n=176),收集临床指标,包括性别、年龄、糖尿病病程、BMI、血压、HbA1c、血脂、肾功能指标(SUA、BUN、Scr、Cys-C、UACR、eGFR)及HCY。
Clinical value of free ubiquitin in the identification of diabetic nephropathy in patients with type 2 diabetes mellitus and preliminary exploration of its protective effect.
研究包含临床患者样本的回顾性分析(相关性、回归、ROC)和体外细胞实验(HK-2细胞高糖模型)两个证据层级,但缺乏动物模型或体内验证,证据层级有限。
HK-2细胞系 早期2型糖尿病肾病患者样本
血清游离Ub水平(ELISA测定) 高糖(30 mM)诱导HK-2细胞损伤模型 游离Ub处理浓度(10、50、250 ng/mL) 细胞分组(CON、Mannitol、HG、HG+游离Ub) 凋亡相关蛋白(Bax、cleaved-caspase-3、Bcl2)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较T2DN与T2DM患者的临床特征,确定两组间差异指标。
回顾性收集250例T2DM患者,分为T2DN组(n=74)和T2DM组(n=176),收集临床指标,包括性别、年龄、糖尿病病程、BMI、血压、HbA1c、血脂、肾功能指标(SUA、BUN、Scr、Cys-C、UACR、eGFR)及HCY。
检测血清游离Ub水平,并分析其与肾功能指标的相关性。
采用ELISA检测血清游离Ub水平,并使用Spearman相关分析游离Ub与SUA、BUN、Scr、Cys-C、UACR及eGFR的相关性。
评估血清游离Ub对早期T2DN的诊断价值。
绘制ROC曲线,分析血清游离Ub对T2DM患者早期T2DN发生的诊断价值,确定最佳截断值。
评估血清游离Ub是否为早期T2DN发生的独立影响因素。
将Table 1中P<0.05的指标作为自变量,是否发生早期T2DN作为因变量,进行Logistic回归分析。
建立高糖诱导的肾小管上皮细胞损伤模型,并观察游离Ub的保护作用。
将HK-2细胞分为CON组(5.5 mM葡萄糖)、Mannitol组(30 mM甘露醇)、HG组(30 mM葡萄糖)和HG+游离Ub组(10、50、250 ng/mL),处理24小时。
评估游离Ub对HG诱导的HK-2细胞活力、增殖和凋亡的影响。
使用CCK-8检测细胞活力,EdU染色检测细胞增殖,流式细胞术检测细胞凋亡,RT-qPCR和Western blot检测凋亡相关蛋白(Bax、Bcl2、cleaved-caspase-3)表达,ELISA检测炎症因子(IL-6、IL-1β)水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA检测 | 糖化血红蛋白试剂盒 | Jianglai Bio | KB15201 |
| 血清尿酸试剂盒 | Jianglai Bio | F20019 | |
| 血尿素氮试剂盒 | Jianglai Bio | 1533699959 | |
| 血清肌酐试剂盒 | Jianglai Bio | 1535528451 | |
| 胱抑素C试剂盒 | Jianglai Bio | KB13826 | |
| 甘油三酯试剂盒 | Jianglai Bio | 1535248004 | |
| 总胆固醇试剂盒 | Jianglai Bio | 1535656032 | |
| 高密度脂蛋白胆固醇试剂盒 | Jianglai Bio | 1532931353 | |
| 低密度脂蛋白胆固醇试剂盒 | Jianglai Bio | 1533703183 | |
| 同型半胱氨酸试剂盒 | Jianglai Bio | 1535212467 | |
| 尿白蛋白试剂盒 | Jianglai Bio | A21483 | |
| 尿肌酐试剂盒 | Jianglai Bio | 1533196247 | |
| 游离泛素试剂盒 | Elabscience | E-EL-H1252 | |
| ELISA检测细胞上清 | 白细胞介素-6试剂盒 | Jianglai Bio | 1532976236 |
| 白细胞介素-1β试剂盒 | Jianglai Bio | 1533042635 | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco, Thermo Scientific | -- |
| CCK-8检测 | 细胞计数试剂盒-8试剂 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 酶标仪(Bio-Rad 680) | Bio-Rad | -- | |
| EdU染色 | EdU染色试剂盒 | Ribobio Co., Ltd. | C10310 |
| Hoechst 33342 | Abcam | ab145597 | |
| 免疫荧光显微镜 | OLYMPUS | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V凋亡试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | V13242 |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SYBR Premix Ex Taq II | TaKaRa | RR820A | |
| ABI ViiA7DX系统 | ABI | -- | |
| Western blot | 蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0033 |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| 抗Bax抗体 | Abcam | ab32503 | |
| 抗Bcl2抗体 | Abcam | ab182858 | |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Abcam | ab32042 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 羊抗兔免疫球蛋白G二抗 | Abcam | ab205718 | |
| 化学发光试剂盒(ECL Plus) | Life Technology | -- | |
| 统计分析软件 | SPSS 21.0 | IBM Corp. | -- |
| MedCalc 22.2 | MedCalc Software | -- | |
| GraphPad Prism 8.0.1 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者纳入与排除标准、T2DN诊断标准(UACR 30-300 mg/g)、样本量(T2DN 74例,T2DM 176例) 阅读提示:详见Methods中的“Study subjects”及“Inclusion and exclusion criteria” |
| 血清游离Ub水平测定 | ELISA试剂盒(E-EL-H1252)、样本采集(外周静脉血5mL)、检测方法 阅读提示:详见Methods中的“ELISA” |
| HK-2细胞培养与分组 | 细胞系(HK-2)、培养基(DMEM)、高糖浓度(30 mM)、处理时间(24 h)、游离Ub浓度(10、50、250 ng/mL)、对照组设置(CON、Mannitol) 阅读提示:详见Methods中的“HK-2 cell culture and grouping” |
| 细胞功能与凋亡检测 | CCK-8检测时间点(0, 6, 12, 24 h)、EdU染色浓度(10 μM)和孵育时间(2 h)、流式细胞术细胞数(1×10^5)、检测指标(凋亡蛋白、炎症因子) 阅读提示:详见Methods中的“CCK-8 assay”、“EdU staining assay”、“Flow cytometry”、“RT-qPCR”、“Western blot” |