实时环境空气污染暴露系统建立及动物分组
模拟真实环境空气污染暴露,并设置对照和抗生素干预组以验证肠道微生物组的作用。
使用实时环境空气暴露系统(RTAAE),通过个体化通风笼(IVC)实现全身体暴露。对照组使用HEPA过滤空气,暴露组允许大气颗粒进入。小鼠随机分为四组:FA、Exp、FA+ABX、Exp+ABX。
Exposure to ambient air pollution over developmental stages induced neurodevelopmental impairment in mice offspring via microbiome-gut-brain axis.
包含动物行为实验、组织病理学、炎症因子检测、宏基因组测序、中介分析和抗生素干预等多个层级的功能验证。
C57BL/6小鼠后代 实时环境空气污染暴露小鼠模型
小鼠品系:C57BL/6,购自北京大学医学部动物中心 暴露组与对照组(FA vs Exp)以及ABX干预组(FA+ABX vs Exp+ABX)的分组设计 从受孕(E0.5)至青年期(PND 70)持续暴露 抗生素干预:使用包含氨苄西林、甲硝唑、新霉素三硫酸盐和万古霉素的ABX合剂 行为测试时间点:青春期(PND28-42)和青年期(PND56-70)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟真实环境空气污染暴露,并设置对照和抗生素干预组以验证肠道微生物组的作用。
使用实时环境空气暴露系统(RTAAE),通过个体化通风笼(IVC)实现全身体暴露。对照组使用HEPA过滤空气,暴露组允许大气颗粒进入。小鼠随机分为四组:FA、Exp、FA+ABX、Exp+ABX。
评估空气污染暴露对小鼠情绪和认知功能的影响。
使用旷场实验(OFT)评估焦虑样行为,使用Morris水迷宫(MWM)和反转平台水迷宫评估空间学习记忆和认知灵活性。
评估脑和肠道组织的病理改变以及全身和局部炎症反应。
采集脑(海马、前额叶皮层)、小肠、结肠组织进行H&E染色,海马进行尼氏染色;使用ELISA检测血清、脑组织和结肠中炎症因子水平。
评估空气污染暴露对肠道微生物组组成和功能的影响,并分析其与行为表型的关联。
采集粪便样本,提取DNA后进行鸟枪法宏基因组测序。使用MEGAHIT组装,Prokka基因预测,CD-HIT去冗余,Salmon计算基因丰度。进行物种注释、差异表达基因分析、KEGG通路富集。
通过清除肠道微生物组,验证肠道微生物组在空气污染致神经发育损伤中的中介作用。
使用ABX合剂(氨苄西林、甲硝唑、新霉素三硫酸盐、万古霉素)通过饮水给予,在交配前、断奶期和青年期干预。
分析组间差异、微生物与行为的关联及中介效应。
使用t检验或ANOVA比较组间差异;使用Spearman相关分析微生物和行为指标关联;使用中介分析评估肠道微生物组的中介效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6小鼠 | -- | -- |
| 空气污染暴露 | 实时环境空气暴露系统 | -- | -- |
| 空气采样 | 空气采样泵 | BUCK LP-5 | -- |
| O3浓度检测 | O3浓度检测器 | Two Technology 220 Model | -- |
| 行为测试 | SLY软件 | SLY | -- |
| 组织病理学 | 数字切片扫描仪 | Pannoramic MIDI | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 微生物组分析 | E.Z.N.A.®粪便DNA提取试剂盒 | Omega | D4015 |
| Covaris超声波破碎仪 | -- | -- | |
| Illumina PE150测序 | Illumina | -- | |
| 抗生素干预 | 氨苄西林 | -- | -- |
| 甲硝唑 | -- | -- | |
| 新霉素三硫酸盐 | -- | -- | |
| 万古霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物与实验设计 | 小鼠品系:C57BL/6,来源:北京大学医学部动物中心,年龄6周;分组:FA、Exp、FA+ABX、Exp+ABX;每组10只后代(5雄5雌),来自5个不同窝;交配窗口3天;暴露周期从受孕(E0.5)至青年期。 阅读提示:Methods - Animal and experiment protocol |
| 实时环境空气污染暴露系统 | 暴露系统放置位置:距北京四环中路约200米;PM2.5和O3浓度监测频率:每周;PM2.5采样流速:1.70 L/min;过滤空气组PM2.5和O3低于检出限。 阅读提示:Methods - Real-time ambient air pollution exposure system |
| 行为测试 | 测试时间点:青春期(PND28-42)和青年期(PND56-70);OFT测试时长:5分钟;MWM测试天数:12天(第1天可见平台,2-7天标准,8-12天反转);训练每天4次,间隔10分钟;平台直径15 cm,水迷宫直径100 cm。 阅读提示:Methods - Behavioral tests |
| 组织病理学和炎症因子 | 组织固定:4%多聚甲醛至少24小时;切片厚度:4 μm;ELISA指标:IL-1β、IL-6、IL-10、IL-17a、TNF-α;检测组织:血清、脑(海马和皮层)、结肠。 阅读提示:Methods - Histopathological analysis and ELISA |
| 肠道微生物组分析 | 粪便采集时间点:PND21、PND28、PND56;DNA提取试剂盒:E.Z.N.A.® Stool DNA Kit;测序平台:Illumina PE150;序列组装:MEGAHIT;基因预测:Prokka;差异基因标准:fold change ≥2且q值<0.01。 阅读提示:Methods - Gut microbiome assessment by shotgun metagenomic sequencing |
| 抗生素干预 | ABX成分:氨苄西林(1 g/L)、甲硝唑(1 g/L)、新霉素三硫酸盐(1 g/L)、万古霉素(1 g/L);给药方式:饮水,每两天更换;干预时间:亲代和成年后代每次7天,断奶后代3天半剂量。 阅读提示:Methods - Antibiotic intervention |