建立同系荷瘤小鼠模型
构建NKTCL小鼠模型以评估F. prausnitzii对抗PD-L1疗效的影响
C57BL/6小鼠皮下注射EL4-Luciferase或RMA细胞,建立肿瘤模型。
Faecalibacterium prausnitzii promotes anti-PD-L1 efficacy in natural killer/T-cell lymphoma by enhancing antitumor immunity.
包含体外细胞实验、同系小鼠肿瘤模型、抗生素预处理模型、代谢组学及16S rRNA测序等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
EL4-Luciferase细胞皮下同系移植瘤C57BL/6小鼠模型 RMA细胞皮下同系移植瘤C57BL/6小鼠模型 人NKTCL细胞系KHYG-1、NKYS、YT 抗生素预处理的荷瘤小鼠模型
F. prausnitzii(ATCC 27768)每只小鼠每天经口灌胃约2×10^8 CFU/200 μL 抗PD-L1单抗(Selleck, #A2115)腹腔注射剂量10 mg/kg,每三天一次 丁酸钠(16 mM)通过饮用水给药 抗生素混合物(氨苄青霉素1.0 g/L、甲硝唑1.0 g/L、新霉素1.0 g/L、万古霉素0.5 g/L、两性霉素B 10 mg/L)给药4天 肿瘤体积计算公式:(宽度^2 × 长度) × 0.5,样本量n=6/组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建NKTCL小鼠模型以评估F. prausnitzii对抗PD-L1疗效的影响
C57BL/6小鼠皮下注射EL4-Luciferase或RMA细胞,建立肿瘤模型。
评估活菌补充对肿瘤生长的影响
将F. prausnitzii(ATCC 27768)厌氧培养后,经口灌胃给予小鼠,对比PBS对照。
评估F. prausnitzii与抗PD-L1单抗联合的抗肿瘤效果
给予抗PD-L1 mAb和/或F. prausnitzii处理,定期测量肿瘤体积、肿瘤重量、生物发光强度及Ki67表达。
验证F. prausnitzii产生的丁酸盐水平变化及其作用
利用LC-MS/MS和GC-MS检测粪便、血浆和肿瘤组织中的丁酸浓度。
评估丁酸盐单独或联合抗PD-L1对肿瘤生长的影响
给荷瘤小鼠饮用含16 mM丁酸钠的水,观察肿瘤生长及免疫指标变化。
探究联合治疗对肿瘤微环境中免疫细胞的影响
用流式细胞术和多重免疫组化检测肿瘤和脾脏中CD4+、CD8+ T细胞比例及PD-L1表达。
验证丁酸盐对JAK-STAT通路和PD-L1表达的影响
Western blot检测人NKTCL细胞系中JAK3、p-JAK3、STAT3、p-STAT3和PD-L1蛋白水平。
探究抗生素预处理对抗PD-L1疗效的影响及F. prausnitzii的恢复作用
抗生素处理4天后接种肿瘤,再给予F. prausnitzii或PBS和/或抗PD-L1,观察肿瘤生长。
评估F. prausnitzii对肠道菌群结构和多样性的影响
16S rRNA基因测序分析粪便样本的α多样性和β多样性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 强化梭菌培养基 | BeNa Culture Collection | BNCC372459 |
| 注射器过滤器 | NEST | 331001 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 白细胞介素-2 | -- | S19991010 | |
| 动物模型 | 抗小鼠PD-L1单克隆抗体 | Selleck | A2115 |
| 大鼠IgG2b同型对照 | Selleck | A2116 | |
| D-荧光素 | -- | 150 mg/kg | |
| 药物处理 | 丁酸钠 | -- | 16 mM |
| 甲硝唑 | -- | 1.0 g/L | |
| 新霉素 | -- | 1.0 g/L | |
| 万古霉素 | -- | 0.5 g/L | |
| 两性霉素B | -- | 10 mg/L | |
| 微滴数字PCR | QX200 EvaGreen数字PCR预混液 | Bio-Rad | 1864034 |
| 无RNase水 | -- | CW0612M | |
| 荧光原位杂交 | SweAMI-FISH试剂盒 | Servicebio | GF003 |
| 酶联免疫吸附试验 | 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience BiotechnologyCo.,Ltd | E-HSEL-M0007 |
| 小鼠Foxp3 ELISA试剂盒 | FineTest | EM0691 | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| 流式细胞术 | PE偶联抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100205 |
| PE/Cyanine7偶联抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 116015 | |
| APC偶联抗小鼠CD8a抗体 | BioLegend | 100711 | |
| APC偶联抗小鼠CD274(B7-H1, PD-L1)抗体 | BioLegend | 124311 | |
| APC偶联抗人CD274(B7-H1, PD-L1)抗体 | BioLegend | 329708 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | CWBIO | CW2333S |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1048 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | CWBIO | CW0014S | |
| SDS-PAGE凝胶 | EpiZyme | PG112 | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 | |
| 牛血清白蛋白 | Biofroxx | 4240GR500 | |
| 抗GADPH单抗 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗Jak3 (D1H3)单抗 | CST | 8827 | |
| 抗磷酸化JAK3 (Tyr980/981)多抗 | Proteintech | 29101-1-AP | |
| 抗STAT3单抗 | Proteintech | 60199-1-Ig | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | SANTA CRUZ | sc-8059 | |
| 抗PD-L1/CD274单抗 | Proteintech | 66248-1-Ig | |
| 山羊抗小鼠IgG,HRP偶联 | CWBIO | CW0102S | |
| 山羊抗兔IgG,HRP偶联 | CWBIO | CW0103S | |
| Super ECL Prime 化学发光底物 | UElandy | S6008M | |
| 多重免疫组织化学 | 抗CD4抗体 | Abcam | ab288724 |
| 抗CD8抗体 | Abcam | ab217344 | |
| 抗PD-L1抗体 | CST | 64988 | |
| Opal 520 | Akoya Biosciences | -- | |
| Opal 620 | Akoya Biosciences | -- | |
| Opal 690 | Akoya Biosciences | -- | |
| 16S rRNA基因测序 | FastPure粪便DNA提取试剂盒 | MJYH | -- |
| PCR纯化试剂盒 | -- | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养与制备 | F. prausnitzii(ATCC 27768)在强化梭菌培养基中厌氧培养48小时,离心重悬于PBS至约2×10^8 CFU/200 μL 阅读提示:Methods: Bacterial strains, culture, and preparation |
| 细胞与动物模型 | C57BL/6雌性小鼠4-5周龄,皮下注射1×10^6 EL4-Luciferase或RMA细胞;细胞系培养条件(RPMI 1640或DMEM含10% FBS、青霉素-链霉素) 阅读提示:Methods: Cell culture, Tumor-bearing mouse model |
| 给药方案 | 抗PD-L1 mAb 10 mg/kg腹腔注射每三天一次;F. prausnitzii每日灌胃200 μL(约2×10^8 CFU);丁酸钠16 mM饮用水;抗生素混合物浓度和给药时间(肿瘤接种前4天) 阅读提示:Methods: Tumor-bearing mouse model |
| 肿瘤评估 | 肿瘤体积计算公式:(宽度^2 × 长度) × 0.5;生物发光成像使用D-Luciferin 150 mg/kg,10分钟后检测;Ki67免疫组化评分 阅读提示:Methods: Tumor-bearing mouse model, Immunohistochemistry, Figure legends (Fig. 1, Fig. 2) |
| 流式细胞术 | 肿瘤和脾脏单细胞悬液制备;抗体浓度:CD3-PE 1:100, CD4-PE/Cy7 1:100, CD8a-APC 1:100, CD274-APC 1:100;人细胞系CD274-APC 1:50 阅读提示:Methods: Flow cytometric analysis |
| Western blot | 蛋白提取使用RIPA缓冲液(含抑制剂);抗体浓度:JAK3 1:1000, p-JAK3 1:1000, STAT3 1:1000, p-STAT3 1:200, PD-L1 1:1000, GAPDH 1:1000 阅读提示:Methods: Western blot |