建立MI小鼠模型并验证miR-499a-5p表达
确定MI后心脏组织中miR-499a-5p的表达变化及心脏损伤特征。
通过结扎左前降支冠状动脉建立MI小鼠模型,使用RT-qPCR检测心脏组织中miR-499a-5p表达,Masson染色评估纤维化,超声心动图检测心功能。
Inhibition of miR-499a-5p Ameliorates Apoptotic and Autophagic Damage in Hypoxic Cardiomyocytes H9c2 Through Upregulation of ARGLU1.
包含体内MI小鼠模型和体外H9c2细胞模型,并进行了功能获得与缺失实验、靶标验证和拯救实验,验证了miR-499a-5p/ARGLU1轴。
MI小鼠模型(C57BL/6) H9c2大鼠心肌细胞系
miR-499a-5p在MI小鼠心脏组织和缺氧H9c2细胞中的表达上调 miR-499a-5p抑制剂和mimics对缺氧诱导凋亡和自噬的影响 ARGLU1作为miR-499a-5p直接靶标的验证 ARGLU1敲低对缺氧诱导细胞损伤的影响及拯救实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MI后心脏组织中miR-499a-5p的表达变化及心脏损伤特征。
通过结扎左前降支冠状动脉建立MI小鼠模型,使用RT-qPCR检测心脏组织中miR-499a-5p表达,Masson染色评估纤维化,超声心动图检测心功能。
在体外模拟心肌梗死应激,确认miR-499a-5p在缺氧条件下的表达变化。
将H9c2细胞置于缺氧环境中培养,通过RT-qPCR检测miR-499a-5p表达。
检验miR-499a-5p表达改变是否影响缺氧条件下H9c2细胞的凋亡和自噬。
将miR-499a-5p抑制剂或mimics转染至缺氧H9c2细胞,通过TUNEL、流式细胞术、Western blot检测凋亡和自噬相关指标。
确认miR-499a-5p是否直接靶向ARGLU1及其负调控关系。
利用TargetScan预测靶基因,通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-499a-5p与ARGLU1 3'UTR的直接结合,并在缺氧细胞中检测ARGLU1表达及其受miR-499a-5p调控。
验证ARGLU1在缺氧诱导凋亡和自噬中的作用。
通过转染sh-ARGLU1敲低ARGLU1表达,检测缺氧条件下H9c2细胞凋亡和自噬的变化。
确定miR-499a-5p的调控作用是否依赖于ARGLU1。
在miR-499a-5p抑制剂处理的同时共转染sh-ARGLU1,检测细胞凋亡、自噬及ARGLU1表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 6-0丝线缝合线 | -- | -- |
| 动物麻醉 | 异氟烷 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| miR-499a-5p模拟物 | RiboBio | -- | |
| miR-499a-5p抑制剂 | RiboBio | -- | |
| sh-ARGLU1质粒 | RiboBio | -- | |
| 凋亡检测 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Roche | -- |
| DAPI染色液 | Elabscience | -- | |
| 自噬检测 | 单丹磺酰戊二胺 | Sigma | -- |
| 荧光素酶报告实验 | pmirGLO载体 | Genscript | -- |
| 双荧光素酶报告检测系统 | Promega | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Solarbio Science & Technology | -- |
| 抗Cleaved caspase-3抗体 | Wanwu | DRF10148 | |
| 抗p53抗体 | Abcam | ab131442 | |
| 抗LC3 II抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| 抗LC3I抗体 | Cell Signaling Technology | 4599 | |
| 抗p62抗体 | Abcam | ab109012 | |
| 抗ARGLU1抗体 | Arigo | ARG40881 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8224 | |
| ECL检测系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录PCR | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| RT-qPCR | QuantiNova SYBR Green PCR试剂盒 | Qiagen | -- |
| QuantStudio 3实时PCR系统 | Thermo Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6)、性别(雄性)、年龄(10周)、体重(20-25g)、样本量(每组6只),MI模型建立方法(LAD结扎),术后检测时间点(第3、7、14天)。 阅读提示:Materials and Methods 2.1 Animal Model 及 Figure 1 legend |
| 心肌纤维化评估 | Masson三色染色步骤,组织处理(4%多聚甲醛固定、脱钙、脱水、透明、石蜡包埋、5μm切片),图像分析软件(ImageJ)。 阅读提示:Materials and Methods 2.2 Masson's Trichrome Staining |
| 细胞缺氧模型 | H9c2细胞来源(ATCC),培养条件(DMEM+10% FBS+1% 青霉素-链霉素),缺氧条件(约99.9% N2和少于1% O2,37°C,72小时)。 阅读提示:Materials and Methods 2.3 Cell Culture and Transfection |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000),转染物(miR-499a-5p mimics, inhibitor, sh-ARGLU1及其对照),转染时间(48小时)。 阅读提示:Materials and Methods 2.3 Cell Culture and Transfection |
| 凋亡检测 | TUNEL试剂盒(Roche),固定液(4% PFA),透化(0.1% Triton X-100),反应时间(1小时室温),DAPI染色(10分钟),流式细胞仪(Beckman Coulter)。 阅读提示:Materials and Methods 2.4 Terminal Deoxynucleotidyl Transferase dUTP Nick-End Labeling (TUNEL) Staining |
| 自噬检测 | MDC浓度(50μM),孵育时间(10分钟,室温避光),流式细胞仪(Becton-Dickinson)。 阅读提示:Materials and Methods 2.5 Flow Cytometry |
| 荧光素酶报告实验 | 载体(pmirGLO),构建(ARGLU1-WT和ARGLU1-Mut),共转染(miR-499a-5p mimics或NC mimics),转染时间(48小时),检测系统(Dual-Luciferase Reporter Assay System)。 阅读提示:Materials and Methods 2.6 Luciferase Reporter Assay |
| Western blot | 蛋白提取(RIPA+PMSF),蛋白定量(BCA),电泳上样量(30μg),SDS-PAGE浓度(10%),转膜(PVDF膜),封闭(5%脱脂牛奶),一抗浓度(如1:1000),二抗孵育(1小时室温),内参(β-actin)。 阅读提示:Materials and Methods 2.7 Western Blotting 及 Figure 2-6 legends |
| RT-qPCR | RNA提取(TRIzol),逆转录试剂盒(RevertAid),PCR试剂盒(QuantiNova SYBR Green),仪器(QuantStudio 3),内参(GAPDH/GAPDH, U6),引物序列(Table 1),计算方法(2^-ΔΔCt)。 阅读提示:Materials and Methods 2.8 Reverse Transcription Quantitative PCR (RT-qPCR) 及 Table 1 |
| 统计分析 | 统计软件(SPSS 22.0),数据表示(mean±SD),多组比较(单因素方差分析),两组比较(t检验),显著性水平(p<0.05)。 阅读提示:Materials and Methods 2.9 Statistical Analysis |