检测AD模型中AP2A1表达和自噬状态
验证AD模型中AP2A1表达和自噬流是否受损
通过免疫组化、Western blot和透射电镜检测WT和APP/PS1小鼠海马、N2a/APP细胞和Aβ处理的原代神经元中AP2A1、Rab7-GTP、SQSTM1和LC3-II水平及自噬体积累。
AP2A1 activates Rab7 to promote axonal autophagosome transport and slow the progression of Alzheimer's disease.
包含细胞模型(N2a/APPswe、原代神经元)和动物模型(APP/PS1小鼠),并通过分子结合、功能验证和行为学等多种层级验证。
N2a/APPswe细胞 Aβ寡聚体处理的原代海马神经元 APP/PS1转基因小鼠
AP2A1过表达后Rab7-GTP水平升高,且能促进RILP和DIC1的募集 采用CID1067700抑制Rab7活性验证AP2A1作用依赖于Rab7 通过mCherry-LC3活细胞成像观察轴突内自噬体逆向运输 APP/PS1小鼠海马注射AAV-AP2A1后Aβ沉积减少 行为学测试(Morris水迷宫、旷场、物体识别、Y迷宫)显示AP2A1改善认知
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AD模型中AP2A1表达和自噬流是否受损
通过免疫组化、Western blot和透射电镜检测WT和APP/PS1小鼠海马、N2a/APP细胞和Aβ处理的原代神经元中AP2A1、Rab7-GTP、SQSTM1和LC3-II水平及自噬体积累。
探究AP2A1过表达是否恢复AD细胞模型中的自噬流
在N2a/APP细胞和Aβ处理的原代神经元中过表达Flag-AP2A1,通过Western blot、mCherry-GFP-LC3荧光、透射电镜和ELISA检测自噬流、自噬体-溶酶体融合及Aβ分泌。
阐明AP2A1是否与Rab7结合并激活Rab7
通过Co-IP、IF共定位和分子对接检测AP2A1与Rab7的相互作用,并通过Rab7 pull-down激活实验测定Rab7-GTP水平。
验证AP2A1能否通过激活Rab7增强自噬体的逆向轴突运输
在Aβ处理的原代海马神经元中过表达Flag-AP2A1,用CID1067700抑制Rab7,通过活细胞成像(mCherry-LC3)和kymograph分析自噬体运动。
验证AP2A1介导的自噬流恢复是否依赖Rab7激活
在N2a/APP细胞和APP/PS1小鼠海马中通过Western blot、mCherry-GFP-LC3和TEM检测自噬流和自噬体积累,同时给予CID1067700处理。
检测AP2A1激活Rab7在炎症、突触结构和Aβ沉积中的神经保护作用
通过免疫组化检测GFAP、IBA1和6E10,Golgi-Cox染色检测树突棘密度,免疫荧光检测突触蛋白和PSD95,ELISA检测Aβ分泌,同时用CID1067700抑制Rab7。
验证AP2A1通过激活Rab7能否改善AD模型小鼠的学习记忆和行为
对9月龄WT和APP/PS1小鼠进行Morris水迷宫、旷场、物体识别和Y迷宫测试,同时设置CID1067700处理组。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质粒构建 | pcDNA3.1 | Genecreat | -- |
| Flag-AP2A1 | Genecreat | -- | |
| 质粒转染 | GFP-Rab7 | Miaoling Biology | -- |
| mCherry-LC3 | Miaoling Biology | -- | |
| mCherry-GFP-LC3 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 动物实验 | HBAAV2/9-Syn-ZsGreen | HanBio | -- |
| HBAAV2/9-Syn-h-AP2A1-3×flag | HanBio | -- | |
| 药物处理 | CID1067700 | MCE | HY-13452 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| 原代神经元分离 | 木瓜蛋白酶 | -- | -- |
| 脱氧核糖核酸酶 | -- | -- | |
| 原代神经元培养 | 马血清 | Gibco | -- |
| Neurobasal Plus培养基 | Gibco | -- | |
| B27 Plus补充剂 | Gibco | -- | |
| GlutaMAX补充剂 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- | |
| Aβ寡聚体制备 | Aβ1-42肽 | Aladdin | A494432 |
| 1,1,1,3,3,3-六氟-2-丙醇 | Aladdin | H107503 | |
| 蛋白提取 | Western和IP细胞裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013 |
| 蛋白定量 | 增强型BCA蛋白测定试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0010 |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | -- |
| ECL试剂盒 | Share Bio | -- | |
| Tanon-5200多化学发光分析系统 | Tanon | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G PLUS-琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| Rab7活性检测 | anti-active Rab7小鼠单克隆抗体 | NewEast Biosciences | 26923 |
| anti-Rab7兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9367 | |
| 分子对接 | ZDOCK 3.0.2 | -- | -- |
| 分子对接可视化 | PyMOL软件v2.2.0 | -- | -- |
| 免疫组化 | 改进型柠檬酸盐抗原修复液 | Biosharp | BL151A |
| DAB底物试剂盒 | Biosharp | BL732A | |
| 免疫组化扫描 | 数字病理切片扫描仪 | KFBIO | KF-PRO-005 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime Biotechnology | P0096 |
| QuickBlock™封闭液 | Beyotime Biotechnology | P0260 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime Biotechnology | P0126 | |
| 激光共聚焦显微镜 (STELLARIS 5) | Leica | -- | |
| 溶酶体酸化检测 | LysoSensor™ Green DND-189探针 | Invitrogen | -- |
| 活细胞成像 | Olympus IX-83显微镜 | Olympus | -- |
| cellSens活细胞成像软件 | Olympus | -- | |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 (JEM-1400FLASH) | JEOL | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒 (Aβ1-42) | Elabscience | E-EL-H0543 |
| ELISA试剂盒 (Aβ1-40) | Elabscience | E-EL-H0542 | |
| Golgi-Cox染色 | Golgi-Cox染色试剂盒 | Servicebio | G1069 |
| Golgi-Cox成像 | 数字组织切片扫描仪 (Pannoramic MIDI) | 3DHISTECH | -- |
| CaseViewer软件版本2.4 | 3DHISTECH | -- | |
| 行为学 | SMART 3.0软件 | Panlab Harvard Apparatus | -- |
| EthoVision XT 17动物追踪系统 | Noldus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型 | N2a/APPswe细胞和原代海马神经元,Aβ寡聚体处理浓度2µM、时间24h 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Aβ oligomers preparation |
| 动物模型 | 8月龄APP/PS1小鼠,海马立体定位注射AAV(坐标AP 2.3mm, ML ±1.8mm, DV 2.0mm),注射体积2µL 阅读提示:Materials and methods: Animals, Stereotactic injection of adeno-associated virus |
| Rab7抑制 | CID1067700细胞处理浓度40µM、24h;动物腹腔注射16mg/kg每周一次持续1月 阅读提示:Materials and methods: Intraperitoneal injection and cell treatment of CID1067700 |
| 自噬体轴突运输检测 | 原代神经元DIV5-7,Aβ处理2µM 24h,饥饿3h,活细胞成像时长至少100s 阅读提示:Materials and methods: Live-cell imaging and analysis |
| 行为学测试 | 9月龄小鼠,水迷宫5天训练+探针实验,旷场8分钟,物体识别3天,Y迷宫8分钟 阅读提示:Materials and methods: Morris water maze, Open field test, Object recognition test, Y-maze test |