验证M2 EVs参与ILC2s活化
确定肺组织中的EVs是否由M2巨噬细胞分泌,并验证其对ILC2s活化的必要性。
使用GW4869抑制EVs生成,观察ILC2s数量、增殖和细胞因子产生;通过TEM、NTA和Western blot表征EVs,并检测M2标志物(CD206、Arg-1)。
Extracellular vesicles derived from lung M2 macrophages enhance group 2 innate lymphoid cells function in allergic airway inflammation.
包含动物模型(木瓜蛋白酶诱导的哮喘小鼠)、体外细胞实验(BMDMs、ILC2s)、体内功能验证(巨噬细胞清除、EVs转移)以及RNA测序和代谢分析等独立证据层级。
木瓜蛋白酶诱导的哮喘小鼠模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)极化M2 小鼠肺ILC2s
小鼠品系:C57BL/6和Rag1−/−,6-8周龄,雌性 哮喘模型诱导:木瓜蛋白酶200 μg腹腔注射(第0、7天),100 μg鼻内给药(第14-17天) M2 EVs处理浓度:200 μg/ml(体外)和200 μg(体内) 巨噬细胞清除:氯膦酸盐脂质体(CLs)100 μl鼻内给药,连续3天 GW4869剂量:1.5 mg/kg鼻内给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定肺组织中的EVs是否由M2巨噬细胞分泌,并验证其对ILC2s活化的必要性。
使用GW4869抑制EVs生成,观察ILC2s数量、增殖和细胞因子产生;通过TEM、NTA和Western blot表征EVs,并检测M2标志物(CD206、Arg-1)。
证实M2 EVs对维持ILC2s数量和功能的关键作用。
用氯膦酸盐脂质体清除巨噬细胞,然后回补M2 EVs,检测ILC2s数量、细胞因子产生、BALF细胞因子水平及肺部病理变化。
确认M2 EVs是否被ILC2s直接内化并探究其内化途径。
体内通过鼻内给予PKH26标记的M2 EVs,使用共聚焦显微镜和流式细胞术检测ILC2s对EVs的摄取;体外使用内吞抑制剂处理ILC2s后检测内化效率。
鉴定M2 EVs中可能介导ILC2s活化的功能性lncRNA。
对M0和M2 EVs进行RNA测序,分析差异表达的lncRNA,并通过RT-qPCR验证候选lncRNA的表达;选择4930474H06Rik进行进一步研究,并分析其亚细胞定位。
证明M2 EVs传递的4930474H06Rik是否能促进ILC2s活化。
在M2巨噬细胞中敲低4930474H06Rik,收集M2 EVs后与ILC2s共培养,检测ILC2s增殖、细胞因子产生和活化标志物表达。
验证M2 EVs中的4930474H06Rik在体内对ILC2s活化和气道炎症的作用。
在哮喘小鼠模型中给予敲低4930474H06Rik的M2 EVs,检测肺部炎症、ILC2s数量和功能、嗜酸性粒细胞浸润及M1/M2巨噬细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| M2巨噬细胞极化 | 白细胞介素-4 | PeproTech | -- |
| EVs分离 | II型胶原酶 | -- | -- |
| EVs表征 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| 抗CD63抗体 | Abcam | -- | |
| 抗CD81抗体 | Abcam | -- | |
| 抗HSP70抗体 | Abcam | -- | |
| 抗钙联蛋白抗体 | Abcam | -- | |
| Tanon 5200化学发光成像系统 | Tanon Science & Technology | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞因子刺激 | 白细胞介素-2 | -- | -- |
| 白细胞介素-7 | -- | -- | |
| 白细胞介素-33 | -- | -- | |
| 内化机制研究 | dynasore | -- | -- |
| 氯丙嗪 | -- | -- | |
| 阿米洛利 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 抗CD16/CD32抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗CD45抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗谱系抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CD90抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗ST2抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗IL-5抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗IL-13抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| eBioscience细胞内固定和透化缓冲液套装 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| True-Nuclear转录因子缓冲液试剂盒 | BioLegend | -- | |
| 抗Ki67抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗F4/80抗体 | Elabscience | AF13724 | |
| 抗CD86抗体 | Elabscience | AF10959 | |
| 抗CD206抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CD11c抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗Siglec-F抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | MultiSciences Biotech Co., Ltd. | -- |
| RNA测序 | NEBNext Ultra试剂盒 | NEB | -- |
| Illumina RNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Agilent 2200 TapeStation | Agilent | -- | |
| Qubit 2.0荧光计 | Life Sciences | -- | |
| HiSeq30000测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| Lightcycler 480系统 | Roche | -- | |
| FISH | Genepharma FISH试剂盒 | Genepharma | -- |
| 转染 | 转染试剂 | RiboBio | -- |
| 代谢分析 | Seahorse XFe24细胞外流量分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| Seahorse XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别、体重;木瓜蛋白酶剂量、给药途径和时间;麻醉和 euthanasia 方法。 阅读提示:Materials and methods: Mice, Mouse model of asthma |
| EVs分离和表征 | 肺组织消化条件(胶原酶浓度、时间、温度);离心速度和时间;超速离心参数;EVs鉴定标志物。 阅读提示:Materials and methods: Isolation of EVs from lung tissues, Characterization of M2 EVs |
| 细胞培养和极化 | BMDMs分离方法;L929条件培养基成分;IL-4浓度和刺激时间;M2极化验证指标。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| ILC2s分选和培养 | ILC2s富集试剂盒;细胞因子组合(IL-2、IL-7、IL-33)浓度;培养时间。 阅读提示:Materials and methods: Sorting and cell culture of ILC2s |
| 体内处理 | GW4869剂量和给药方式;氯膦酸盐脂质体剂量和疗程;M2 EVs回补的剂量和时间。 阅读提示:Materials and methods: Mouse model of asthma, Macrophages depletion; Figure legends for Fig. 1 and Fig. 3 |
| 转染实验 | smart silencer序列和浓度;转染试剂;转染时间;敲低效率验证方法。 阅读提示:Materials and methods: Transfection of the 4930474H06Rik smart silencer in M2 macrophages |
| 代谢分析 | 细胞密度;Seahorse实验程序;糖酵解参数计算。 阅读提示:Materials and methods: ECAR |