蛋白质组学分析
鉴定LPS诱导的ALI小鼠肺组织中差异表达蛋白,特别是与cGAS-STING通路和焦亡相关的蛋白。
对LPS刺激和对照组小鼠肺组织进行4D标记-free定量质谱分析,利用MaxQuant鉴定蛋白,并进行GO、KEGG、GSEA和PPI分析。
Rutin ameliorates LPS-induced acute lung injury in mice by inhibiting the cGAS-STING-NLRP3 signaling pathway.
包含LPS诱导的ALI小鼠模型、蛋白质组学、Western blot、RT-qPCR、ELISA、免疫组化、免疫荧光、TUNEL染色及STING抑制剂验证,涵盖分子、细胞和组织水平的功能与机制验证。
LPS诱导的急性肺损伤(ALI)小鼠模型(雄性C57BL/6小鼠)
芦丁给药剂量:50/100 mg/kg体重,灌胃,隔天一次,共14天 LPS诱导剂量:气管内注射5 mg/kg ultrapure E. coli O55:B5 LPS STING抑制剂C-176剂量:腹腔注射20 mg/kg,LPS暴露前30分钟 观察时间点:LPS刺激后72小时 实验分组:Vehicle对照、LPS、LPS+芦丁、芦丁单药,每组5只小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定LPS诱导的ALI小鼠肺组织中差异表达蛋白,特别是与cGAS-STING通路和焦亡相关的蛋白。
对LPS刺激和对照组小鼠肺组织进行4D标记-free定量质谱分析,利用MaxQuant鉴定蛋白,并进行GO、KEGG、GSEA和PPI分析。
评估芦丁对LPS诱导的ALI肺损伤的保护作用。
雄性C57BL/6小鼠随机分4组,芦丁(50/100 mg/kg)灌胃预处理14天,然后气管内注射LPS诱导ALI,72小时后分析肺组织。
评估芦丁对LPS诱导的肺组织损伤和通透性的影响。
对肺组织进行H&E染色,计算肺损伤评分;免疫组化检测SP-D和STING表达。
评估芦丁对LPS诱导的氧化应激和炎症因子表达的影响。
检测肺组织MDA水平和SOD活性,通过RT-qPCR检测炎性细胞因子mRNA表达。
评估芦丁对LPS诱导的肺细胞凋亡的影响。
TUNEL染色检测凋亡细胞,Western blot检测Bax、Bcl-2、cleaved caspase-3,RT-qPCR检测Bax和Casp3 mRNA。
评估芦丁对LPS诱导的cGAS-STING通路激活的影响。
Western blot检测cGAS、STING、p-TBK1、p-IRF3水平,免疫组化检测STING表达。
评估芦丁对LPS诱导的NLRP3炎症小体和焦亡的影响。
Western blot检测NLRP3、ASC、pro-Caspase-1、GSDMD-NT、IL-18,RT-qPCR检测NLRP3、ASC、Casp1、GSDMD,ELISA检测IL-1β,免疫荧光检测NLRP3。
验证STING在LPS诱导的NLRP3焦亡中的上游调控作用。
使用STING抑制剂C-176预处理,检测STING下游通路和NLRP3焦亡相关蛋白及mRNA水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 芦丁 | Acmec Biochemical Technology Co., Ltd. | R81950 |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2880 | |
| C-176 | MedChemExpress | HY-112906 | |
| 免疫组化 | 抗STING抗体 | CST | 13647T |
| 抗SP-D抗体 | Abcam | ab220422 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Servicebio | GB23303 | |
| 免疫荧光 | 抗NLRP3抗体 | Abcam | Ab270449 |
| 山羊抗兔IgG H&L(Alexa Fluor® 594) | Abcam | ab150080 | |
| DAPI | Beyotime | P0131 | |
| RT-qPCR | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme | RC112-01 |
| HiScript III RT SuperMix用于qPCR(+gDNA wiper) | Vazyme | R323-01 | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711-02 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 抗Bax抗体 | CST | 2772T | |
| 抗Bcl-2抗体 | HUABIO | ET1702-53 | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | CST | 9661T | |
| 抗cGAS抗体 | CST | 31659S | |
| 抗STING抗体 | CST | 13647T | |
| 抗p-TBK1/NAK (Ser172)抗体 | CST | 5483T | |
| 抗p-IRF-3 (Ser396)抗体 | CST | 4947S | |
| 抗p-NF-κB p65 (Ser536)抗体 | CST | 3033T | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | Ab270449 | |
| 抗ASC/TMS1抗体 | CST | 67824T | |
| 抗pro Caspase-1 + p10 + p12抗体 | Abcam | Ab179515 | |
| 抗GSDMD抗体 | Abcam | ab209845 | |
| 抗IL-18抗体 | proteintech | 10663-1-AP | |
| 抗β-actin抗体 | Beyotime | AF5003 | |
| HRP标记的二抗 | HUABIO | HA1001 | |
| UltraSignal ECL底物 | 4A Biotech | 4AW011 | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-HSEL-M0001-96T |
| 氧化应激检测 | MDA检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K020-M-96T |
| SOD检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K025-M |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与给药 | 小鼠品系、性别、年龄、体重、分组、芦丁剂量和给药频率、LPS剂量和给药途径、观察时间点 阅读提示:Methods 2.1 Animals, 2.2 Mouse model of ALI and drug treatment |
| 蛋白质组学 | 样本量、质谱平台、蛋白提取方法、酶解方法、定量方法 阅读提示:Methods 2.3 Proteomics analysis |
| 组织病理学 | 固定液、切片厚度、染色方法、评分标准 阅读提示:Methods 2.4 Hematoxylin and eosin staining and injury score analysis |
| 分子检测 | 抗体货号、稀释比例、内参基因、PCR条件 阅读提示:Methods 2.8 RT-qPCR, 2.9 Western blot analysis |
| STING抑制剂验证 | 抑制剂名称、剂量、给药途径、预处理时间 阅读提示:Methods 2.2 Mouse model of ALI and drug treatment, Results 3.7 |