抗原结构预测
评估Pro-GP4和Ad5-GP4疫苗候选物的抗原结构特征。
使用多种生物信息学工具(如SOPMA、PSIPRED、Robetta、ProSA、PROCHECK、HDOCK)对两种表达系统的GP4蛋白进行二级、三级结构预测和受体结合分析。
PRRSV GP4 subunit vaccine combined with adenovirus heterologous prime-boost immunization strategy induced a significant immune response in mice.
包含抗原结构预测、体外蛋白表达纯化、重组腺病毒构建及小鼠免疫实验,涵盖体液和细胞免疫评价等至少两个独立证据层级。
BALB/c小鼠(4-6周龄雌性) 293AD细胞 Marc-145细胞 PRRSV XJSW-2021株
免疫分组:6组,每组10只小鼠 免疫途径:初次免疫皮下注射,加强免疫肌肉注射 免疫剂量:文中未明确说明各疫苗的具体剂量 中和抗体滴度测定时间:免疫后第28天和42天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Pro-GP4和Ad5-GP4疫苗候选物的抗原结构特征。
使用多种生物信息学工具(如SOPMA、PSIPRED、Robetta、ProSA、PROCHECK、HDOCK)对两种表达系统的GP4蛋白进行二级、三级结构预测和受体结合分析。
获取重组GP4蛋白用于免疫实验。
将密码子优化的GP4基因克隆至pSumo-Mut载体,转化大肠杆菌ArcticExpress(DE3),经IPTG诱导表达,Ni-NTA亲和纯化,SDS-PAGE及Western blot验证。
获取表达GP4的重组腺病毒载体。
将密码子优化的GP4基因克隆至pAdTrack-CMV,与pAdeasy-1在大肠杆菌BJ5183中同源重组,PacI酶切鉴定,转染293AD细胞包装,荧光及Western blot验证。
评估疫苗组合的安全性和免疫原性。
4-6周龄雌性BALB/c小鼠随机分6组,进行初免和加强免疫,监测体重和不良反应。
评估疫苗诱导的抗体应答。
收集小鼠血清,通过间接ELISA检测GP4特异性IgG及其亚型(IgG1、IgG2a),并通过中和试验测定中和抗体滴度。
评估疫苗诱导的细胞免疫应答。
分离脾淋巴细胞,进行淋巴细胞增殖实验(CCK-8法)和IFN-γ ELISpot检测。
分析血清和淋巴细胞中细胞因子的转录及分泌水平。
提取脾淋巴细胞RNA,RT-qPCR检测IL-4、IFN-γ、TNF-α mRNA水平;ELISA检测血清中细胞因子含量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Biosharp | -- | |
| 蛋白质纯化 | Ni-NTA树脂 | GenScript | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| Western blot | 小鼠抗His标签单克隆一抗 | Proteintech | -- |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP(H+L)二抗 | Proteintech | -- | |
| 山羊抗猪IgG-HRP(H+L)二抗 | Proteintech | -- | |
| ELISA | HRP标记的抗小鼠IgG抗体 | Proteintech | -- |
| TMB底物 | Solarbio | -- | |
| 酶标仪 | Tecan | -- | |
| ELISpot | ELISpot Plus板 | Mabtech | -- |
| 细胞因子检测 | IL-4 ELISA试剂盒 | Lunchangshuo | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Lunchangshuo | -- | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience | -- | |
| RT-qPCR | 总RNA提取试剂盒 | TransGen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗原结构预测 | GP4序列中信号肽的去除与否,以及使用的预测工具及参数 阅读提示:Methods部分'Bioinformatic prediction' |
| GP4亚单位疫苗构建与纯化 | 密码子优化序列、诱导条件(IPTG浓度、温度、时间)、纯化方法 阅读提示:Methods部分'Prokaryotic expression and protein purification' |
| 重组腺病毒构建 | 穿梭质粒和骨架质粒、同源重组菌株、转染细胞系及观察时间 阅读提示:Methods部分'Expression and characterization of the recombinant adenovirus' |
| 小鼠免疫实验 | 小鼠品系、周龄、性别、随机分组及每组数量、免疫剂量和途径、初免加强时间间隔 阅读提示:Methods部分'Immunization protocol for mouse animals'及图3A |
| 体液免疫检测 | ELISA包被抗原浓度、血清稀释倍数、孵育时间和温度、中和试验细胞系和病毒株、观察时间 阅读提示:Methods部分'ELISA'和'Neutralization assay' |
| 细胞免疫检测 | 淋巴细胞分离方法、刺激物及浓度、培养时间、ELISpot板规格和读数方法、增殖试验检测方法 阅读提示:Methods部分'Isolation of the lymphocytes'、'ELISpot'和'Lymphocyte proliferation assay' |
| 细胞因子检测 | 脾细胞刺激条件、RNA提取及反转录方法、引物序列、PCR条件、血清采集时间 阅读提示:Methods部分'Transcriptional levels of cytokines in lymphocytes'和'Quantification of cytokines in the serum' |