体外药敏试验
测定CAL、HES及常规抗生素对副猪嗜血杆菌的MIC值,并评估联合用药效果。
采用肉汤微量稀释法测定MIC,棋盘法评估联合效应并计算FICI。
Antibacterial effects of cinnamaldehyde and hesperitin on resistant Glaesserella parasuis by suppressing QseBC two-component system.
包含体外药敏、生物膜、膜完整性、铁利用、基因表达、分子对接、荧光猝灭及小鼠体内保护实验等多层级验证。
副猪嗜血杆菌(G. parasuis)菌株 BALB/c小鼠感染模型 E. coli BL21 (DE3)表达系统
CAL和HES的MIC值:均为128 µg/mL 生物膜形成抑制实验:浓度梯度1/8 MIC至2 MIC,结晶紫染色,OD570测定 QseBC相关基因表达水平:qRT-PCR,1/8、1/4、1/2 MIC处理,16S rRNA作为内参 小鼠感染模型:BALB/c小鼠,CAL和HES剂量分组(30, 60, 120 mg/kg),感染剂量3×10^9 CFU QseC蛋白荧光猝灭实验:QseC蛋白浓度100 µg/mL,CAL/HES浓度范围1 µg/mL至1 mg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
测定CAL、HES及常规抗生素对副猪嗜血杆菌的MIC值,并评估联合用药效果。
采用肉汤微量稀释法测定MIC,棋盘法评估联合效应并计算FICI。
评估CAL、HES及其联合在不同浓度下对副猪嗜血杆菌生长的影响。
将不同浓度CAL或HES加入0.5麦氏浊度菌液,37°C孵育24小时,测定OD600。
检测CAL、HES及其联合对副猪嗜血杆菌生物膜形成的影响。
用结晶紫染色法评估生物膜生物量,测定OD570。
评估CAL和HES对生物膜形成期间胞外DNA和蛋白质的影响。
提取eDNA测定UV吸收,用BCA试剂盒测定蛋白质。
检测CAL和HES对副猪嗜血杆菌膜通透性的影响。
测定处理后的细菌悬浮液电导率。
观察CAL和HES处理后副猪嗜血杆菌的形态变化。
用扫描电子显微镜观察经不同浓度处理的细菌。
评估CAL和HES对细菌膜完整性的影响。
使用CLSM和Live/dead Bacterial Staining Kit观察活菌(绿色)和死菌(红色)。
检测CAL和HES对副猪嗜血杆菌细胞内铁水平的影响。
用比色法试剂盒测定总铁和亚铁含量。
评估CAL和HES对QseBC相关基因表达的影响。
用qRT-PCR检测相关基因的转录水平。
预测CAL和HES与QseBC蛋白的结合模式。
使用SWISS-MODEL构建蛋白模型,Autodock Tools进行对接。
验证CAL和HES与QseC蛋白的相互作用。
表达纯化QseC蛋白,测定不同浓度CAL/HES存在下的荧光强度,计算结合常数。
评估CAL和HES对副猪嗜血杆菌感染小鼠的保护作用。
小鼠分组后灌胃或腹腔注射CAL/HES,然后感染副猪嗜血杆菌,观察生存率、肺细菌载量、组织病理和炎症因子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 肉桂醛 | -- | -- |
| 橙皮素 | -- | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 培养基 | 胰酪大豆肉汤 | -- | -- |
| 胰酪大豆琼脂 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 | -- | -- | |
| 试剂 | 氨苄西林 | -- | -- |
| 头孢他啶 | -- | -- | |
| 头孢曲松 | -- | -- | |
| 头孢唑肟 | -- | -- | |
| 美罗培南 | -- | -- | |
| 阿米卡星 | -- | -- | |
| 卡那霉素 | -- | -- | |
| 四环素 | -- | -- | |
| 多西环素 | -- | -- | |
| 泰万菌素 | -- | -- | |
| 甲砜霉素 | -- | -- | |
| 生物膜实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 乙酸 | -- | -- | |
| eDNA提取 | TIANamp细菌DNA提取试剂盒 | Tiangen Biotech Co. Ltd. | -- |
| 蛋白质测定 | BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 铁测定 | 总铁比色测定试剂盒 | Elabscience | E-BC-K139-M |
| 亚铁比色测定试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript™反转录试剂盒 | Takara | -- |
| qRT-PCR | PrimeScript™一步法RT-PCR试剂盒 | Takara | -- |
| 仪器 | NanoDrop2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 电导率测定 | 电导率仪TCD1 | Leici | -- |
| SEM | Nano SEM-450扫描电镜 | FEI Company | -- |
| CLSM | 共聚焦激光扫描显微镜A1+/A1R+ | Nikon | -- |
| Live/dead染色 | 活/死细菌染色试剂盒 | Solarbio | EX3000 |
| 荧光光谱 | RF-6000荧光分光光度计 | Shimadzu | -- |
| 蛋白表达纯化 | His Trap柱 | -- | -- |
| Ni2+柱 | -- | -- | |
| 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷 | -- | -- | |
| 动物实验 | 羧甲基纤维素钠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外药敏试验 | CAL和HES的MIC值、抗生素MIC值、FICI值 阅读提示:Methods: In vitro susceptibility testing; Results: In vitro susceptibility testing |
| 时间-杀菌实验 | 浓度范围、孵育时间、OD600测定 阅读提示:Methods: Time-kill assay; Results: Time-kill curves of CAL and HES |
| 生物膜形成实验 | 浓度、培养时间、结晶紫染色OD570值 阅读提示:Methods: Biofilm biomass assessment; Results: Effect of CAL and HES on biofilm formation |
| qRT-PCR基因表达 | 药物浓度、内参基因、引物序列、PCR条件 阅读提示:Methods: Expression levels of QseBC related genes; Table S1 |
| 小鼠感染模型 | 小鼠品系、性别、周龄、剂量、给药途径、感染剂量、观察时间、细菌载量、炎症因子 阅读提示:Methods: Protective effect of CAL and HES on G. parasuis infection; Results: Protective effect of CAL and HES on G. parasuis infection |
| 荧光猝灭实验 | 蛋白浓度、配体浓度、激发/发射波长、结合常数 阅读提示:Methods: Interaction of CAL and HES with QseC protein; Results: Fluorescence quenching spectra |