细胞培养与脂毒性模型建立
建立Cd和FFA诱导的HepaRG细胞脂毒性模型,用于研究MLT的修复作用。
HepaRG细胞培养于含补充物的William's E培养基中,用50 μM CdCl2预处理24小时,随后用200 μM OA和/或PA处理48小时,同时添加或不添加50 nM MLT。
Melatonin Repairs the Lipidome of Human Hepatocytes Exposed to Cd and Free Fatty Acid-Induced Lipotoxicity.
包含细胞模型(HepaRG)的脂毒性处理与MLT干预,脂质组学(LC-Q/TOF)分析,及siRNA和药理学抑制剂验证SCD1机制,多层次证据。
HepaRG人肝细胞系
细胞系:HepaRG(Thermo Scientific),传代10-15 处理:50 μM CdCl2预处理24小时,200 μM FFA(OA/PA)处理48小时 MLT浓度:50 nM,与FFA共处理 SCD1沉默:siRNA(50 nM)转染5小时 SCD1抑制剂:A-939572(6 nM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立Cd和FFA诱导的HepaRG细胞脂毒性模型,用于研究MLT的修复作用。
HepaRG细胞培养于含补充物的William's E培养基中,用50 μM CdCl2预处理24小时,随后用200 μM OA和/或PA处理48小时,同时添加或不添加50 nM MLT。
评估Cd和FFA处理及MLT对细胞脂肪堆积和脂毒性(H2O2产生、凋亡)的影响。
使用Oil Red O染色和流式细胞术(Nile Red)检测脂滴;使用比色法测定H2O2水平;使用Annexin V-FITC/PI染色检测凋亡。
全面分析不同处理条件下细胞脂质组的改变,并寻找MLT修复作用的分子靶点。
采用LC-Q/TOF质谱进行非靶向脂质组学分析,通过Bligh-Dyer法提取脂质,使用Lipid Annotator软件鉴定脂质,并进行多变量统计分析(PCA、PLS-DA)和通路富集分析。
基于脂质组学差异和通路富集结果,提出MLT作用机制假说(涉及FA延长和去饱和)。
利用MetaboAnalyst进行KEGG通路富集分析和生物功能注释分析,发现与脂肪酸代谢(如甘油磷脂代谢、不饱和脂肪酸合成)相关的通路显著富集,提出MLT可能通过调节SCD1活性发挥作用。
验证SCD1活性在MLT修复Cd和PA诱导脂毒性中的作用。
通过siRNA瞬时沉默SCD1基因表达和药理学抑制剂A-939572抑制SCD1活性,检测MLT对细胞脂肪变性(ORO染色)、H2O2产生和细胞活力(MTT)的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | William's E培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| GlutaMAX | Invitrogen | -- | |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 人胰岛素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氢化可的松21-半琥珀酸酯 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞处理 | 褪黑素 | Sigma-Aldrich | M5250 |
| 油酸 | Sigma-Aldrich | O1008 | |
| 棕榈酸 | BioXtra | P5585 | |
| 脂滴分析 | 油红O溶液 | -- | -- |
| 尼罗红溶液 | Cayman Chemicals | -- | |
| H2O2检测 | H2O2比色检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A21 |
| 脂质提取 | SPLASH脂质组质谱标准品 | AVANTI | 330707-1EA |
| 甲醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| LC-MS分析 | 安捷伦1290 Infinity液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| Zorbax Eclipse Plus C18色谱柱 | Agilent | -- | |
| 安捷伦6560 IM-QTOF质谱仪 | Agilent | -- | |
| 醋酸铵 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | 抗SCD1一抗 | Cell Signalling Technology | 2438 |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔二抗 | Cell Signalling Technology | 7074 | |
| ECL Clarity化学发光检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 机制验证 | SCD1人siRNA寡核苷酸双链体 | OriGene Technologies | Locus ID 6319 |
| A-939572 | Cayman Chemical | -- | |
| 脂滴观察 | EVOS XL Core成像系统 | Thermo Fisher | -- |
| 流式分析 | BD Accuri C6 Plus流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 吸光度检测 | DTX880多功能酶标仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系:HepaRG(Thermo Scientific);培养基成分:William's E、1% GlutaMAX、10% FBS、5 μg/mL人胰岛素、50 μM氢化可的松21-半琥珀酸酯;传代数:10-15;处理:50 μM CdCl2预处理24小时,200 μM OA和/或PA处理48小时,MLT 50 nM与FFA共处理;溶剂:OA溶于DMSO。 阅读提示:见材料与方法2.1节及图1A。 |
| 脂滴分析 | ORO染色步骤(固定、洗涤、异丙醇孵育、染色、洗涤);Nile Red定量检测(Cell-Based Assay Nile Red Solution),流式细胞仪(BD Accuri C6 Plus)。 阅读提示:见材料与方法2.2节。 |
| H2O2检测 | 使用Elabscience比色试剂盒,在405 nm处测量吸光度。 阅读提示:见材料与方法2.3节。 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒(E-CK-A21),流式细胞仪检测。 阅读提示:见材料与方法2.4节。 |
| 脂质组学分析 | 细胞数量:1×10^6;内标:SPLASH Lipidomix;LC条件:Agilent 1290 Infinity,C18柱(1.8 μm, 2.1×50 mm, 95Å),流动相A(水/甲醇9:1,含10 mM醋酸铵),B(乙腈/甲醇/异丙醇2:3:5),流速450 μL/min;MS条件:Agilent 6560 IM-QTOF,正负离子模式,全扫描m/z 100-1700,MS2碰撞能20 eV;数据过滤:质量偏差<10 ppm,总体得分>75%。 阅读提示:见材料与方法2.5-2.6节。 |
| SCD1机制验证 | siRNA转染浓度50 nM,转染时间5小时(在Cd预处理后);SCD1抑制剂A-939572浓度6 nM;Western blot检测SCD1蛋白表达(一抗#2438,二抗#7074)。 阅读提示:见材料与方法2.9节及图8。 |