LIT制造与自组装验证
验证自组装GRASPs在毛细管内的稳定性,确保可经受多次洗涤循环
将编码GRASPs自组装到改性石英毛细管中,通过高速吸液(50 μl/s)处理不同缓冲液(PBST和血清)30分钟,评估GRASPs保留率,并测试不同洗涤循环后的损失情况。
Lab-in-a-Tip: a multiplex immunoassay platform based on a self-assembled barcoded protein array.
包含体外模型(细胞因子标准品和血清样本)及多种验证实验,涵盖自组装稳定性、参数优化、特异性、稳定性、灵敏度比较和临床样本相关性分析,并涉及机制讨论(扩散边界层理论)。
IL-8单重LIT 六重LIT(IL-1β、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、GM-CSF) 患者血清样本 Luminex和ELISA对比体系
LIT自组装稳定性(高速吸液50 μl/s下不同缓冲液和血清中GRASPs保留率>90%) 检测抗体和SAPE最佳浓度(均为5 μg/ml) 标准曲线拟合模型(五参数逻辑回归) LOD和LOQ定义(mean(blank)+3σ和mean(blank)+10σ) 样本孵育体积(标准LIT为50 μl,Microvolume LIT为10 μl)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证自组装GRASPs在毛细管内的稳定性,确保可经受多次洗涤循环
将编码GRASPs自组装到改性石英毛细管中,通过高速吸液(50 μl/s)处理不同缓冲液(PBST和血清)30分钟,评估GRASPs保留率,并测试不同洗涤循环后的损失情况。
确定最佳检测抗体和SAPE浓度,以优化荧光信号和信噪比
使用IL-8单重LIT,分别测试不同浓度的生物素化检测抗体(0.5-6 μg/ml)和SAPE(0.5-6 μg/ml),测量MFI、背景信号和信噪比,确定最佳浓度。
验证单重LIT的检测性能,并与传统悬浮GRASPs检测比较
建立IL-8单重LIT标准曲线,计算LOD和LOQ,并与悬浮GRASPs检测比较LOD、LOQ、线性范围和CV。
评估六重LIT的特异性、交叉反应性和多重检测能力
制备六重LIT(IL-1β、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、GM-CSF),单独检测每个分析物(1 ng/ml)以评估交叉反应,检测混合分析物以评估多重性能,建立标准曲线。
验证LIT在储存条件下的稳定性
制备针对IL-5和IL-8的两重LIT,在-20°C避光储存,定期(初始、1天、1周、每月至6个月)检测高低中浓度(1000, 200, 40 pg/ml)的MFI,评估CV。
针对不同应用场景开发Ultrasensitive、Speedy和Microvolume LIT模式,并验证其性能
Ultrasensitive LIT引入TSA信号放大系统,检测极限达fg/ml;Speedy LIT压缩总孵育时间至15分钟;Microvolume LIT将样本体积降至10 μl。对比各模式的LOD和标准曲线。
评估LIT与现有金标准方法的性能差异
使用标准蛋白样品,在相同条件下与Luminex(LXSAHM-06试剂盒)和ELISA(NOVUS试剂盒)进行对比,比较LOD、LOQ、线性范围、动态范围等。
评估LIT在血清样本中的检测能力,并验证其与临床方法的相关性
使用不含细胞因子的血清基质建立标准曲线,进行添加回收实验;收集患者血清样本,分别用LIT、Luminex、ELISA和化学发光法检测六种细胞因子,比较检测率和浓度相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| GRASPs表面修饰 | Protein LoBind微量离心管 | Eppendorf | 022431081 |
| 95%乙醇 | SCR | 10009218 | |
| 3-氨丙基二甲基乙氧基硅烷 | J&K | 3069-29-2 | |
| 琥珀酸酐 | J&K | 185369 | |
| 2-(N-吗啉)乙磺酸 | ThermoFisher | 28390 | |
| N-羟基琥珀酰亚胺 | -- | -- | |
| 1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺 | ThermoFisher | 229801 | |
| 乙酸钠 | Sigma Aldrich | 127-09-3 | |
| IL-4捕获抗体 | R&D | MAB604-500 | |
| IL-6捕获抗体 | R&D | MAB206-500 | |
| IL-1β捕获抗体 | R&D | MAB601-500 | |
| GM-CSF捕获抗体 | R&D | MAB615 | |
| IL-8捕获抗体 | R&D | MAB208-500 | |
| IL-5捕获抗体 | R&D | MAB405-500 | |
| 磷酸盐吐温缓冲液 | ThermoFisher | 28360 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | 9048-46-8 | |
| GRASPs质量控制 | PE标记的山羊抗大鼠IgG (H+L) | Invitrogen | PA1-29628 |
| R-藻红蛋白标记的山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | P852 | |
| LIT制造 | 方毛细管 | Vitrocom | 8270 |
| 乳胶管 | OUPLI | -- | |
| 链霉亲和素-藻红蛋白 | ThermoFisher | SA10044 | |
| LIT参数优化 | IL-8检测抗体 | R&D | BAF208 |
| 免疫分析 | 人IL-8蛋白 | R&D | 208-IL-010 |
| 人IL-1β蛋白 | R&D | 201-LB-005 | |
| 人IL-4蛋白 | R&D | 204-IL-010 | |
| 人IL-5蛋白 | R&D | 205-IL-005 | |
| 人IL-6蛋白 | R&D | 206-IL-010 | |
| 人GM-CSF蛋白 | R&D | 215-GM-010 | |
| IL-1β检测抗体 | R&D | BAF201 | |
| IL-4检测抗体 | R&D | BAF204 | |
| IL-5检测抗体 | R&D | BAM6051 | |
| IL-6检测抗体 | R&D | BAF206 | |
| GM-CSF检测抗体 | R&D | BAF215 | |
| Luminex人预混多分析物试剂盒 | Luminex | LXSAHM-06 | |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | NOVUS | VAL101 | |
| 人IL-4 ELISA试剂盒 | NOVUS | VAL123 | |
| 人IL-5 ELISA试剂盒 | NOVUS | VAL125 | |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | NOVUS | VAL102 | |
| 人IL-8 ELISA试剂盒 | NOVUS | VAL103 | |
| 人GM-CSF ELISA试剂盒 | NOVUS | VAL124 | |
| Ultra-sensitive LIT | 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | Elabscience | E-AB-1043 |
| 生物素-酪胺 | Sigma Aldrich | 41994-02 | |
| 血清基质实验 | 去除细胞因子的人血清基质 | SANTA SCOTT | S-4SP1 |
| 患者血清采集 | 无添加剂的采血管 | BD | 367812 |
| 悬浮GRASPs检测 | 摇床 | Grant-bio | V-32 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| GRASPs修饰与自组装 | GRASPs浓度(5×10^5 particles/ml),洗涤条件(95%乙醇、DMF等),偶联抗体量(10 μg),孵育温度和时间(4°C过夜),毛细管预处理(5% APDMS、2.5%戊二醛) 阅读提示:Methods: Design, fabrication, and modification of GRASPs; Fabrication of LITs |
| LIT参数 | 检测抗体最佳浓度(5 μg/ml),SAPE最佳浓度(5 μg/ml),吸液速率(50 μl/s),孵育时间(样本40分钟,检测抗体12分钟,SAPE 8分钟) 阅读提示:Methods: Optimization of LIT parameters; Immunoassays with standard LITs |
| 标准LIT免疫分析 | 样本体积(50 μl),标准蛋白浓度梯度(0.64 pg/ml至10 ng/ml),洗涤步骤(PBST洗1分钟),成像至少50个微粒每个编码类型 阅读提示:Methods: Immunoassays with standard LITs |
| 六重LIT | 每个编码类型的GRASPs数量(1900个),混合后调整浓度至总微粒约11200,特异性实验分析物浓度1 ng/ml,混合分析物浓度范围 阅读提示:Methods: Fabrication of LITs; Immunoassays with standard LITs (six-plex) |
| Speedy LIT | 总孵育时间15分钟(样本8分钟,检测抗体4分钟,SAPE 3分钟,每步洗1分钟) 阅读提示:Methods: Immunoassays with three modes of LITs (Speedy LIT) |
| Microvolume LIT | 样本体积10 μl或25 μl,其他步骤同标准LIT 阅读提示:Methods: Immunoassays with three modes of LITs (Microvolume LIT) |
| Ultrasensitive LIT | SA-HRP浓度(0.5 μg/ml),biotin-tyramine浓度(4 μg/ml),H2O2浓度(0.003%),额外步骤孵育时间(10分钟和2分钟) 阅读提示:Methods: Immunoassays with three modes of LITs (Ultrasensitive LIT) |
| 与Luminex和ELISA对比 | Luminex试剂盒(LXSAHM-06)按说明书操作,每个细胞因子至少100颗微珠;ELISA试剂盒按说明书标准曲线 阅读提示:Methods: Immunoassay with Luminex kit; Immunoassay with ELISA kit |
| 血清样本检测 | 血清基质(细胞因子去除人血清),添加回收浓度(1000, 200, 40 pg/ml),患者血清采集和保存(-80°C) 阅读提示:Methods: Effects of serum matrix on LITs; Patient serum acquisition |