血浆分级分离分析
研究proMMP2和APOA1在血浆中的共定位。
使用FPLC SEC对人类和小鼠血浆进行分级分离,通过明胶酶谱检测proMMP2,Western blot检测APOA1。
Apolipoprotein-A1 transports and regulates MMP2 in the blood.
包括AlphaFold2建模、多种体外相互作用测定(MST、VICA、热稳定性、化学交联)、酶活性测定、以及人类和小鼠血浆的FPLC SEC分析。
人类血浆样本 小鼠血浆样本(WT和APOA1敲除小鼠) 重组人MMP2蛋白 HDL(人血浆纯化的高密度脂蛋白)
APOA1与MMP2之间的高亲和力结合(Kd约58.3 nM) APOA1对MMP2自溶的抑制作用(浓度依赖性) APOA1对MMP2蛋白水解活性的变构增强(Vmax增加约300%) APOA1敲除小鼠血浆无法增强MMP2活性(对照WT小鼠有效)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究proMMP2和APOA1在血浆中的共定位。
使用FPLC SEC对人类和小鼠血浆进行分级分离,通过明胶酶谱检测proMMP2,Western blot检测APOA1。
预测APOA1与MMP2之间的相互作用界面。
使用AlphaFold2软件基于APOA1结构(PDB: 1AV1)预测APOA1与MMP2的复合物结构。
验证APOA1与MMP2的直接结合。
使用微量热泳动(MST)、视觉干扰颜色测定(VICA)、热稳定性测定和化学交联实验检测APOA1与MMP2的相互作用。
检验APOA1对MMP2蛋白水解活性的影响。
使用FITC-明胶裂解测定法测量MMP2活性,在APOA1存在下进行剂量-反应分析。
评估APOA1对MMP2自溶的抑制作用。
将MMP2与APOA1或HDL共孵育,通过明胶酶谱检测未自溶的MMP2量。
验证血浆中APOA1增强MMP2活性的能力。
将FPLC SEC分级分离的人或小鼠血浆级分加入重组人MMP2,测量FITC-明胶裂解活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白纯化 | 高密度脂蛋白 | Sigma-Aldrich | 437641-10MG |
| 载脂蛋白A1 | Sigma-Aldrich | 178452-500μg | |
| 重组人APOA1 6xHis标签 | Acrobiosystems | AP1-H5225 | |
| 活性重组人MMP2 | Sigma-Aldrich | SRP3118-10μg | |
| MMP2催化域 | Enzo life sciences | BML-SE237-0010 | |
| Fib-PEX | ElabScience | PDEH100254 | |
| MMP2 PEX域 | GiottoBiotech | G04MP02H | |
| TIMP2 | Sigma-Aldrich | SRP3174-10μg | |
| 血浆分级分离 | Superose 6 Increase 10/300凝胶过滤FPLC柱 | Cytiva Life Sciences | -- |
| Sekisui甘油三酯-SL试剂 | Sekisui Diagnostics | -- | |
| Sekisui胆固醇试剂 | Sekisui Diagnostics | -- | |
| 相互作用测定 | Monolith NT.115优质毛细管 | NanoTemper | -- |
| RED-tris-NTA第二代His标签标记试剂盒 | NanoTemper | -- | |
| BS3交联剂 | -- | -- | |
| MMP2活性测定 | FITC标记明胶 | Thermofisher Scientific | D12054 |
| 蛋白检测 | APOA1抗体 | Abcam | Ab7614 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 血浆分级分离 | 人血浆或小鼠血浆的供体数量、体积、FPLC柱平衡和流速 阅读提示:Methods: Fractionation profiles of plasma lipoproteins... ; Figure 1B, C |
| 体外结合实验 | APOA1和MMP2的浓度、缓冲液成分(Ca2+存在与否)、温度 阅读提示:Methods: Microscale thermophoresis (MST) to study APOA1–MMP2 interaction ; Figure 3 |
| MMP2活性测定 | MMP2浓度、APOA1浓度、底物浓度、反应时间 阅读提示:Methods: Detection and quantitation of MMP2 protein... ; Figure 5, 6 |
| MMP2自溶测定 | MMP2浓度、APOA1浓度、孵育温度和时间 阅读提示:Methods: Detection and quantitation of MMP2 protein... ; Figure 4 |
| 血浆生物测定 | 人血浆或小鼠血浆(WT或APOA1 KO)的供体数量、FPLC SEC级分、重组MMP2浓度 阅读提示:Methods: Fractionation profiles... ; Figure 7 |