建立Fbxw7敲除小鼠模型
验证Fbxw7缺失是否导致NPHP样病理
使用Cdh16Cre小鼠在肾脏上皮细胞中条件性敲除Fbxw7,观察不同年龄(1、3、7、10个月)的病理变化。
SOX9-dependent fibrosis drives renal function in nephronophthisis.
包含小鼠模型、细胞模型、患者样本及蛋白质组学等多层级证据,并进行了功能验证和机制研究。
Cdh16Cre;Fbxw7f/f小鼠 Fbxw7-null mIMCD3细胞 CaggCreERT2;Ift88f/f小鼠 NPHP1缺失患者肾活检样本
小鼠模型:Cdh16Cre驱动Fbxw7敲除,观察时间为1、3、7、10个月 药物处理:他莫昔芬诱导CaggCreERT2,剂量6mg/40g体重,连续3天 细胞模型:mIMCD3细胞,Fbxw7敲除克隆,血清饥饿48小时 肾功能指标:血清BUN、肌酐、胱抑素C 纤维化指标:Masson三色染色、COL1A1、α-SMA
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Fbxw7缺失是否导致NPHP样病理
使用Cdh16Cre小鼠在肾脏上皮细胞中条件性敲除Fbxw7,观察不同年龄(1、3、7、10个月)的病理变化。
检测囊肿形成是否伴随细胞增殖和死亡变化
通过Ki67、EdU、磷酸化组蛋白H3染色检测增殖,TUNEL染色检测细胞死亡。
检测Fbxw7缺失是否引起炎症和纤维化
通过F4/80染色检测巨噬细胞浸润,Masson三色染色、COL1A1和α-SMA免疫荧光检测纤维化。
鉴定Fbxw7缺失后差异表达蛋白,寻找机制
对Fbxw7-null和野生型mIMCD3细胞进行定量蛋白质组学分析,鉴定显著变化的蛋白。
确认Fbxw7缺失是否导致纤毛缺陷和TMEM237下调
检测小鼠肾脏和细胞中的纤毛长度和数量,以及TMEM237蛋白表达。
确定SOX9和c-MYC是否介导NPHP样表型
生成Cdh16Cre;Fbxw7f/f;Sox9+/f和Cdh16Cre;Fbxw7f/f;c-Myc+/f小鼠,评估表型变化。
验证SOX9在人类NPHP中的表达
对NPHP1突变患者肾活检样本和Ift88突变小鼠肾脏进行SOX9染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠模型 | Cdh16Cre小鼠 | Jackson Labs | 012237 |
| Cagg-CreERT2小鼠 | Zimmerman/Jackson Labs | 004682 | |
| Fbxw7f/f小鼠 | Jackson Labs | 017563 | |
| Sox9f/f小鼠 | Jackson Labs | 013106 | |
| c-Mycf/f小鼠 | Cai/MMRC/Jackson Labs | 032046-JAX | |
| Ift88f/f小鼠 | Zimmerman/Jackson Labs | 022409 | |
| RosamT/mG小鼠 | Zimmerman/Jackson Labs | 007676 | |
| 细胞培养 | IMCD3小鼠上皮细胞系 | ATCC | CRL-2123 |
| HEK293T人细胞系 | ATCC | CRL-3216 | |
| 组织处理 | 10%福尔马林 | Sigma-Aldrich | HT501128 |
| 细胞培养 | DMEM/F-12, GlutaMAX™添加剂 | ThermoFisher Scientific | 10565018 |
| DMEM培养基 | Corning | 10-013-CV | |
| 胎牛血清 | Bio-Techne Corporation | S11150 | |
| 胰蛋白酶 | ThermoFisher Scientific | 25200056 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Corning | 21-040-CV | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | ThermoFisher Scientific | 15596026 |
| 肾功能检测 | 小鼠/大鼠胱抑素C定量ELISA试剂盒 | Bio-Techne Corporation | MSCTC0 |
| 尿素氮(BUN)比色检测试剂盒 | Invitrogen | EIABUN | |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL原位凋亡试剂盒(红色,Elab Fluor® 647) | elabscience | E-CK-A324 |
| 免疫荧光 | ProLong™ Diamond抗淬灭封片剂(含DAPI) | Invitrogen™ | P36971 |
| 免疫印迹 | 乙酰化α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T6793 |
| 增殖检测 | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| 炎症检测 | AF647偶联F4/80抗体 | Invitrogen | MF48021 |
| 免疫荧光 | NKCC2抗体 | ThermoFisher | PA5142445 |
| 增殖检测 | 磷酸化组蛋白H3抗体 | Cell Signaling | 9701 |
| 纤维化检测 | COL1A1抗体 | Cell Signaling | 72026 |
| α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Cell Signaling | 19245 | |
| 免疫荧光 | ATP1A1抗体 | Abcam | ab7671 |
| SOX9抗体 | Sigma-Aldrich | AB5535 | |
| 免疫印迹 | c-MYC抗体 | Cell Signaling | 9402 |
| 免疫荧光 | TMEM237抗体 | ThermoFisher | PA5-63013 |
| 荧光素标记的LTA | Vector Laboratories | FL-1321 | |
| Cy5标记的LTA | USBIO | 518482 | |
| 罗丹明标记的DBA | Vector Laboratories | RL-1032-2 | |
| 免疫印迹 | FBW7抗体 | Abnova | H00055294-B01P |
| FBW7抗体 | Bethyl | A301-720A | |
| FBW7抗体 | Bethyl | A301-721A | |
| β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 药物处理 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 蛋白质组学 | Orbitrap Exploris 480质谱仪 | Thermo | -- |
| UltiMate 3000 RSLCnano系统 | Thermo | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 小鼠基因型、Cre驱动方式、年龄时间点 阅读提示:Methods: Mouse models, tissue processing, and serum analysis |
| 肾功能检测 | 血清BUN、肌酐、胱抑素C水平 阅读提示:Methods: Mouse models, tissue processing, and serum analysis; Figure 1C-E |
| 组织学染色 | Masson三色、COL1A1、α-SMA、F4/80染色条件 阅读提示:Methods: Immunofluorescence, TUNEL, and microscopy; Figure 4 |
| 细胞培养与敲除 | mIMCD3细胞培养条件、Fbxw7敲除克隆验证 阅读提示:Methods: Cell culture and generation of Fbxw7-null mIMCD3 cells |
| 蛋白质组学 | 质谱参数、数据归一化和统计阈值 阅读提示:Methods: Proteomic screen in mIMCD3 cells |