验证Viperin在CVB3诱导AHF中的必要性
确定Viperin是否介导CVB3诱导的心脏功能障碍和AHF
利用Viperin敲除小鼠和野生型小鼠,感染CVB3后检测心脏功能(LVEF、LVFS、E/A比值)和血清BNP水平;通过AAV9载体实现心脏特异性Viperin过表达,观察其对小鼠心脏功能的影响;并比较CVB3阳性心衰患者与非心衰患者血清Viperin蛋白水平。
Targeting Viperin prevents coxsackievirus B3-induced acute heart failure.
包含细胞实验、Viperin敲除小鼠、心脏特异性过表达模型、患者样本及定量蛋白组学,并进行功能与机制验证(STAT1泛素化、UBE4A切割)。
HL-1心肌细胞 Viperin敲除(Viperin-/-)C57BL/6小鼠 心脏特异性Viperin过表达(AAV9-cTNTp-Viperin)小鼠 CVB3阳性患者血清样本
CVB3感染剂量:2×10^5 PFU/g体重,腹腔注射,感染7天 AAV9-cTNTp-Viperin注射剂量:6×10^11 vg/小鼠,尾静脉注射,14天后检测 VS-IP1干预剂量:5 mg/kg,腹腔注射,感染前12小时给药 干扰肽处理浓度:200 μM shRNA序列:shViperin #1 TAGCTACCAAGAGGAGAAA;shSTAT1 ACAGAAATACACCTACGAA
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Viperin是否介导CVB3诱导的心脏功能障碍和AHF
利用Viperin敲除小鼠和野生型小鼠,感染CVB3后检测心脏功能(LVEF、LVFS、E/A比值)和血清BNP水平;通过AAV9载体实现心脏特异性Viperin过表达,观察其对小鼠心脏功能的影响;并比较CVB3阳性心衰患者与非心衰患者血清Viperin蛋白水平。
探究Viperin是否调控SGK1及其下游信号
在HL-1细胞中敲低或过表达Viperin,检测SGK1蛋白和mRNA水平;在Viperin敲除细胞和心脏特异性过表达小鼠中检测SGK1和膜KCNQ1水平。
确定Viperin降低STAT1是否是SGK1上调所必需
通过免疫共沉淀和质谱鉴定Viperin互作蛋白,利用STAT1敲除或敲低细胞验证其对SGK1表达的影响;检测Viperin对STAT1蛋白水平的影响。
揭示Viperin是否通过泛素-蛋白酶体途径降解STAT1及其E3连接酶
用MG132和CHX实验检测STAT1蛋白稳定性;检测STAT1泛素化水平;通过质谱筛选Viperin互作的E3连接酶,并验证UBR5对STAT1泛素化的影响。
阐明CVB3感染如何特异性地诱导Viperin蛋白表达
检测CVB3感染对Viperin泛素化和UBE4A、HAT1蛋白水平的影响;验证CVB3 3C蛋白酶对UBE4A的切割作用及关键氨基酸位点。
开发能够阻断Viperin-STAT1相互作用并预防CVB3诱导AHF的干扰肽
鉴定Viperin-STAT1相互作用的关键结构域;设计包含STAT1 704-750区域的DRI构象干扰肽;在细胞和动物模型中测试VS-IP1阻断STAT1降解和预防心脏功能异常的能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | GIBCO, Life Technologies | -- | |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| LongTrans 转染试剂 | Ucallm | -- | |
| 药物处理 | MG132 | Sigma | -- |
| 膜蛋白提取 | 膜和胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | 20127ES50 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green 荧光染料 | Selleck | -- |
| StepOne Plus 实时荧光定量PCR仪 | Applied Bioscience | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| ECL Prime 检测试剂 | Thermo Scientific | -- | |
| ELISA | BNP ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0204c |
| 人Viperin ELISA试剂盒 | FineTest | EH2283 | |
| 免疫沉淀 | Protein G-琼脂糖珠子 | Millipore | 16-266 |
| M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | A2220 | |
| Myc/HA磁珠 | Selleck | -- | |
| 抗体 | 抗Viperin抗体 | Abcam | ab107359 |
| 抗SGK1抗体 | Abcam | ab59337 | |
| 抗KCNQ1抗体 | Affinity | DF7568 | |
| 抗ATP1A1抗体 | Affinity | AF6109 | |
| 抗Flag抗体 | Sigma | F7425 | |
| 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 8826 | |
| 抗HA抗体 | Sigma | ab9110 | |
| 抗Myc抗体 | Abmart | M20002 | |
| 抗泛素抗体 | Santa Cruz | sc-8017 | |
| 抗UBE4A抗体 | Santa Cruz | sc-365904 | |
| 抗HAT1抗体 | Santa Cruz | sc-376268 | |
| 抗UBR5抗体 | Affinity | AF0268 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 体外泛素化实验 | E1连接酶 | Boston Biochem | E306 |
| E2连接酶 | Boston Biochem | E2-615 | |
| 泛素化偶联反应缓冲液 | Boston Biochem | SK-10 | |
| UBR5蛋白 | Cell Signaling Technology | 65344 | |
| GST pull-down | GST-STAT1重组蛋白 | MCE | HY-P73628 |
| GST重组蛋白 | MCE | HY-P70270 | |
| 干扰肽 | VS-IP1 | GL Biochem | -- |
| siRNA注射 | siSTAT1 | Chemshine | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型:CVB3感染 | 感染剂量:2×10^5 PFU/g体重,腹腔注射;感染时间:7天;小鼠品系:C57BL/6;周龄:6-8个月 阅读提示:Materials and methods: Mice, Viral infection in vivo; Fig. 1b-d |
| 心脏特异性Viperin过表达 | AAV9载体剂量:6×10^11 vg/小鼠;注射途径:尾静脉;检测时间:14天后;心肌特异性启动子:cTNTp 阅读提示:Materials and methods: Cardiomyocyte-specific gene expression by AAV9; Fig. 1h-j |
| 细胞模型:Viperin敲除/敲低 | 细胞系:HL-1;敲低方法:shRNA(序列见正文);敲除方法:CRISPR-Cas9(gRNA序列见补充信息);CVB3感染MOI=10,处理12小时 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, CRISPR-Cas9-mediated genome editing; Fig. 2c |
| 干扰肽(VS-IP1)干预实验 | 细胞处理浓度:200 μM;动物给药剂量:5 mg/kg,腹腔注射;给药时间:感染前12小时;CVB3感染剂量:2×10^5 PFU/g体重,7天 阅读提示:Materials and methods: IPs; Fig. 6d-k |
| STAT1泛素化检测 | MG132浓度:10 μM,处理4小时;CHX浓度:50 μg/mL,处理0, 12, 36小时;检测方法:免疫沉淀后Western blot 阅读提示:Materials and methods: In vivo ubiquitination assay, CHX pulse chase assay; Fig. 4a-c |