人类AD脑组织脂滴沉积及转录组分析
验证AD患者脑内中性脂滴积累及星形胶质细胞脂质代谢基因的表达变化。
对AD患者和正常对照脑组织进行Oil Red O染色,分析snRNA-seq数据(GSE157827)中星形胶质细胞亚群,鉴定SOAT1等脂滴相关基因表达。
SOAT1 dysregulation in astrocytes drives Blood-Brain barrier dysfunction and neuroinflammation in Alzheimer's disease
结合人类样本snRNA-seq、免疫荧光、体外BBB模型、5×FAD/APOE4/4小鼠模型、K604干预及行为学、代谢组学、电镜等多层级验证。
HCMECs/D3、HBVPs、SVG p12细胞组成的三重培养体外BBB模型 5×FAD小鼠模型 APOE4/4小鼠模型 iPSC来源内皮细胞构建的体外BBB模型
SOAT1表达水平通过过表达或siRNA敲低在SVG p12细胞中操作 体外BBB模型由HCMECs/D3、HBVPs和SVG p12细胞三重培养,TEER达到54.1±3.3 Ω·cm² K604给药剂量和途径(1 mg/kg/天鼻内给药,持续两周) 行为学测试方法(MWM、NOR、Y-maze、筑巢测试)及样本量(如n=6) BBB通透性检测使用4 kDa FITC-葡聚糖(30 μg/g尾静脉注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AD患者脑内中性脂滴积累及星形胶质细胞脂质代谢基因的表达变化。
对AD患者和正常对照脑组织进行Oil Red O染色,分析snRNA-seq数据(GSE157827)中星形胶质细胞亚群,鉴定SOAT1等脂滴相关基因表达。
验证星形胶质细胞SOAT1表达对BBB完整性和通透性的直接影响。
构建HCMECs/D3、HBVPs和SVG p12细胞三重培养的BBB模型,通过过表达或siRNA敲低SOAT1,测量TEER、FITC-葡聚糖和细胞因子通透性,并用BODIPY染色观察脂滴。
评估SOAT1抑制剂K604对AD模型小鼠BBB功能和认知行为的治疗效果。
对5×FAD和APOE4/4小鼠鼻内给予K604(1 mg/kg/天,两周),检测FITC-葡聚糖渗漏、星形胶质细胞反应性、炎症因子水平、脑细胞因子摄取,并进行MWM、NOR、Y-maze和筑巢测试评估认知功能。
探究AD小鼠脑内血管周围区域的代谢组变化,尤其是脂质代谢。
对5×FAD和WT小鼠脑组织进行BODIPY染色、bulk RNA-seq和空间代谢组学,分析血脂相关代谢物的区域分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| MEM非必需氨基酸 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| GlutaMAX添加剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Macgene | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 转染 | CALNP RNAi体外转染试剂 | D-Nano | DN001 |
| Neofect DNA转染试剂 | Neofect | TF201201 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | 逆转录第一链cDNA合成试剂盒 | Roche | 04897030001 |
| FastStart Essential DNA Green Master Mix | Roche | 06924204001 | |
| ELISA | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co. | -- |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co. | -- | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co. | -- | |
| 免疫染色 | 抗GFAP抗体 | Abcam | ab53554 |
| 抗SOAT1抗体 | Abcam | ab307597 | |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | ab178847 | |
| 抗CD31抗体 | Proteintech | 11265-1-AP | |
| 酪胺信号放大试剂盒 | Thermo Fisher | B40922 | |
| 体外BBB模型 | 多聚赖氨酸 | Corning | -- |
| Transwell小室 | Corning | -- | |
| TEER测量 | EVOM2电阻仪 | World Precision Instruments | -- |
| BBB通透性实验 | FITC-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 药物处理 | K604 | MedChemExpress | HY-100400A |
| 组织制备 | Leica CM1950冰冻切片机 | Leica Microsystems | -- |
| ITO涂层载玻片 | Bruker | -- | |
| 质谱成像 | timsTOF fleX MALDI 2质谱仪 | Bruker | -- |
| 实时荧光定量PCR | CFX Connect实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- |
| 荧光成像 | Xenogen IVIS成像系统 | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外BBB模型构建 | 细胞系来源和培养条件,细胞接种密度,TEER阈值 阅读提示:Methods 4.7和4.9 |
| SOAT1表达操作 | siRNA序列,转染试剂,转染时间,过表达质粒 阅读提示:Methods 4.6 |
| 药物处理 | K604剂量、给药途径、给药持续时间,溶剂组分 阅读提示:Methods 4.12 |
| BBB通透性检测 | FITC-葡聚糖分子量和浓度,尾静脉注射剂量,检测时间 阅读提示:Methods 4.13 |
| 行为学测试 | 测试设备参数,训练次数,测试时间,数据采集软件 阅读提示:Methods 4.14-4.16 |