孟德尔随机化分析
确定BCAAs与AIT之间的因果关系。
使用两样本MR分析,以BCAAs(Leu、Val、Ile)作为暴露,AIT作为结局,基于GWAS汇总数据进行因果推断。
Leucine enhances the cGAS-STING-NLRP3 pathway in autoimmune thyroiditis.
包含孟德尔随机化分析和体外细胞实验,但缺乏动物模型或患者验证,功能验证和机制验证均限于细胞水平。
Nthy-ori 3-1人甲状腺滤泡细胞系 LPS和NaI诱导的AIT细胞模型
AIT细胞模型:10 μg/mL LPS和100 mg/L NaI处理6小时 Leu处理:5 nM Leu(浓度待验证) Leu剥夺处理:无Leu培养基 检测指标:TNF-α、IL-6、TGF-β1、IL-1β、IL-18、ROS、LDH、MDA、SOD、凋亡、Sestrin2/p-mTOR、cGAS/STING/NLRP3通路蛋白
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定BCAAs与AIT之间的因果关系。
使用两样本MR分析,以BCAAs(Leu、Val、Ile)作为暴露,AIT作为结局,基于GWAS汇总数据进行因果推断。
建立体外AIT细胞模型,用于后续实验。
使用Nthy-ori 3-1细胞,以10 μg/mL LPS和100 mg/L NaI处理6小时诱导AIT模型。
探究Leu对AIT细胞炎症和损伤的影响。
在AIT细胞模型中,添加5 nM Leu或使用无Leu培养基进行剥夺处理,检测炎症因子、氧化应激和细胞损伤指标。
评估Leu对AIT细胞炎症反应的影响。
使用ELISA检测细胞培养上清中TNF-α、IL-6、TGF-β1、IL-1β、IL-18的水平。
评估Leu对AIT细胞氧化应激和细胞损伤的影响。
检测ROS水平(DCFH-DA探针)、LDH释放、MDA和SOD含量,反映氧化应激和细胞损伤。
探究Leu对Sestrin2/mTOR和cGAS-STING-NLRP3通路的影响。
通过Western blot检测Sestrin2、p-mTOR、cGAS、STING、NLRP3、GSDMD、Caspase-1的表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| 炎症因子检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EHC103a |
| IL-6 ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EHC007 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EHC002b | |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0253 | |
| 氧化应激检测 | 丙二醛(MDA)检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A003-1-2 |
| 总超氧化物歧化酶(SOD)检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A001-1-2 | |
| 细胞损伤检测 | 乳酸脱氢酶(LDH)细胞毒性检测试剂盒 | 碧云天生物 | C0016 |
| 氧化应激检测 | 活性氧(ROS)检测试剂盒 | 碧云天生物 | S0033S |
| Western blot | cGAS抗体 | 华安生物 | HA500023 |
| STING抗体 | Proteintech | 19851-1-AP | |
| NLRP3抗体 | Proteintech | 27458-1-AP | |
| Caspase-1抗体 | Diagbio | db3022 | |
| GSDMD抗体 | Diagbio | db7773 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系:Nthy-ori 3-1;培养条件:RPMI 1640培养基+10%胎牛血清,5% CO2;处理分组:对照组、AIT组(LPS 10 μg/mL + NaI 100 mg/L,6小时)、AIT+Leu组(加5 nM Leu)、AIT+Leu剥夺组(无Leu培养基);处理时间:6小时 阅读提示:Materials and methods, section 2.2.2 |
| 炎症因子检测 | ELISA检测TNF-α、IL-6、TGF-β1、IL-1β、IL-18;试剂盒品牌和货号;检测步骤(稀释、孵育、洗涤等) 阅读提示:Materials and methods, section 2.2.3 |
| 氧化应激与细胞损伤 | ROS检测:DCFH-DA探针浓度10 μmol/L,孵育20分钟;LDH释放:490 nm;MDA:530 nm;SOD:490 nm;试剂盒品牌和货号 阅读提示:Materials and methods, sections 2.2.4 and 2.2.5 |
| Western blot | 蛋白分离电压110V,10%凝胶,PVDF膜,5%脱脂牛奶封闭,一抗孵育过夜(4°C),HRP二抗1小时,ECL显色;抗体品牌和货号 阅读提示:Materials and methods, section 2.2.6 |