构建哮喘细胞模型
在体外模拟哮喘环境以研究其分子机制。
使用10 ng/mL IL-13处理人支气管上皮细胞16HBE 24小时,建立哮喘细胞模型。
EPAS1 amplifies asthma pathogenesis through JAK2/STAT3-mediated ferroptosis and inflammation.
包含生物信息学分析(GEO、WGCNA、PPI、ROC)和体外细胞实验(IL-13诱导16HBE模型,功能验证STAT3/EPAS1),但缺乏动物模型和体内验证。
人支气管上皮细胞系16HBE IL-13处理的16HBE细胞哮喘模型 GSE134544数据集(20个对照和41个哮喘样本)
IL-13处理浓度10 ng/mL,处理24小时 16HBE细胞转染si-STAT3和OE-EPAS1,转染后48小时再IL-13处理24小时 EdU孵育浓度为20 μM,孵育72小时 统计比较采用Student's t检验或单因素方差分析(ANOVA)与Tukey事后检验,P<0.05为显著性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体外模拟哮喘环境以研究其分子机制。
使用10 ng/mL IL-13处理人支气管上皮细胞16HBE 24小时,建立哮喘细胞模型。
评估IL-13处理及STAT3/EPAS1调控对细胞增殖的影响。
通过EdU染色检测细胞增殖,分析EdU阳性细胞比例。
评估IL-13处理及STAT3/EPAS1调控对炎症反应的影响。
使用ELISA检测细胞培养上清中IL-1β、IL-6、IL-18的水平。
评估IL-13处理及STAT3/EPAS1调控对铁死亡的影响。
检测GSH、SOD、MDA、ROS、Fe2+、Fe3+水平,以及GPX4的表达和线粒体超微结构。
验证STAT3对EPAS1的调控关系。
通过siRNA敲低和过表达质粒转染,检测STAT3和EPAS1的表达水平以及下游效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Excell Bio | FCS500 | |
| 细胞处理 | 白细胞介素-13 | Nearshore Protein | C01M |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 12566014 |
| 细胞增殖检测 | EdU染色增殖试剂盒 | Elabscience | E-CK-A376 |
| ELISA | 人IL-18 ELISA试剂盒 | Ruixin Bio | RX106154H |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Ruixin Bio | RX106152H | |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | Ruixin Bio | RX106126H | |
| GSH测量 | 微板法还原型谷胱甘肽检测试剂盒 | Jiancheng Bio | A006-2-1 |
| SOD活性检测 | SOD检测试剂盒 | Jiancheng Bio | A001-3 |
| MDA测量 | 丙二醛检测试剂盒 | Jiancheng Bio | A003-1 |
| 铁离子检测 | 比色法铁检测试剂盒 | Tongren Chemical | I291 |
| ROS测量 | 活性氧检测试剂盒 | Beibo | BB-47053 |
| 磷酸盐缓冲液 | Beyotime | C0221A | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018CN |
| 含dsDNase的逆转录试剂盒 | Biosharp | BL699A | |
| 2× SYBR Green qPCR预混液(High ROX) | Servicebio | MPC2208011 | |
| Western blot | 裂解缓冲液 | Biosharp | BL504A |
| SDS-PAGE凝胶(10%) | Servicebio | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L) | Zs-BIO | ZB-2305 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)HRP | Zs-BIO | ZB-2301 | |
| 化学发光试剂 | Biosharp | BL520B | |
| TEM | 环氧树脂 | Merck | 45359-1EA-F |
| 乙酸铀酰 | HEAD | SPI-02624 | |
| 柠檬酸铅 | HEAD | HD17800 | |
| 透射电子显微镜 | Philips | CM-100 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与模型诱导 | 细胞系16HBE,培养基DMEM,10% FBS,IL-13浓度10 ng/mL,处理时间24小时 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and treatment |
| 细胞转染 | si-NC、si-STAT3、OE-NC、OE-STAT3和OE-EPAS1,转染试剂Lipofectamine 2000,转染时间48小时 阅读提示:Materials and Methods: Cell transfection |
| 铁死亡检测 | GSH、SOD、MDA、ROS、Fe2+/Fe3+检测试剂盒,GPX4表达(qRT-PCR和Western blot),线粒体形态(TEM) 阅读提示:Materials and Methods: GSH measurement, SOD activity assay, MDA measurement, Ferrous and ferric ion measurement, ROS measurement, qRT-PCR, Western blot, TEM |
| 细胞活力与炎症检测 | EdU浓度20 μM,孵育时间72小时;ELISA检测IL-1β、IL-6、IL-18 阅读提示:Materials and Methods: EdU assay, ELISA |
| 统计分析 | Pearson相关分析,ROC曲线,Student's t检验或单因素方差分析(ANOVA)与Tukey事后检验,P<0.05为显著性 阅读提示:Materials and Methods: Statistical analysis |