体外细胞活力与功能实验
评估FX对卵巢癌细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用。
使用A2780和SKOV3细胞系,MTT法检测不同浓度FX处理24、48、72小时后的细胞活力;集落形成实验评估增殖;划痕愈合实验和Transwell实验评估迁移和侵袭。
Fucoxanthin from Laminaria japonica Targeting PANoptosis and Ferroptosis Pathways: Insights into Its Therapeutic Potential Against Ovarian Cancer.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、侵袭、凋亡、铁死亡检测)、蛋白质组学、分子对接、CETSA/DARTS靶点验证及体内异种移植模型验证。
A2780卵巢癌细胞系 SKOV3卵巢癌细胞系 A2780细胞异种移植裸鼠模型
FX浓度:10 μM和20 μM处理48小时;IC50在24、48、72小时分别为23.96/24.43、14.55/15.76、10.15/12.71 μM(A2780/SKOV3) 铁死亡抑制:Ferrostatin-1(1 μM)可逆转FX诱导的细胞死亡;检测Fe2+、MDA、ROS水平 AMPK/Nrf2/HMOX1通路:AMPK抑制剂Compound C(1 μM A2780,2 μM SKOV3)、Nrf2抑制剂ML-385(1 μM)、HMOX1抑制剂HO-1-i-1 体内模型:BALB/c裸鼠皮下注射2×10^6 A2780细胞,肿瘤体积达100 mm³后口服100 mg/kg FX,每两天一次,共14天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估FX对卵巢癌细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用。
使用A2780和SKOV3细胞系,MTT法检测不同浓度FX处理24、48、72小时后的细胞活力;集落形成实验评估增殖;划痕愈合实验和Transwell实验评估迁移和侵袭。
鉴定FX处理引起的差异表达蛋白,并预测相关信号通路。
A2780细胞经10或20 μM FX处理48小时后,进行TMT标记的LC-MS/MS分析,并进行GO、KEGG富集分析和PPI网络构建。
确定FX诱导卵巢癌细胞死亡的具体形式。
使用凋亡抑制剂Z-VAD-FMK、坏死性凋亡抑制剂Nec-1和铁死亡抑制剂Fer-1共处理,检测细胞活力;Annexin V/PI染色流式检测凋亡;Western blot检测相关蛋白;LDH释放检测。
验证FX是否诱导铁死亡及其特征性变化。
检测GPX4和SLC7A11蛋白表达,测量Fe2+、MDA、ROS水平,以及线粒体超微结构、线粒体ROS和线粒体膜电位(MMP)。
验证AMPK是FX的直接靶点,并阐明AMPK/Nrf2/HMOX1通路在FX诱导铁死亡中的作用。
通过分子对接预测FX与AMPK结合;使用CETSA和DARTS验证FX与AMPK的直接结合;使用AMPK抑制剂Compound C、Nrf2抑制剂ML-385和HMOX1抑制剂HO-1-i-1处理,检测相关蛋白表达和铁死亡标志物(ROS、Fe2+、MDA、MMP)。
评估FX在体内对卵巢癌肿瘤生长的抑制作用及其与铁死亡的关系。
将A2780细胞皮下接种至裸鼠右腋下,待肿瘤体积达100 mm³后,口服给予FX(100 mg/kg)或溶剂,每两天一次,共14天;测量肿瘤体积、重量及体重;IHC检测Ki67、SLC7A11、GPX4;Western blot检测p-AMPK、Nrf2、HMOX1;检测MDA水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | -- | -- |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Beyotime | -- |
| 细胞处理 | Z-VAD-FMK(凋亡抑制剂) | MedChemExpress | HY-16658B |
| Necrostatin-1(坏死性凋亡抑制剂) | MedChemExpress | HY-15760 | |
| Ferrostatin-1(铁死亡抑制剂) | MedChemExpress | HY-100579 | |
| Mito-TEMPO(线粒体ROS抑制剂) | MedChemExpress | HY-112879 | |
| ML385(Nrf2抑制剂) | MedChemExpress | HY-100523 | |
| Compound C(AMPK抑制剂) | MedChemExpress | HY-13418A | |
| Heme Oxygenase-1-IN-1(HMOX1抑制剂) | MedChemExpress | HY-111798 | |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | MedChemExpress | HY-D1055 |
| Western blot | GPX4抗体 | Cell Signaling Technology | 13116 |
| SLC7A11抗体 | Cell Signaling Technology | 5738 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 4249 | |
| 肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2548 | |
| HMOX1抗体 | Abmart | T55113 | |
| AMPK抗体 | Abmart | -- | |
| 磷酸化AMPKα (Thr172)抗体 | Abmart | TA3423 | |
| Nrf2抗体 | Abmart | T55136 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| Bcl-2抗体 | Abcam | ab182858 | |
| LC3-I/II抗体 | Abcam | ab48394 | |
| caspase-3抗体 | Abcam | ab32351 | |
| 微管蛋白抗体 | Abcam | ab179513 | |
| Fe2+检测 | 亚铁离子比色测定试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M |
| Fe2+检测(组织) | 铁检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K773-M |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | -- |
| MMP检测 | MitoProbe JC-1检测试剂盒 | Beyotime | C2006 |
| RT-qPCR | Hifair III第一链cDNA合成预混液 | Yeasen | 11137ES60 |
| Hieff UNICON通用蓝色qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen | 11184ES08 | |
| 透射电镜 | 日立HT7700透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 分子对接 | AutoDock 4.2 | -- | -- |
| 分子对接可视化 | PyMol 2.3.2 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:A2780和SKOV3;培养基:DMEM(Gibco)含10% FBS;培养条件:37°C、5% CO2 阅读提示:Methods 4.1 Cell Lines and Cell Culture |
| 细胞活力检测(MTT) | 细胞密度:8×10^3/孔(96孔板);FX浓度:0、2.5、5、10、15、20、40、60、80、100 μM;处理时间:24、48、72小时 阅读提示:Methods 4.3 Cell Viability Assay |
| 细胞死亡类型鉴定 | 抑制剂浓度:Z-VAD-FMK、Nec-1、Fer-1的具体浓度;FX浓度:10 μM和20 μM;处理时间:48小时 阅读提示:Results 2.3 及 Figure 3 图注 |
| 铁死亡表型检测 | Fer-1浓度:1 μM;检测指标:GPX4、SLC7A11蛋白表达、Fe2+、MDA、ROS;线粒体ROS(MitoSOX Red)、MMP(JC-1) 阅读提示:Results 2.4 和 2.5 及 Figure 4、5 图注 |
| AMPK/Nrf2/HMOX1通路验证 | 抑制剂浓度:Compound C(1 μM A2780,2 μM SKOV3)、ML-385(1 μM)、HO-1-i-1(未明确浓度);FX浓度:20 μM;处理时间:48小时 阅读提示:Results 2.6 及 Figure 6、7 图注 |
| 体内异种移植瘤模型 | 小鼠品系:BALB/c裸鼠(6周龄雌性);细胞接种量:2×10^6 A2780细胞;FX剂量:100 mg/kg口服,每两天一次,共14天;肿瘤体积测量公式 阅读提示:Methods 4.19 In Vivo Tumor Xenograft Model 和 Results 2.7 |
| 统计学分析 | 统计方法:单因素方差分析和t检验;p < 0.05为显著;数据表示为均值±SEM 阅读提示:Methods 4.21 Statistical Analysis |