rhFNP的表达与纯化
获得高纯度的重组人纤连蛋白肽(rhFNP)用于后续实验。
将优化合成的rhFNP cDNA序列克隆至pET-20b载体,转化E. coli BL21(DE3)/pLysS,高密度发酵后,通过CM阳离子交换层析纯化,并用SDS-PAGE、Western blot和HPLC验证纯度。
Anti photoaging mechanism of a novel recombinant human fibronectin peptide (rhFNP) derived from the extracellular matrix.
包含体外细胞实验(HaCaT、P815、RAW264.7、NHEK)、斑马鱼模型、KM小鼠光老化模型和转录组学分析,并进行了功能验证(粘附、迁移、脱颗粒、TNF-α)和机制验证(MMPs、胶原蛋白、转录组通路)。
HaCaT细胞 NHEK细胞 P815细胞 RAW264.7细胞 斑马鱼 KM小鼠光老化模型
细胞粘附实验:HaCaT细胞浓度(0, 0.2, 1.0 μg/mL rhFNP,10 μg/mL FN)和处理时间(4h) 细胞迁移实验:HaCaT细胞划痕实验,rhFNP浓度(0, 0.2, 1.0 μg/mL),时间(20, 40h) P815脱颗粒实验:C48/80浓度(20 μg/mL),处理时间(60 min),rhFNP浓度(0, 0.2, 1.0 μg/mL) RAW264.7 TNF-α分泌实验:LPS浓度(1 μg/mL),处理时间(24h),rhFNP浓度(0, 0.2, 1.0 μg/mL) NHEK光老化实验:UVB总辐射剂量(40 mJ/cm2),rhFNP浓度(0, 0.2, 1.0 μg/mL),检测时间点(48h和72h) 小鼠实验:UV辐射时间(每周5次,持续8周),rhFNP浓度(100 μg/mL和200 μg/mL),给药体积(0.2 mL/只/天) 转录组学分析:Illumina Novaseq 6000测序,GO和KEGG富集分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得高纯度的重组人纤连蛋白肽(rhFNP)用于后续实验。
将优化合成的rhFNP cDNA序列克隆至pET-20b载体,转化E. coli BL21(DE3)/pLysS,高密度发酵后,通过CM阳离子交换层析纯化,并用SDS-PAGE、Western blot和HPLC验证纯度。
评估rhFNP对HaCaT细胞粘附和迁移能力的影响。
使用结晶紫染色和细胞骨架染色(phalloidin和DAPI)检测细胞粘附面积;使用划痕实验评估细胞迁移。
评估rhFNP对C48/80诱导的P815细胞脱颗粒的抑制作用。
P815细胞经rhFNP或阳性对照(色甘酸钠)预处理,加入C48/80刺激,通过中性红染色观察脱颗粒,并检测β-氨基己糖苷酶释放。
评估rhFNP对LPS诱导的RAW264.7细胞分泌TNF-α的抑制作用。
RAW264.7细胞经rhFNP或地塞米松(DXMS)预处理,加入LPS刺激24小时,收集上清液,用ELISA检测TNF-α含量。
评估rhFNP对UVB诱导的NHEK细胞光老化损伤的保护作用。
NHEK细胞经UVB照射(40 mJ/cm2)后,给予rhFNP或维生素C(Vc)处理,采用RT-qPCR检测MMP1/3/9和Col1α1/3α1/LOR的mRNA水平,采用Western blot检测蛋白水平。
评估rhFNP对斑马鱼皮肤相关基因表达的影响。
斑马鱼幼鱼(4 dpf)暴露于不同浓度rhFNP 24小时,提取RNA,通过RT-qPCR检测col1α1和eln1的表达。
评估rhFNP对UV诱导的小鼠皮肤光老化的保护作用。
KM小鼠背部脱毛后,除对照组外,UV照射8周(每周5次,每次2小时)。从第3周开始,每日涂抹rhFNP(100或200 μg/mL)或Vc(40 mg/mL)0.2 mL。观察皮肤外观,并在第6周和第8周取皮肤组织进行组织学分析。
探索rhFNP对UV诱导的小鼠皮肤转录组的影响,揭示潜在机制。
提取小鼠皮肤RNA,构建cDNA文库,使用Illumina Novaseq 6000测序,进行差异表达基因分析、GO和KEGG富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| rhFNP表达与纯化 | pET-20b载体 | Invitrogen | -- |
| 大肠杆菌BL21(DE3)/pLysS | Invitrogen | -- | |
| 异丙基硫代半乳糖苷 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞粘附实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 鬼笔环肽 | Solarbio | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| MF53显微镜 | Mshot | -- | |
| 细胞迁移实验 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 脱颗粒实验 | 化合物48/80 | Sigma-Aldrich | -- |
| 中性红染料 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 色甘酸钠 | Macklin | -- | |
| β-氨基己糖苷酶A ELISA试剂盒 | Cusabio | -- | |
| 巨噬细胞实验 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | -- | |
| NHEK光老化实验 | 维生素C | -- | -- |
| 组织学分析 | OTC包埋剂 | Servicebio | -- |
| 伊红 | -- | -- | |
| Masson三色染色液 | -- | -- | |
| 转录组学分析 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Illumina Novaseq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| Western blot | COL1α1 (E8F4L) XP®兔单克隆抗体 | CST | -- |
| COL3α1 (E3K9U)兔单克隆抗体 | CST | -- | |
| His标签抗体 | Affinity | -- | |
| 兜甲蛋白多克隆抗体 | Proteintech | -- | |
| α-微管蛋白重组兔单克隆抗体 | Starter | -- | |
| 阳性对照 | 人纤连蛋白 | Yeasen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| rhFNP表达与纯化 | 表达载体、宿主菌、诱导条件、纯化方法 阅读提示:Methods 2.2;Results 3.1 |
| 细胞粘附与迁移实验 | 细胞类型、rhFNP浓度、FN浓度、处理时间 阅读提示:Methods 2.3;Figure 1 |
| 肥大细胞脱颗粒抑制实验 | 细胞类型、C48/80浓度、rhFNP浓度、处理时间、检测指标 阅读提示:Methods 2.4;Figure 2 |
| 巨噬细胞炎症因子抑制实验 | 细胞类型、LPS浓度、rhFNP浓度、DXMS浓度、处理时间、检测指标 阅读提示:Methods 2.5;Figure 2 |
| NHEK光老化模型实验 | 细胞类型、UVB剂量、rhFNP浓度、Vc浓度、检测时间点 阅读提示:Methods 2.6;Figure 3 |
| 斑马鱼实验 | 斑马鱼品系、日龄、rhFNP浓度、处理时间、检测基因 阅读提示:Methods 2.7;Figure 3 |
| KM小鼠光老化模型实验 | 动物品系、性别、周龄、体重、UV照射方案、rhFNP浓度、给药方式、剂量、检测时间点 阅读提示:Methods 2.8;Figures 4-6 |
| 转录组学分析 | 样本来源、测序平台、分析方法 阅读提示:Methods 2.8.2;Figure 6 |