体外发酵模型筛选菌株
筛选能够增加维生素D代谢物水平的益生菌菌株
利用粪便样本制备粪便悬液,与不同菌株在mGAM培养基中厌氧发酵24小时,检测上清液中25(OH)D和1,25(OH)2D浓度。
Bifidobacterium longum increases serum vitamin D metabolite levels and modulates intestinal flora to alleviate osteoporosis in mice.
包含体外发酵模型筛选菌株、小鼠疾病模型功能验证、micro-CT骨结构分析、血清生化检测、RT-qPCR基因表达分析及肠道菌群宏基因组分析等多个独立证据层级,并包含功能与机制验证。
体外粪便发酵模型 维A酸诱导的骨质疏松小鼠模型 C57BL/6J小鼠
小鼠品系:C57BL/6J,雄性,7周龄,体重约20±5g 骨质疏松诱导:200μL 90 mg/kg bw/day维A酸,口服灌胃,持续3周 干预处理:FSHHK13M1菌液浓度1×10^9 CFU/mL,VD组0.06 μg/kg bw/day维生素D,灌胃3周 样本量:每组8只小鼠,n=8 检测指标:micro-CT骨结构参数、血清25(OH)D和1,25(OH)2D水平、血清钙和ALP、OCN和PINP、RT-qPCR基因表达、肠道菌群宏基因组分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选能够增加维生素D代谢物水平的益生菌菌株
利用粪便样本制备粪便悬液,与不同菌株在mGAM培养基中厌氧发酵24小时,检测上清液中25(OH)D和1,25(OH)2D浓度。
评估FSHHK13M1对维A酸诱导的骨质疏松小鼠的影响
32只C57BL/6J小鼠适应性饲养后,随机分为4组,除对照组外,灌胃维A酸3周诱导骨质疏松,随后FSHHK13M1和VD干预3周,收集粪便、血清和骨骼样本。
评估小鼠股骨骨密度和微结构变化
使用micro-CT扫描小鼠胫骨,分析骨密度和骨微结构参数。
检测血清维生素D代谢物、钙、ALP、OCN和PINP水平
使用ELISA试剂盒和生化检测试剂盒检测小鼠血清中相关指标。
检测骨代谢相关通路基因的mRNA表达水平
从小鼠股骨提取RNA,逆转录为cDNA,用SYBR qPCR Mix进行实时定量PCR,检测VDR、Wnt10b、β-catenin、Osterix、Runx2、RANKL和OPG的表达。
分析小鼠肠道菌群组成和多样性变化
收集小鼠粪便,进行宏基因组测序,质控、去除人类序列,分析物种多样性、组成差异和相关性与生理生化指标的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体外发酵 | mGAM生长培养基 | -- | -- |
| 菌株培养 | MRS肉汤 | -- | -- |
| 生化分析 | 小鼠25(OH)D和1,25(OH)2D ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 血清钙和碱性磷酸酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 小鼠骨钙素和I型前胶原N端前肽ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | E-EL-M0864, E-EL-M0233 | |
| RT-qPCR | 逆转录试剂盒 | Vazyme | R433-01 |
| SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q712-02 | |
| QuantStudio 6 Flex实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| micro-CT | Lateta LCT200微型CT扫描仪 | Hitachi-Aloka | -- |
| micro-CT分析 | Analyze软件12.0版 | AnalyzeDirect | -- |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 菌株培养与制备 | 菌株培养条件、复苏次数、洗涤步骤、菌液浓度 阅读提示:Methods: Preparation of gavage strains for animal experiments |
| 体外发酵筛选 | 粪便悬液制备比例、mGAM培养基体积、菌液体积、孵育时间和厌氧条件 阅读提示:Methods: In vitro fermentation model screening strains |
| 动物模型建立与分组 | 小鼠品系、性别、周龄、体重、分组方式、RA剂量和灌胃时间、干预剂量和周期 阅读提示:Methods: Mice experimental design |
| micro-CT骨结构分析 | 扫描参数(电压、电流、剂量、视野、体素分辨率)、ROI定义、分析软件版本 阅读提示:Methods: Determination of structural indices of mouse femur |
| 血清生化指标检测 | ELISA试剂盒品牌和货号、样本处理、检测方法 阅读提示:Methods: Biochemical analysis |
| RT-qPCR基因表达 | 引物序列、内参基因、PCR程序、相对定量方法 阅读提示:Methods: RT-PCR of mouse bone metabolism related genes |
| 肠道菌群宏基因组分析 | 测序平台、质控标准、比对参考基因组、分析方法 阅读提示:Methods: Metagenomic data processing and quality control |