建立巨噬细胞内金黄色葡萄球菌感染模型
验证金黄色葡萄球菌能否在巨噬细胞内存活和增殖。
用GFP标记的金黄色葡萄球菌以MOI=10感染BMDMs,2小时后用庆大霉素清除胞外菌,观察24小时内胞内细菌增殖。
Staphylococcus aureus induces mitophagy via the HDAC11/IL10 pathway to sustain intracellular survival.
研究包含体外细胞模型(BMDMs)、蛋白质组学分析、功能验证(siRNA、过表达、抑制剂)和机制验证(Western blot、ChIP-qPCR)等多个证据层级。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 金黄色葡萄球菌NCTC8325感染模型
BMDMs感染金黄色葡萄球菌(MOI=10) 胞外菌清除:庆大霉素(200 µg/ml处理2小时,然后50 µg/ml维持) Mdivi-1处理浓度:20 µM,预处理2小时 雷帕霉素处理浓度:100 nM,预处理2小时 HDAC11过表达质粒(pDONR223-HDAC11)转染量:2.5 µg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证金黄色葡萄球菌能否在巨噬细胞内存活和增殖。
用GFP标记的金黄色葡萄球菌以MOI=10感染BMDMs,2小时后用庆大霉素清除胞外菌,观察24小时内胞内细菌增殖。
探究IL10在金黄色葡萄球菌细胞内存活中的作用。
使用siRNA敲低IL10,再补充外源IL10,检测细胞内细菌数量。
寻找金黄色葡萄球菌感染后可能涉及的机制和差异蛋白。
对感染24小时的BMDMs进行定量蛋白质组学分析,鉴定差异表达蛋白,并进行GO和KEGG富集分析。
确定线粒体自噬是否有助于金黄色葡萄球菌的细胞内存活,以及其对mtROS的影响。
使用Mdivi-1抑制线粒体自噬,检测细菌载量和mtROS水平,同时通过Western blot检测自噬相关蛋白表达。
探究HDAC11是否通过IL10/mTOR通路调节线粒体自噬,从而影响细菌存活。
过表达HDAC11,并用雷帕霉素激活mTOR,检测细菌载量、mtROS水平、自噬标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Biosharp | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | -- | |
| F4/80抗体 | Elabscience | E-AB-F0995D | |
| 细菌感染 | 胰酪胨大豆肉汤 | OXOID | -- |
| 庆大霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | Mdivi-1 | MedChem Express | HY-15886 |
| 雷帕霉素 | MedChem Express | HY-10219 | |
| 白细胞介素10 | MedChem Express | HY-P70517 | |
| 流式细胞术 | MitoSOX Green | Invitrogen | M36006 |
| 溶酶体绿色荧光探针 | Invitrogen | L7526 | |
| 细胞凋亡检测 | 膜联蛋白V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062M |
| 共聚焦显微镜 | 线粒体红色荧光探针 | Beyotime | S0061M |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | MedChem Express | HY-K0601 |
| Western blot | 抗HDAC11抗体 | CST | 58442 |
| 抗H3抗体 | CST | 4499 | |
| 抗GAPDH抗体 | CST | 97166 | |
| 抗H3K9ac抗体 | CST | 9649 | |
| 抗mTOR抗体 | CST | 2983 | |
| 抗磷酸化mTOR抗体 | CST | 5536 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | CST | 86298 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | CST | 3700 | |
| 抗Parkin抗体 | CST | 32833 | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | CST | 39749 | |
| 抗LC3抗体 | Abclone | A19665 | |
| 抗TOM20抗体 | Abclone | A19403 | |
| 抗COX IV抗体 | Beyotime | AC610 | |
| 抗Pink1抗体 | Proteintech | 23274-1-AP | |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | Invitrogen | -- |
| ABScript II一步法SYBR Green RT-qPCR试剂盒 | Abclone | -- | |
| ELISA | IL6 ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Co. | 1210602 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Co. | 1217202 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Co. | 1210122 | |
| IL12 ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Co. | 1211202 | |
| TGF-β ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Co. | 1217102 | |
| IL10 ELISA试剂盒 | Beyotime | PI522 | |
| 共聚焦显微镜 | Dil染料 | Beyotime | -- |
| Hoechst染料 | Beyotime | -- | |
| 细胞培养 | 脂质体转染试剂3000 | Invitrogen | -- |
| 质粒转染 | pDONR223-HDAC11质粒 | YouBio | -- |
| siRNA转染 | IL10 siRNA | TSINGKE | -- |
| 蛋白质组学 | Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 共聚焦显微镜 | Leica TCS SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 流式细胞术 | BD FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Western blot | ChemiDoc MP成像系统 | BIO-RAD | -- |
| RT-qPCR | CFX Connect实时荧光定量PCR仪 | BIO-RAD | -- |
| 线粒体分离 | 线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| ChIP-qPCR | 蛋白G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 10004D |
| 共聚焦显微镜 | 线粒体荧光探针 | -- | -- |
| 溶酶体荧光探针 | -- | -- | |
| MitoSOX Green | Invitrogen | M36006 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | BMDMs来自C57BL/6小鼠,使用M-CSF (10 ng/mL)分化7天,纯度>95% 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and macrophage infection 部分 |
| 细菌感染 | 金黄色葡萄球菌NCTC8325,MOI=10,感染2小时,庆大霉素(200 µg/ml) 2小时清除胞外菌,之后维持50 µg/ml 阅读提示:Materials and methods: Bacterial strain and culture conditions, Cell culture and macrophage infection 部分 |
| 药物处理 | Mdivi-1 (20 µM) 和雷帕霉素 (100 nM) 预处理2小时 阅读提示:Materials and methods: Intracellular bacterial survival 部分 |
| 转染 | HDAC11过表达质粒2.5 µg/孔,siRNA (30 nM/mL) 用Lipofectamine 3000转染 阅读提示:Materials and methods: Intracellular bacterial survival 部分 |
| 检测指标 | mtROS用MitoSOX Green (1 µM, 30分钟) 检测,线粒体膜电位用JC-1 (2 µM, 20分钟) 检测 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry, Confocal laser scanning microscopy 部分 |
| 蛋白质组学 | 感染24小时,差异蛋白筛选标准|log2(fold change)| ≥ 1,P < 0.05 阅读提示:Materials and methods: Bioinformatics analysis 部分 |