SAH模型建立及表型评估
建立体内SAH模型并评估神经功能损伤、脑水肿和铁死亡相关指标。
使用C57BL/6J小鼠通过血管内穿孔法建立SAH模型,在SAH后24小时评估SAH分级、改良Garcia评分、脑含水量、HE染色、氧化应激指标(MDA、SOD、GSH-Px、Fe2+)和4-HNE免疫组化。
FOXO3a-BAP1 axis regulates neuronal ferroptosis in early brain injury after subarachnoid hemorrhage.
包含体外细胞实验(HT22、293T)、体内小鼠模型(SAH模型)及分子机制验证(ChIP、CoIP、去泛素化等)多个独立证据层级。
HT22小鼠海马神经元细胞 293T人胚肾细胞 C57BL/6J小鼠SAH模型(内皮穿孔法)
SAH模型建立方法:采用血管内穿孔法 shRNA敲低FOXO3a和BAP1的效率验证(Western blot和qPCR) H2Aub对SLC7A11启动子的调控(ChIP-qPCR) FOXO3a在BAP1启动子上的结合位点(ChIP和荧光素酶报告实验) BAP1与FOXO3a的相互作用及去泛素化(CoIP和去泛素化实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立体内SAH模型并评估神经功能损伤、脑水肿和铁死亡相关指标。
使用C57BL/6J小鼠通过血管内穿孔法建立SAH模型,在SAH后24小时评估SAH分级、改良Garcia评分、脑含水量、HE染色、氧化应激指标(MDA、SOD、GSH-Px、Fe2+)和4-HNE免疫组化。
在体外模拟SAH(hemin处理)并检测神经元铁死亡相关表型。
使用HT22和293T细胞,以150μM hemin处理24小时,检测细胞活力(CCK-8)、脂质 ROS(C11-BODIPY)、MDA和SOD水平、线粒体形态(TEM)及SLC7A11/GPX4表达。
确定BAP1是否通过去泛素化H2Aub调控SLC7A11表达,影响铁死亡。
利用H2A K119R突变质粒和BAP1过表达质粒转染细胞,通过Western blot、qPCR、ChIP-qPCR、免疫荧光和TEM检测SLC7A11/GPX4表达、H2Aub富集及铁死亡表型。
确定FOXO3a是否直接结合BAP1启动子并调控其转录。
通过ChIP-qPCR和琼脂糖凝胶电泳分析FOXO3a与BAP1启动子的结合位点,构建BAP1启动子截短和突变质粒,进行双荧光素酶报告实验验证FOXO3a对BAP1的调控作用。
确定BAP1是否与FOXO3a直接结合并调控其稳定性。
通过CoIP、分子对接、免疫荧光共定位、CHX追踪实验和去泛素化实验,验证BAP1与FOXO3a的结合以及BAP1介导的K48位点去泛素化。
在SAH小鼠模型中验证FOXO3a或BAP1敲低对神经损伤和铁死亡的影响。
通过脑内注射慢病毒sh-FOXO3a或sh-BAP1,在SAH后24小时评估神经功能、脑水肿、氧化应激指标(MDA、SOD、GSH-Px、Fe2+)和蛋白表达(FOXO3a、BAP1、SLC7A11、GPX4)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 异氟烷 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 氯高铁血红素 | MCE | HY-19424 |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | MCE | HY-K0301 |
| 细胞转染 | NEOFECT DNA转染试剂 | NEOFECT | TF201201 |
| 病毒转导 | HitransG P | GeneChem | REVG005 |
| 染色 | C11 BODIPY 581/591 | GLPBIO | GC40165 |
| DHE | Beyotime | S0063 | |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
| 免疫共沉淀 | A/G磁珠 | MCE | HY-K0202 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Servicebio | G2026 |
| ECL化学发光试剂盒 | Biosharp | BL520B | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| BAP1抗体 | Cell Signaling Technology | 13271 | |
| 免疫荧光 | BAP1抗体(IF) | Santa Cruz Biotechnology | sc-28383 |
| Western blot / 免疫荧光 | SLC7A11抗体 | ABclonal | A13685 |
| Western blot | GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig |
| Western blot / 免疫共沉淀 | FOXO3a抗体 | Proteintech | 66428-1-Ig |
| 免疫荧光 | FOXO3a抗体(IF) | ABclonal | A9270 |
| Western blot | H2A抗体 | ABclonal | A16249 |
| Western blot / 免疫共沉淀 | H2Aub抗体 | Cell Signaling Technology | 8240 |
| 免疫荧光 | NeuN抗体 | Proteintech | 66836-1-Ig |
| Western blot / 免疫共沉淀 | Myc抗体 | Beyotime | AF0033 |
| Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F7425 | |
| HA抗体 | Beyotime | AF0039 | |
| 免疫组织化学 | 4-HNE抗体 | ABclonal | A26085 |
| DAB底物试剂盒 | Servicebio | G1212 | |
| 氧化应激检测 | MDA检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A003 |
| SOD检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A001 | |
| GSH-Px检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A006 | |
| 铁离子检测 | 亚铁比色法检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K773-M |
| 透射电镜 | 电镜固定液 | Servicebio | G1102 |
| RNA提取 | RNA-easy RNA提取试剂 | Vazyme | R701 |
| cDNA合成 | Hifair III第一链cDNA合成预混液 | Yeasen | 11141ES10 |
| qPCR | Hieff qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen | 11202ES03 |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 质粒构建 | pCDH-Flag载体 | -- | -- |
| pCDH-HA载体 | -- | -- | |
| 细胞处理 | MG132 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SAH动物模型 | 小鼠品系、周龄、体重、麻醉方式、造模方法(血管内穿孔)、SAH分级评分、排除标准 阅读提示:Methods 2.1 和 2.2 |
| 细胞模型 | 细胞系(HT22、293T)、培养条件(DMEM、10% FBS、5% CO2)、hemin浓度和处理时间 阅读提示:Methods 2.6 |
| 基因敲低/过表达 | shRNA序列、慢病毒滴度、转染试剂、感染时间、筛选药物(嘌呤霉素)浓度和筛选时长 阅读提示:Methods 2.7 和 Table 1 |
| 铁死亡检测 | MDA、SOD、GSH-Px、Fe2+检测试剂盒及操作步骤、C11-BODIPY和DHE染色浓度和孵育时间 阅读提示:Methods 2.9 和 2.15 |
| 分子机制实验 | ChIP-qPCR步骤(交联时间、超声条件、抗体)、CoIP步骤(裂解液、磁珠、抗体孵育时间)、去泛素化实验(质粒种类和转染时间) 阅读提示:Methods 2.11 和 2.13 |
| 体内功能验证 | 慢病毒注射剂量、立体定位坐标、SAH诱导和评估时间点 阅读提示:Methods 2.1 和 Results 3.8 |