植物材料采集与提取
获取类叶牡丹根及根茎中的化学成分。
2016年6月从陕西太白山采集根和根茎,经70%乙醇回流提取,依次用石油醚和正丁醇萃取,得到正丁醇部位。
Two previously undescribed triterpenoid saponins from the roots and rhizomes of Caulophyllum robustum Maxim.
文献包含化合物分离纯化、结构鉴定(NMR、MS、GC-MS)、体外细胞毒性实验(MTT)及分子对接,但缺乏体内实验和机制验证。
人白血病细胞系HL-60 人肝癌细胞系HepG2 人胶质瘤细胞系U251MG
细胞系:HL-60、HepG2、U251MG MTT实验:细胞接种密度5000个/孔,处理24小时 阳性对照:阿霉素和尼莫司汀盐酸盐 分子对接:CD81蛋白(UniProt P60033),网格坐标X:21.42, Y:36.31, Z:21.35,大小20 Å
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取类叶牡丹根及根茎中的化学成分。
2016年6月从陕西太白山采集根和根茎,经70%乙醇回流提取,依次用石油醚和正丁醇萃取,得到正丁醇部位。
分离得到单体皂苷。
正丁醇部位经硅胶柱层析、Sephadex LH-20柱色谱和半制备HPLC分离得到化合物1-9。
阐明新化合物的化学结构。
通过HR-ESI-MS、NMR(1H、13C、2D)和GC-MS糖分析确定化合物1和2的结构。
评估化合物对人癌细胞的体外细胞毒性。
采用MTT法检测化合物1-9对三种人癌细胞系的细胞毒性,计算IC50值。
预测活性化合物的潜在靶点并研究其结合模式。
通过SEA平台预测化合物1、2、6、9的靶点,选择共同靶点CD81,使用AutoDock Vina进行分子对接。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分离纯化 | 硅胶 | Qingdao Marine Chemical Co., Ltd. | -- |
| 反相硅胶(RP-18) | Merck&Co., Ltd. | -- | |
| 葡聚糖凝胶LH-20 | GEHealthcare | -- | |
| 高效液相色谱 | Gilson | -- | |
| Hedera ODS-2色谱柱 | -- | -- | |
| 结构鉴定 | 气相色谱-质谱联用仪GC-MS QP 2010 | Shimadzu | -- |
| Agilent Q-TOF质谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Bruker Ascend 800核磁共振波谱仪 | Bruker | -- | |
| 旋光仪SGC-568 | INESA | -- | |
| 糖分析 | D-葡萄糖 | Sigma Aldrich | -- |
| L-鼠李糖 | Sigma Aldrich | -- | |
| L-阿拉伯糖 | Sigma Aldrich | -- | |
| 细胞毒性实验 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| RPMI-1640培养基 | Hyclone | -- | |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| MTT试剂 | Sigma Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| 阿霉素 | Sigma | -- | |
| 尼莫司汀盐酸盐 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 提取与分离 | 提取溶剂、温度、时间、重复次数;色谱柱类型、流动相比例、流速 阅读提示:见2.3 Extraction and isolation |
| 结构鉴定 | 核磁共振波谱仪频率、溶剂;GC-MS条件(色谱柱、升温程序) 阅读提示:见2.1 Instruments and reagents、2.4 Sugar analysis |
| 细胞毒性实验 | 细胞系、培养条件、细胞接种密度、药物处理浓度、处理时间、MTT孵育时间、检测波长、重复次数 阅读提示:见2.5 Cytotoxicity assay |
| 分子对接 | 蛋白来源、UniProt ID、对接软件、格点坐标与大小、化合物结构来源 阅读提示:见2.6 Target prediction and molecular docking |