患者血浆蛋白质组学分析
鉴定脓毒症患者和对照之间差异表达的蛋白质,特别是胎球蛋白A水平。
收集55名脓毒症患者和18名非脓毒症对照的血样,进行LC-MS蛋白质组学分析,比较两组间蛋白质表达。
Ethyl palmitate ameliorates lethal endotoxemia by inducing hepatic fetuin-A secretion: an in vivo and in vitro experiment.
包含患者蛋白质组学、体外细胞实验、体内小鼠模型、组织学、流式细胞术和分子检测等多种证据层级,并进行功能验证和机制验证。
脓毒症患者队列 LPS诱导的内毒素血症小鼠模型 AML-12小鼠肝细胞系
LPS剂量:致死剂量15 mg/kg诱导存活实验,非致死剂量10 mg/kg用于其他实验 EP剂量:2、5、10 mL/kg,在LPS前12小时和同时腹腔注射 EP溶于30%玉米油中给药 小鼠品系:成年雄性C57BL/6J,6-8周龄 AML-12细胞处理:不同浓度EP处理12小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定脓毒症患者和对照之间差异表达的蛋白质,特别是胎球蛋白A水平。
收集55名脓毒症患者和18名非脓毒症对照的血样,进行LC-MS蛋白质组学分析,比较两组间蛋白质表达。
验证LPS诱导的内毒素血症小鼠模型中血清胎球蛋白A水平的变化。
给小鼠腹腔注射LPS(10 mg/kg),在不同时间点(12、24、36、48小时)取血,通过ELISA检测血清胎球蛋白A水平。
验证EP是否促进肝细胞系中胎球蛋白A的表达。
用不同浓度EP(100、200、300、400、500 μM)处理AML-12细胞12小时,通过Western blot检测胎球蛋白A表达。
验证EP是否促进内毒素血症小鼠肝脏胎球蛋白A的表达。
给予小鼠EP(5 mL/kg)和LPS(10 mg/kg),24小时后通过免疫组化检测肝组织胎球蛋白A表达。
评估EP对致死性LPS诱导内毒素血症小鼠生存的影响。
给小鼠注射致死剂量LPS(15 mg/kg),并给予不同剂量EP(2、5、10 mL/kg),监测7天存活率。
评估EP对LPS诱导的促炎细胞因子水平的影响。
给予小鼠EP(5 mL/kg)和LPS(10 mg/kg),24小时后通过ELISA检测血清TNF-α、IL-1β和IL-6水平。
评估EP是否减轻内毒素血症小鼠的肺损伤和巨噬细胞浸润。
收集肺组织,进行HE染色评估组织学变化;通过RT-qPCR检测炎症因子(Il1b、Il6、Tnfα、Ccl2)mRNA表达;通过流式细胞术检测巨噬细胞(CD45+CD11b+F4/80+)比例。
评估EP是否减轻内毒素血症小鼠的肝损伤和巨噬细胞浸润。
收集肝组织,进行HE染色评估组织学变化;通过RT-qPCR检测炎症因子mRNA表达;通过流式细胞术检测巨噬细胞比例。
验证EP是否调节内毒素血症小鼠肝脏巨噬细胞M1/M2极化。
通过RT-qPCR检测M1标记基因iNOS和M2标记基因Arg1的表达;通过流式细胞术检测M1(CD45+CD11b+F4/80+CD86+)和M2(CD45+CD11b+F4/80+CD206+)巨噬细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4193 |
| 棕榈酸乙酯 | MedChem Express | HY-N2086 | |
| 棕榈酸乙酯 | 上海阿拉丁生化科技股份有限公司 | E103505 | |
| 溶剂对照 | 玉米油 | 上海阿拉丁生化科技股份有限公司 | C116023 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | C11330500VT |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000-044 | |
| 青霉素和链霉素 | Hyclone | SV30010 | |
| 动物麻醉 | 阿佛丁 | Sigma-Aldrich | T48402 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | 9109 |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | Yeasen | 11203ES08 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 | |
| 抗胎球蛋白A抗体 | Abcam | ab187051 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | CST | 4967 | |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | BioLegend | 432604 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | BioLegend | 431304 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | BioLegend | 430904 | |
| 小鼠胎球蛋白A ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co. Ltd | E-EL-M3069 | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD16/CD32抗体 | Biolegend | 101320 |
| 可固定活力染料510 | Biolegend | 423111 | |
| APC/Cyanine7大鼠抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | 147718 | |
| Brilliant Violet 605大鼠抗小鼠/人CD11b抗体 | Biolegend | 101257 | |
| Brilliant Violet 650大鼠抗小鼠CD86抗体 | Biolegend | 105036 | |
| Brilliant Violet 785大鼠抗小鼠CD206抗体 | Biolegend | 141729 | |
| BD Horizon BV421大鼠抗小鼠F4/80抗体 | BD Biosciences | 565411 | |
| 免疫组织化学 | 抗胎球蛋白A抗体 | Servicebio | GB112376-100 |
| 二抗 | Servicebio | GB23303 | |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪(LSR Fortessa) | BD Biosciences | -- |
| Western blot | 化学发光成像系统 | Tanon | -- |
| 免疫组织化学 | 显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| RT-qPCR | ABI RT-PCR 384系统 | Life Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者蛋白质组学分析 | 纳入标准(疑似感染且qSOFA≥2),对照组(SOFA=0且无感染),年龄和性别匹配 阅读提示:Methods 中 Subjects 部分,表S2 |
| 体内实验(小鼠模型) | 小鼠品系(C57BL/6J),性别(雄性),年龄(6-8周),LPS剂量(致死15 mg/kg,非致死10 mg/kg),EP剂量(2,5,10 mL/kg),给药方式(腹腔注射),给药时间(LPS前12小时和同时),溶剂(30%玉米油) 阅读提示:Methods 中 Animals 部分,图3、图2图注 |
| 体外实验(AML-12细胞) | 细胞系(AML-12),培养条件(DMEM/F12+10%FBS+40ng/mL地塞米松+1%青霉素/链霉素),EP浓度(100-500 μM),处理时间(12小时) 阅读提示:Methods 中 Cell culture and experiments 部分,图2图注 |
| 组织学和流式分析 | 组织取样时间(LPS后24小时),流式抗体组合(CD45、CD11b、F4/80、CD86、CD206),M1/M2定义 阅读提示:Methods 中 Flow cytometry analysis 部分,图4-6图注 |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒来源,检测指标(IL-1β,IL-6,TNF-α,fetuin-A),血清样本 阅读提示:Methods 中 ELISA 部分,图3B |