TDCIPP对Aβ产生的影响
检测TDCIPP暴露是否影响Aβ1-40和Aβ1-42的产生及Aβ1-42/Aβ1-40比值。
用不同浓度TDCIPP(15 μM、45 μM)处理N2a-APPswe细胞24小时,通过ELISA检测Aβ1-40和Aβ1-42水平,计算比值。
Inhibition of autophagosome-lysosome fusion contributes to TDCIPP-induced Aβ1-42 production in N2a-APPswe cells.
包含细胞实验、TMT蛋白质组学、Western blot、免疫荧光和ELISA验证,但缺乏动物模型和体内验证。
N2a-APPswe细胞 N2a-WT细胞
TDCIPP浓度:15 μM和45 μM CQ浓度:50 μM 处理时间:24 h 对照:DMSO作为溶剂对照 细胞系:N2a-APPswe和N2a-WT
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测TDCIPP暴露是否影响Aβ1-40和Aβ1-42的产生及Aβ1-42/Aβ1-40比值。
用不同浓度TDCIPP(15 μM、45 μM)处理N2a-APPswe细胞24小时,通过ELISA检测Aβ1-40和Aβ1-42水平,计算比值。
探讨TDCIPP是否改变BACE1和PS1等关键酶的表达。
Western blot检测BACE1、PS1、APP、ADAM10和IDE蛋白水平。
全局分析TDCIPP处理后差异表达蛋白及其富集通路。
TMT标记结合LC-MS/MS鉴定和定量蛋白质,进行GO和KEGG富集分析。
验证蛋白质组学发现的与自噬-溶酶体相关的蛋白变化。
通过Western blot检测LC3、P62、CTSD和LAMP1表达,免疫荧光和CYTO-ID检测自噬体积累。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学试剂 | 三(1,3-二氯-2-丙基)磷酸酯 | Macklin Reagent | -- |
| 氯喹 | MedChemExpress | -- | |
| 蛋白质组学 | TMT标记试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 测序级胰蛋白酶/Lys-C混合物 | Promega | -- | |
| ELISA | 人Aβ1-42 ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 自噬检测 | CYTO-ID®自噬检测试剂盒 | Enzo Life Sciences | -- |
| Western blotting | Tricine-SDS-PAGE凝胶制备试剂盒 | Sangon Biotech | -- |
| 抗早老素-1抗体 | Affinity Bioscience | AF0245 | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 12741T | |
| 抗BACE1抗体 | Cell Signaling Technology | 5606S | |
| 抗P62抗体 | Abcam | ab109012 | |
| 抗CTSD抗体 | Abcam | ab6313 | |
| 抗LAMP1抗体 | Abcam | ab24170 | |
| 蛋白质组学 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| Oasis HLB柱 | Waters | -- | |
| LC-MS/MS | Orbitrap Exploris™ 480质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| 免疫荧光 | 共聚焦显微镜 | ZEISS | LSM980 |
| Western blotting | 多功能成像仪 | Cytiva | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | N2a-APPswe细胞使用DMEM和OPTI-MEM 1:1混合培养基,含10% FBS和200 μg/mL G418;N2a-WT细胞使用含10% FBS的DMEM。 阅读提示:见Materials and methods 2.2 Cell culture |
| 药物处理 | TDCIPP浓度15 μM和45 μM,CQ浓度50 μM,处理24 h,DMSO为对照。 阅读提示:见Materials and methods 2.3 TDCIPP treatment of N2a-APPswe cells |
| 蛋白质组学 | TMT标记通道分配:126为N2a-WT,127为N2a-APPswe对照,128为15 μM TDCIPP,129为45 μM TDCIPP。 阅读提示:见Materials and methods 2.4 TMT labeling |
| ELISA检测 | 按试剂盒说明书操作,检测Aβ1-42水平。 阅读提示:见Materials and methods 2.9 Measurement of Human Aβ1-42 levels by ELISA |