模型与处理
建立细胞和动物模型,并给予HU处理以观察效应
培养HEL92.1.7细胞,用HU处理;对WT和Nos2−/−小鼠经饮水给予HU。
Hydroxyurea inhibits proliferation and stimulates apoptosis through inducible nitric oxide synthase in erythroid cells.
体外细胞系(HEL92.1.7)与shRNA敲低、药物抑制;体内Nos2敲除小鼠模型;分子对接与动力学模拟;酶活性检测。
人红白血病HEL92.1.7细胞 小鼠原代红系祖细胞(mERP) Nos2敲除小鼠
HU处理浓度:体外100 μM,体内200 mg/kg饮水 NOS2基因敲除小鼠(B6.129P2-Nos2tm1Lau/J) NOS2抑制剂1400W浓度:体外100 μM,体内20 mg/kg皮下注射 shRNA敲低NOS2效率约78% 细胞周期分析:PI染色
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立细胞和动物模型,并给予HU处理以观察效应
培养HEL92.1.7细胞,用HU处理;对WT和Nos2−/−小鼠经饮水给予HU。
检测HU对NOS2表达和活性的影响
通过Western blot和免疫细胞化学检测NOS2蛋白水平;通过亚硝酸盐/瓜氨酸测定评估NOS2活性。
探究HU激活NOS2的机制(NFκB通路及直接结合)
使用NFκB抑制剂JSH23验证通路;通过分子对接和分子动力学模拟预测HU与NOS2的结合。
验证NOS2在HU诱导的增殖抑制和凋亡中的作用
使用1400W或shRNA敲低NOS2,检测细胞活力、细胞周期和凋亡;在体内验证Nos2敲除或抑制对mERP的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 羟基脲 | Abcam | ab142613 |
| 1400W | Sigma Aldrich | -- | |
| JSH23 | Merck | -- | |
| NOS2敲低 | MISSION® shRNA | Sigma Aldrich | -- |
| 流式分选 | BD FACS Melody | Becton Dickinson | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| 抗NOS2抗体 | Elabscience | E-AB-64331 | |
| 抗磷酸化NFκB p65抗体 | Cell Signaling | 3031 | |
| 抗总NFκB p65抗体 | Elabscience | E-AB-22066 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Elabscience | E-AB-21027 | |
| 抗总p38抗体 | Elabscience | E-AB-66279 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling | 9101 | |
| 抗总ERK1/2抗体 | Cell Signaling | 9102 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | R&D Systems | MAB8928 | |
| 增强化学发光检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ImageLab软件 | -- | -- | |
| 动物基因型鉴定 | 蛋白酶K | Sigma Aldrich | -- |
| 基因型分析 | MidoriGreen染料 | Nippon Genetics | -- |
| 红细胞祖细胞分离 | 抗人CD71-PE REAfinity™抗体 | Miltenyi Biotec | 130-120-809 |
| 抗PE Multisort微珠 | Miltenyi Biotec | 130-090-757 | |
| Multisort释放试剂 | Miltenyi Biotec | 130-090-757 | |
| Multisort终止试剂 | Miltenyi Biotec | 130-090-757 | |
| 抗Ter119抗体 | Miltenyi Biotec | 130-049-901 | |
| 流式细胞术 | BD FACSCalibur流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| 集落形成实验 | DMEM培养基 | Biowest | -- |
| 胎牛血清 | Biowest | -- | |
| MethoCult M3334培养基 | StemCell Technologies | -- | |
| MethoCult GF M3434培养基 | StemCell Technologies | -- | |
| 免疫细胞化学 | 抗Ki67抗体 | Dako | M7187 |
| 抗单链DNA抗体 | Abcam | ab29585 | |
| 抗NOS2抗体 | Santa Cruz Biotechnologies | sc-5302 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Novus Biologicals | NB100-56113 | |
| UltraVision Quato检测系统HRP | Thermo Fisher Scientific | TL-060-QHL | |
| DAB底物试剂盒 | Biotium | 30015 | |
| Harris苏木素 | Sigma Aldrich | HHS32-1L | |
| 免疫细胞化学分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 亚硝酸盐和瓜氨酸测量 | 同型瓜氨酸/瓜氨酸检测试剂盒 | Abcam | ab242292 |
| NOS活性检测试剂盒(荧光法) | Abcam | ab211084 | |
| Rayto分光光度计 | -- | -- | |
| VICTOR2 D荧光计 | -- | -- | |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 核糖核酸酶 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | BD | 556419 |
| Annexin V-APC | BD | 550475 | |
| 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | P1304MP | |
| ZombieGreen染料 | BioLegend | 423111 | |
| 酶活性测定 | NOS活性检测试剂盒 | Cayman Chemical | 781001 |
| 人重组NOS2 | OriGene | TP311819 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | HEL92.1.7细胞培养条件(RPMI-1640+10%FBS等);HU处理浓度(10-100 μM)和时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| NOS2敲低 | shRNA序列;感染复数(MOI=1);嘌呤霉素筛选浓度(8 mg/mL) 阅读提示:Materials and methods - Nos2 knockdown with shRNA |
| Western blot | 抗体来源和稀释比例;蛋白上样量;显影条件 阅读提示:Materials and methods - Western blot |
| 动物实验 | 小鼠品系和基因型;HU饮水浓度(200 mg/kg)和持续时间(2周);1400W注射剂量(20 mg/kg)和频率(每日两次,3天) 阅读提示:Materials and methods - Genotyping and treatment of Nos2−/− mice |
| 细胞周期分析 | 细胞固定方法;PI染色浓度;流式细胞仪设置 阅读提示:Materials and methods - Cell cycle distribution |