临床样本检测
探究FGR胎盘中m6A修饰水平及METTL3表达是否异常
收集FGR患者和正常妊娠的胎盘绒毛组织,检测m6A水平、METTL3及m6A调节因子的表达。
METTL3 and IGF2BP2 coordinately regulate FOSL1 mRNA via m6A modification, suppressing trophoblast invasion and contributing to fetal growth restriction.
包含临床胎盘样本检测、细胞功能实验(增殖/侵袭/迁移)、MeRIP-seq和RNA-seq、RIP-qPCR及机制验证、体内FGR小鼠模型及药物干预等多个独立证据层级。
HTR8/SVneo细胞 JAR细胞 ICR小鼠FGR模型(蛋白限制饮食) FGR患者胎盘绒毛组织
FGR患者胎盘组织与正常对照组的样本量(n=27 vs n=23) METTL3过表达和敲低的HTR8/SVneo细胞系构建方法 STM2457体内给药剂量(25 mg/kg)及给药时间(E13.5-E17.5) FOSL1敲低实验所用siRNA序列及转染条件 MeRIP-seq和RNA-seq联合分析筛选FOSL1为靶基因的标准
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究FGR胎盘中m6A修饰水平及METTL3表达是否异常
收集FGR患者和正常妊娠的胎盘绒毛组织,检测m6A水平、METTL3及m6A调节因子的表达。
验证METTL3对滋养层细胞增殖、侵袭和迁移的影响
在HTR8/SVneo和JAR细胞中过表达或敲低METTL3,检测细胞功能变化。
鉴定METTL3调控的m6A修饰靶基因
在METTL3敲低和对照HTR8/SVneo细胞中进行MeRIP-seq和RNA-seq,联合分析差异表达和m6A修饰基因。
验证FOSL1是否为METTL3直接调控的下游靶基因
通过MeRIP-qPCR、RIP-qPCR和RNA稳定性实验验证METTL3对FOSL1的m6A修饰和调控。
验证FOSL1对滋养层细胞功能的影响
通过siRNA敲低FOSL1,检测滋养层细胞侵袭和迁移能力的变化。
评估METTL3抑制剂STM2457对FGR小鼠模型的治疗效果
建立蛋白限制饮食诱导的FGR小鼠模型,静脉注射STM2457,检测胎儿和胎盘重量及胎盘组织结构。
探究STM2457对滋养层细胞功能及m6A修饰的影响
用不同浓度STM2457处理HTR8/SVneo细胞,检测METTL3表达、m6A水平、细胞活力、侵袭和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| m6A水平检测 | EpiQuik m6A RNA甲基化定量试剂盒 | Epigentek | P-9005 |
| m6A dot blot | Hybond-N+ 膜 | LABSELECT | -- |
| m6A特异性抗体 | Abcam | ab286164 | |
| Western blot | METTL3抗体 | Abcam | ab195352 |
| FOSL1抗体 | Affinity | DF3096 | |
| 免疫荧光 | 细胞角蛋白7抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0071 |
| FOSL1抗体 | Abcam | ab252421 | |
| RIP-qPCR | IGF2BP2抗体 | Abcam | ab128175 |
| 兔IgG | Proteintech | 14678-1-AP | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Dynabeads mRNA纯化试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RT-qPCR | 逆转录预混液 | MedChemExpress | -- |
| SYBR Green qPCR预混液 | Selleck | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | PAN Biotech | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | Beyotime | -- | |
| 细胞转染 | TransIntro EL转染试剂 | Transgen | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| Transwell实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 细胞培养小室 | Corning | -- | |
| 结晶紫 | -- | C0121 | |
| 细胞增殖 | EdU检测试剂盒 | RiboBIO | -- |
| CCK-8试剂 | MedChemExpress | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒 | Elabscience | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 免疫组化 | 免疫组化试剂盒 | ZSGB-BIO | -- |
| 染色 | 伊红 | Servicebio | -- |
| PAS染色液 | Servicebio | -- | |
| 测序 | Illumina Novaseq 6000测序平台 | LC-Bio Technology CO., Ltd. | -- |
| 组织处理 | RNA保存液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 动物实验 | STM2457 | MedChemExpress | -- |
| PEG300 | MedChemExpress | -- | |
| 仪器 | BP-2000血压分析系统 | Visitech | -- |
| 微量分光光度计 | IMPLEN GmbH | -- | |
| 酶标仪 | TECAN | -- | |
| 化学发光成像系统 | Shenhua Science Technology | -- | |
| EVOS FL成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 显微镜 | Olympus | -- | |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 测序 | 生物分析仪2100 | Agilent | -- |
| Dynabeads Oligo (dT)25磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 镁离子RNA片段化模块 | NEB | -- | |
| SuperScript II逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| 大肠杆菌DNA聚合酶I | NEB | -- | |
| RNase H | NEB | -- | |
| dUTP溶液 | Thermo Fisher Scientific | R0133 | |
| AMPureXP磁珠 | Beckman | -- | |
| 尿嘧啶DNA糖基化酶 | NEB | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | FGR诊断标准、样本排除标准、样本量(FGR=27,对照=23) 阅读提示:Materials and Methods - Sample collection |
| 细胞模型 | 细胞系来源、培养条件、METTL3过表达和敲低的慢病毒构建及感染复数 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture and cell transfection |
| MeRIP-seq和RNA-seq | METTL3敲低实验组和对照组细胞、RNA提取和纯化方法、测序平台及分析流程 阅读提示:Materials and Methods - MeRIP-seq and RNA-seq |
| 体内药物实验 | FGR小鼠模型构建(低蛋白饮食8%)、STM2457剂量(25 mg/kg)及给药途径(静脉注射)、给药时间(E13.5-E17.5) 阅读提示:Materials and Methods - Experimental animals |
| 体外药物实验 | STM2457浓度(0.05-50 μM)、处理时间(48小时)、细胞活力检测方法 阅读提示:Materials and Methods - STM2457 treatment |