构建NLRX1野生型及突变体过表达质粒
获得携带p.Arg707Cys点突变的NLRX1突变质粒,用于比较野生型与突变型的功能差异。
基于NCBI序列(NM_001282143.1)合成NLRX1基因,构建LV003载体中的WT和MT NLRX1过表达质粒,MT质粒包含第707位氨基酸由精氨酸突变为半胱氨酸的点突变。
An NLR family member X1 mutation (p.Arg707Cys) suppresses hepatitis B virus infection in hepatocytes and favors the interaction of retinoic acid-inducible gene 1 with mitochondrial antiviral signaling protein.
包含体外细胞模型、过表达质粒构建、病毒感染、RT-qPCR、Western blot、ELISA、IHC、Co-IP和荧光素酶报告实验,但缺乏体内动物模型和患者样本验证,机制验证部分尚不完整。
Huh7-NTCP细胞系 HBV感染的Huh7-NTCP细胞模型
Huh7-NTCP细胞稳定过表达NTCP WT和MT NLRX1过表达质粒的构建及验证 HBV感染条件(10% HBV血清,3×10^8拷贝/孔) NLRX1突变对HBV RNA、HBsAg、HBcAg水平的影响 NLRX1突变对IFN/NF-κB通路标志物(p-p65、p-IRF3、p-IRF7)的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得携带p.Arg707Cys点突变的NLRX1突变质粒,用于比较野生型与突变型的功能差异。
基于NCBI序列(NM_001282143.1)合成NLRX1基因,构建LV003载体中的WT和MT NLRX1过表达质粒,MT质粒包含第707位氨基酸由精氨酸突变为半胱氨酸的点突变。
建立NTCP表达细胞模型,使Huh7细胞能够支持HBV感染。
将NTCP cDNA克隆至LV003载体,转染293T细胞包装慢病毒,感染Huh7细胞,经嘌呤霉素筛选获得稳定细胞系。
在细胞模型中模拟HBV感染,评估NLRX1突变对病毒感染效率的影响。
将Huh7-NTCP细胞接种于胶原包被的培养板,以含HBV血清的培养基感染。
比较野生型与突变型NLRX1对HBV感染水平及免疫通路的影响。
分别转染WT和MT NLRX1质粒至Huh7-NTCP细胞,感染HBV后,检测HBV RNA、HBsAg、HBcAg、细胞因子及信号通路蛋白。
阐明NLRX1突变是否通过影响RIG1-MAVS相互作用来调节IFN/NF-κB通路。
通过免疫共沉淀分析MAVS与RIG1的结合,通过双荧光素酶报告基因检测IFN-α、IFN-β、IL-6启动子活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质粒构建 | LV003载体 | GenePharma | -- |
| His标签 | Orgenbiotech | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| FuGENE 6转染试剂 | Roche | -- | |
| 嘌呤霉素 | Thermo Fisher Scientific | A11138 | |
| HBV感染 | I型胶原 | -- | -- |
| 聚乙二醇8000 | Sigma-Aldrich | P2139 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | 6164 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGB2101 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Elabscience | E-IR-R306 | |
| PVDF膜 | Roche | -- | |
| HRP标记二抗 | Abcam | ab6789或ab97051 | |
| 增强化学发光底物试剂盒 | Amersham Biosciences Inc. | -- | |
| HBcAg抗体 | Santa Cruz | sc-23947 | |
| HBsAg抗体 | Santa Cruz | sc-53299 | |
| NLRX1抗体 | Proteintech | 17215-1-AP | |
| RIG1抗体 | CST | 3743T | |
| MAVS抗体 | Abcam | ab31334 | |
| p65抗体 | Abcam | ab7970 | |
| p-p65抗体 | CST | 3033S | |
| IRF7抗体 | CST | 13014 | |
| p-IRF7抗体 | CST | 12390 | |
| IRF3抗体 | CST | 4302 | |
| p-IRF3抗体 | CST | 29047 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| RT-qPCR | TRNzol Universal试剂 | TianGen | -- |
| PrimeScript RT反转录试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| ELISA | IFN-α ELISA试剂盒 | Abcam | -- |
| IFN-β ELISA试剂盒 | Abcam | -- | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | -- | |
| 免疫组化 | 山羊血清 | Gibco | 16210 |
| HBs抗体 | -- | -- | |
| HBc抗体 | -- | -- | |
| 山羊抗小鼠/兔IgG抗体 | Abcam | -- | |
| 链霉亲和素-生物素复合物 | Boster Biological Technology Co., Ltd. | SA1054 | |
| DAB显色试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 中性树胶 | Aladdin | N116470 | |
| 光学显微镜 | Optec, Inc. | CCD TP510 | |
| 免疫共沉淀 | 兔IgG同型对照 | Boster | BM4020 |
| 蛋白A琼脂糖 | -- | -- | |
| 荧光素酶报告基因 | psiCHECK-2载体 | -- | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | TransGen | FR201 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 构建NTCP过表达细胞系 | Huh7细胞感染慢病毒时的MOI=10,polybutadiene浓度8 µg/mL,嘌呤霉素筛选浓度2 µg/mL 阅读提示:Methods: Construction of Huh7 cells overexpressing sodium taurocholate transporting polypeptide |
| HBV感染 | I型胶原包被浓度50 µg/mL,HBV血清用量10%(3×10^8拷贝/孔),PEG 8000浓度4%,DMSO浓度2%,感染时间48小时 阅读提示:Methods: Hepatitis B virus infection |
| 质粒转染 | Huh7-NTCP细胞密度1×10^5 cells/well,转染试剂Lipofectamine 2000 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| Western blot | 蛋白上样量40 µg,SDS-PAGE浓度10%,一抗稀释度(如NLRX1 1:2000,GAPDH 1:8000) 阅读提示:Methods: Western blot assay |
| RT-qPCR | RNA提取试剂TRNzol,反转录试剂盒PrimeScript RT,SYBR Premix Ex Taq II,引物序列见表1 阅读提示:Methods: Real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) |
| 免疫共沉淀 | 蛋白浓度1 µg/µL,IP抗体MAVS (ab31334),蛋白A琼脂糖用量100 µL,洗脱条件 阅读提示:Methods: Coimmunoprecipitation |
| 荧光素酶报告基因 | 细胞密度1×10^5 cells/well,共转染WT/MT NLRX1及报告质粒,检测时间48小时 阅读提示:Methods: Luciferase reporter gene experiments |