建立基因敲除小鼠模型
研究legumain缺乏对动脉粥样硬化发展的影响。
将Lgmn−/−小鼠与Apoe−/−小鼠杂交产生Lgmn−/−Apoe−/−小鼠,并以Lgmn+/+Apoe−/−作为对照。
Legumain deficiency halts atherogenesis by modulating T cell receptor signaling.
包含基因敲除小鼠模型、转录组学分析、流式细胞术、免疫组化、TUNEL凋亡检测、Western blot等多种实验层级,并进行体内外功能验证。
Lgmn−/−Apoe−/−小鼠 Lgmn+/+Apoe−/−对照小鼠 脾脏CD4+ T细胞
Lgmn−/−Apoe−/−小鼠与Lgmn+/+Apoe−/−对照小鼠的构建 高脂饮食喂养12周 主动脉根部斑块面积量化 CD4+ T细胞在斑块、脾脏、淋巴结中的比例 TCR信号通路相关基因表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究legumain缺乏对动脉粥样硬化发展的影响。
将Lgmn−/−小鼠与Apoe−/−小鼠杂交产生Lgmn−/−Apoe−/−小鼠,并以Lgmn+/+Apoe−/−作为对照。
确定legumain缺乏对斑块形成的影响。
通过主动脉根部HE染色量化斑块面积,并检测CD3+ T细胞和巨噬细胞浸润。
评估legumain缺乏对CD4+ T细胞数量的影响。
通过流式细胞术和免疫组化检测脾脏、淋巴结、血液和主动脉中CD4+ T细胞的比例和绝对数量。
探究legumain缺乏对CD4+ T细胞基因表达的影响。
从脾脏分离CD4+ T细胞,进行RNA测序,并进行KEGG和GSEA通路富集分析。
验证转录组分析中发现的TCR信号通路下调。
通过qRT-PCR检测CD28、CD40L等基因表达,并分析CD4+ T细胞亚群(naive、EM、CM)比例。
确定legumain缺乏对CD4+ T细胞存活的影响。
通过Ki-67染色和Annexin V凋亡检测评估增殖和凋亡,并通过TUNEL染色检测组织中的凋亡细胞。
评估legumain缺乏对CD4+ T细胞功能的影响。
体外刺激CD4+ T细胞,检测活化标志物(CD25、CXCR3、CXCL10)和细胞因子(IFN-γ、IL-2、IL-10)的表达。
探究legumain缺乏导致CD4+ T细胞凋亡的分子机制。
检测Bcl-2家族成员表达,并通过流式细胞术检测ROS和线粒体ROS水平,Western blot检测胞浆和线粒体细胞色素c。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 高脂饮食 | Special Diet Services Ltd. | -- |
| 血液分析 | 总胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 |
| 甘油三酯检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 | |
| 高密度脂蛋白胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A112-1-1 | |
| 低密度脂蛋白胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A113-1-1 | |
| 细胞分离 | 红细胞裂解液 | Solarbio | R1010 |
| 细胞过滤器 | Corning | 352350 | |
| 流式细胞术 | 染色缓冲液 | BD Pharmingen | 554656 |
| 可固定活力染色510试剂 | BD Pharmingen | 564406 | |
| 转录因子缓冲液套装 | BD Pharmingen | 562574 | |
| Annexin V凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A212 | |
| 细胞培养 | Dynabeads未接触小鼠CD4细胞分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 11416D |
| 白细胞介素-2 | MCE | HY-P7077 | |
| CD3抗体 | Biolegend | 100340 | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | E004-1-1 |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX红 | MCE | HY-D1055 |
| 细胞组分分离 | 线粒体提取试剂盒 | Solarbio | SM0020 |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime | C1005 |
| 免疫组化 | 高效免疫组化检测系统试剂盒 | Absin | abs957 |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A420 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| 逆转录 | HiScript IV逆转录预混液试剂盒 | Vazyme | R423-01 |
| qRT-PCR | ChamQ SYBR qPCR预混液试剂盒 | Vazyme | Q311-02 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系:Lgmn−/−Apoe−/−和Lgmn+/+Apoe−/−;性别:雄性;周龄:文中未明确说明;高脂饮食喂养时间:12周。 阅读提示:Methods - Mice |
| 动脉粥样硬化斑块量化 | 主动脉根部切片厚度:6.0μm;分析切片位置:主动脉瓣膜出现后连续切片中的中间3张;染色方法:H&E。 阅读提示:Methods - Histological analysis; Figure 1 |
| 流式细胞术 | 抗体:CD3、CD4、CD8、CD44、CD62L、CD25、Bcl-2、Ki-67、Foxp3;孵育时间:20分钟,4°C;细胞内染色需预处理。 阅读提示:Methods - Flow cytometry; Table S2 |
| CD4+ T细胞体外激活 | 刺激条件:CD3抗体(5μg/mL),IL-2(10ng/mL);培养时间:24小时(对于qRT-PCR)。 阅读提示:Methods - Cell activation and functional analysis |
| 细胞因子检测 | 检测指标:IFN-γ、IL-2、IL-10;样本:血浆和培养上清。 阅读提示:Methods - Cell activation and functional analysis; Figure 5 |