建立麻醉/手术(A/S)模型
诱导围手术期神经认知障碍(PND)模型。
18月龄小鼠在异氟烷麻醉下接受剖腹手术,建立PND模型。
Inhibiting endoplasmic reticulum stress alleviates perioperative neurocognitive disorders by reducing neuroinflammation mediated by NLRP3 inflammasome activation.
研究包含转录组测序、qPCR、Western blot、ELISA、免疫荧光和行为学等多层级验证,并采用ER应激抑制剂TUDCA进行干预,涵盖分子、细胞和行为水平。
18月龄雄性C57BL/6小鼠 剖腹手术(A/S)模型
Hspa5和Xbp1 mRNA和蛋白表达水平在A/S组海马中增加 NLRP3炎症小体激活标志物:NLRP3、pro-caspase-1、cleaved-caspase-1、IL-1β和IL-18水平升高 TUDCA(200 mg/kg,术前30分钟腹腔注射)抑制ER应激、NLRP3炎症小体激活和神经炎症 行为学测试显示A/S组认知缺陷,TUDCA部分逆转
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
诱导围手术期神经认知障碍(PND)模型。
18月龄小鼠在异氟烷麻醉下接受剖腹手术,建立PND模型。
筛选A/S后差异表达的枢纽基因。
提取海马RNA进行RNA-seq,使用DESeq2鉴定DEGs,进行GO富集分析,通过CytoHubba和WGCNA筛选枢纽基因。
验证RNA-seq结果中Hspa5和Xbp1的表达变化。
使用qPCR和Western blot检测海马组织中Hspa5和Xbp1的mRNA和蛋白水平。
评估A/S后NLRP3炎症小体激活情况。
通过Western blot检测NLRP3、pro-caspase-1、cleaved-caspase-1蛋白水平,通过ELISA检测IL-1β和IL-18水平。
评估抑制ER应激是否减轻NLRP3炎症小体激活和神经炎症。
术前30分钟腹腔注射TUDCA(200 mg/kg),检测GRP78、XBP1、NLRP3、caspase-1及炎症因子表达。
检测A/S后海马小胶质细胞和星形胶质细胞的激活。
通过免疫荧光染色检测Iba-1和GFAP阳性细胞数量及荧光强度。
评估A/S后认知功能及TUDCA的改善作用。
进行旷场实验、Barnes迷宫和情境恐惧条件化测试。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA-seq | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
| RNA提取 | 动物组织快速RNA提取试剂盒 | ABclonal | RK30120 |
| 逆转录 | ABScript III RT预混液(含gDNA去除剂) | ABclonal | RK20429 |
| qPCR | 2X通用SYBR Green快速qPCR预混液 | ABclonal | RK21203 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Epizyme | PC101 |
| 蛋白酶抑制剂 | Epizyme | GRF101 | |
| 抗GRP78抗体 | Proteintech | 11,587-1-AP | |
| 抗XBP1抗体 | Proteintech | 24,868-1-AP | |
| 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 15101S | |
| 抗caspase-1抗体 | Cell Signaling Technology | 24232S | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60,004-1-Ig | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66,009-1-Ig | |
| 免疫荧光 | 抗Iba-1抗体 | Abcam | ab289874 |
| 抗GFAP抗体 | Cell Signaling Technology | 3670S | |
| 抗山羊IgG-FITC二抗 | Abcam | ab6881 | |
| 抗小鼠IgG-FITC二抗 | Servicebio | GB22301 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 奥林巴斯共聚焦显微镜(FV1000) | Olympus | FV1000 | |
| ELISA | 小鼠IL-18 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0730 |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037 | |
| 行为实验 | 智能视频追踪软件 | Panlab, Harvard Apparatus | -- |
| 药物处理 | 牛磺熊去氧胆酸(TUDCA) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别、麻醉和手术细节(异氟烷浓度、切口大小、手术时长) 阅读提示:Methods 2.1和2.2 |
| RNA-seq | 测序平台、参考基因组、DEGs筛选标准(p值) 阅读提示:Methods 2.3 |
| qPCR | RNA提取试剂盒、内参基因、引物序列、相对定量方法 阅读提示:Methods 2.6和Table 1 |
| Western blot | 裂解液、蛋白酶抑制剂、抗体稀释比例、内参蛋白 阅读提示:Methods 2.7和Table 2 |
| ELISA | 试剂盒货号、样本处理、检测指标 阅读提示:Methods 2.9 |
| 免疫荧光 | 切片厚度、脑区(CA1)、抗体、孵育时间、图像分析 阅读提示:Methods 2.8 |
| 行为学 | 测试设备、参数(电击强度、时间)、分析软件 阅读提示:Methods 2.10-2.13 |
| 药物干预 | TUDCA剂量、给药途径和时间 阅读提示:Methods 2.1 |