形态学与组织学分析
比较db/+和db/db小鼠左右肾上腺的形态和组织学差异。
使用体视显微镜观察肾上腺形状,测量肾上腺重量、体积、皮质体积、髓质体积、包膜厚度等参数,并进行H&E染色和油红O染色评估脂质储存。
Higher Steroid Production in the Right Adrenal Gland Compared to the Left One in db/db Mice, a Model of Type 2 Diabetic Obesity.
包含形态学、组织学、转录组学、血清代谢组学、肾上腺类固醇分析及RT-qPCR验证等多个独立证据层级,并涉及功能验证。
db/db小鼠(C57BLKS-Leprdb) db/+对照小鼠(C57BLKS-Leprdb/+)
小鼠品系:db/db(C57BLKS-Leprdb)和db/+(C57BLKS-Leprdb/+) 年龄:11周龄雄性小鼠 组别:db/db vs db/+,左右肾上腺比较 样本量:每组6只(组织学和IHC 5-6只) 关键基因验证:RT-qPCR验证Star、Cyp11a1、Hsd3b1、Cyp21a1、Cyp11b1、Cyp11b2、Shh、Ptch1等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较db/+和db/db小鼠左右肾上腺的形态和组织学差异。
使用体视显微镜观察肾上腺形状,测量肾上腺重量、体积、皮质体积、髓质体积、包膜厚度等参数,并进行H&E染色和油红O染色评估脂质储存。
比较左右肾上腺不同区域标志物的表达。
对肾上腺切片进行STAR、CYP11B1、TH和PNMT抗体的免疫组化染色,并计算H-score。
鉴定左右肾上腺差异表达基因并富集相关通路。
提取肾上腺总RNA,进行RNA测序,分析DEGs,进行KEGG和GO富集分析,构建PPI网络。
验证类固醇生成和肾上腺干细胞维持相关基因的表达。
对关键基因(Star, Cyp11a1, Hsd3b1, Cyp21a1, Cyp11b1, Cyp11b2, Shh, Abcb1b, Acsl1, Bmp4, Ptch1, Rspo3)进行RT-qPCR检测。
比较db/+和db/db小鼠血清代谢物差异,尤其是类固醇激素。
对血清样本进行LC-MS分析,鉴定差异代谢物,进行PCA和OPLS-DA分析,并进行KEGG通路富集。
定量比较左右肾上腺中类固醇激素的水平。
每组10个肾上腺合并为一个样本,提取类固醇,使用LC-MS/MS进行绝对定量,比较左右肾上腺和不同基因型之间的类固醇水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 形态学与组织学分析 | Motic SMZ-168体视显微镜 | Motic Germany GmbH | -- |
| 组织学分析 | Leica Aperio VESA8全切片病理扫描仪 | Leica Biosystems | -- |
| Image J Fiji软件 | -- | -- | |
| 染色 | 油红O染色液 | Sigma | -- |
| 免疫组织化学 | 兔抗STAR抗体 | Proteintech | 12225-1-AP |
| 小鼠抗CYP11B1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-377401 | |
| 兔抗TH抗体 | Abcam | ab137869 | |
| 兔抗PNMT抗体 | GeneTex | GTX114098 | |
| 转录组分析 | TRIZOL试剂 | Invitrogen | -- |
| NanoPhotometer分光光度计 | IMPLEN | -- | |
| Qubit 2.0荧光计 | Life Technologies | -- | |
| 安捷伦2100生物分析仪系统 | Agilent Technologies | -- | |
| Truseq RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Novaseq 6000测序平台 | Illumina | -- | |
| 血清代谢组学 | 超高效液相色谱ExionLC AD | Sciex | -- |
| QTRAP液相色谱-质谱联用系统 | Sciex | -- | |
| ACQUITY UPLC HSS T3 C18色谱柱 | Waters | -- | |
| 肾上腺类固醇分析 | AB 6500+ QTRAP液相色谱-质谱联用系统 | Sciex | -- |
| Phenomenex Kinetex C18色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| 检测胰岛素水平 | 小鼠胰岛素ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-EL-M1382c |
| 动物麻醉 | 异氟烷 | RWD Life Science | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | db/db小鼠(C57BLKS-Leprdb)和db/+对照小鼠(C57BLKS-Leprdb/+),11周龄雄性 阅读提示:Materials and Methods, 4.1. Morphological and Histological Analysis |
| 组织学分析 | 样本量每组6只,切片厚度5μm,使用三个最大赤道面量化面积 阅读提示:Materials and Methods, 4.2. H&E and Oil Red O Staining |
| 免疫组织化学 | 样本量每组5只,抗体稀释度:STAR 1:200, CYP11B1 1:50, TH 1:500, PNMT 1:400 阅读提示:Materials and Methods, 4.3. Immunohistochemistry |
| 转录组分析 | RNA-seq建库试剂盒和测序平台,差异表达阈值FC>1.2, FDR<0.001 阅读提示:Materials and Methods, 4.4. Transcriptomic Analysis |
| 代谢组学 | 血清体积50μL,LC-MS系统条件(色谱柱、流动相、梯度),差异代谢物标准VIP≥1, |Log2FC|≥1 阅读提示:Materials and Methods, 4.6. Serum Metabolomics |
| 肾上腺类固醇分析 | 每组10个肾上腺合并为一个样本,LC-MS/MS系统(AB 6500+ QTRAP),绝对定量43种类固醇代谢物 阅读提示:Materials and Methods, 4.7. Adrenal Steroid Profiling |