临床样本和细胞模型中检测SNHG7和FSP1表达
验证骨关节炎中SNHG7和FSP1的表达变化及相关性
收集OA患者(n=29)和正常(n=12)软骨组织,检测SNHG7和FSP1表达;用IL-1β处理原代人软骨细胞构建OA细胞模型,检测SNHG7和FSP1表达。
Exosomes-Shuttled lncRNA SNHG7 by Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Alleviates Osteoarthritis Through Targeting miR-485-5p/FSP1 Axis-Mediated Chondrocytes Ferroptosis and Inflammation.
该研究包含临床软骨组织样本、细胞模型、外泌体功能验证及分子机制验证,但缺乏体内动物实验,证据层级为体外和临床样本,未达到高完整度。
人原代软骨细胞IL-1β诱导OA模型 人骨关节炎软骨组织 人骨髓间充质干细胞外泌体
临床样本来源:正常软骨12例,OA软骨29例,需核实样本纳入标准 细胞处理:IL-1β 10 ng/mL处理24 h诱导软骨细胞OA表型 外泌体共培养:BMSCs-Exos以50 μg/mL与软骨细胞共培养 基因敲低/过表达:shFSP1、oe-SNHG7、miR-485-5p mimics转染软骨细胞或BMSCs 关键检测指标:FSP1、GPX4、PTGS2、炎症因子、铁死亡相关指标
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证骨关节炎中SNHG7和FSP1的表达变化及相关性
收集OA患者(n=29)和正常(n=12)软骨组织,检测SNHG7和FSP1表达;用IL-1β处理原代人软骨细胞构建OA细胞模型,检测SNHG7和FSP1表达。
确认BMSCs外泌体携带SNHG7并能被软骨细胞内化
用ExoQuick-TC试剂盒从BMSCs条件培养基中提取外泌体,通过TEM、NTA和Western blot鉴定外泌体特征;用RT-qPCR检测BMSCs和BMSCs-Exos中SNHG7表达;用PKH67标记外泌体与软骨细胞共培养,观察内化;用oe-SNHG7转染BMSCs,分析外泌体中SNHG7对软骨细胞SNHG7和FSP1表达的影响。
检测外泌体SNHG7对软骨细胞炎症的影响,并验证是否依赖FSP1
在IL-1β诱导的软骨细胞中,分别给予BMSCs-Exos-vector或BMSCs-Exos-SNHG7,部分细胞转染shFSP1,检测细胞活力(CCK-8)、LDH释放、IL-6和TNF-α水平。
检测外泌体SNHG7对软骨细胞铁死亡的影响,并验证是否依赖FSP1
在IL-1β诱导的软骨细胞中,给予BMSCs-Exos-vector或BMSCs-Exos-SNHG7,部分细胞转染shFSP1,检测GSH、MDA、ROS、Fe2+水平及GPX4和PTGS2蛋白表达。
阐明SNHG7调节FSP1的分子机制
通过Starbase预测与SNHG7和FSP1结合的miRNA;用SNHG7过表达检测候选miRNA表达;选择miR-485-5p进行双荧光素酶报告基因实验和RIP实验验证结合;检测SNHG7过表达对FSP1 mRNA的影响以及miR-485-5p过表达是否逆转。
确认miR-485-5p在介导外泌体SNHG7功能中的关键作用
在IL-1β诱导的软骨细胞中,给予BMSCs-Exos-vector或BMSCs-Exos-SNHG7,部分细胞转染miR-485-5p mimics,检测炎症指标(LDH、IL-6、TNF-α)和铁死亡指标(GSH、MDA、ROS、Fe2+、GPX4、PTGS2)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 抗坏血酸 | Sigma | -- | |
| 细胞处理 | 白细胞介素-1β | Peprotech | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 外泌体提取 | ExoQuick-TC外泌体提取试剂盒 | 北京博迈斯 | -- |
| 外泌体鉴定 | PKH67绿色荧光染料 | Sigma | -- |
| 蛋白质检测 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| ECL化学发光液 | Thermo | -- | |
| 抗FSP1抗体 | Santa Cruz | sc-377120 | |
| 抗PTGS2抗体 | Abcam | ab179800 | |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 抗CD63抗体 | Abcam | ab134045 | |
| 抗CD9抗体 | Abcam | ab236630 | |
| 抗CD81抗体 | Abcam | ab79559 | |
| 外泌体蛋白定量 | Bradford试剂 | Bio-Rad | -- |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| II型胶原酶 | -- | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | cDNA逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| Mir-X™ miRNA第一链合成试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Invitrogen | -- | |
| 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| LDH检测 | 细胞毒性检测试剂盒 | Roche | #11644793001 |
| ELISA检测 | IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| 铁死亡检测 | 总谷胱甘肽检测试剂盒 | Beyotime | S0052 |
| 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131S | |
| 亚铁离子比色检测试剂盒 | Elabscience | K773-M | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| DCFH-DA荧光探针 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | -- | -- |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pmirGLO载体 | Promega | -- |
| 荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| RNA免疫沉淀 | Magna RIP™ RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | #17-701 |
| Ago2抗体 | Abcam | ab186733 | |
| IgG抗体 | Abcam | ab172730 | |
| 外泌体鉴定 | 透射电子显微镜 | Philips | -- |
| NanoSight NS300纳米颗粒跟踪分析仪 | Malvern | -- | |
| 细胞成像 | 激光共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 酶标仪 | 酶标仪 | Bio-Rad | -- |
| 细胞过滤器 | 细胞过滤器 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 正常软骨样本纳入标准:创伤患者无OA或RA病史;OA软骨样本纳入标准:符合中华医学会骨科学分会OA诊断标准 阅读提示:详见Methods 'Clinical samples of cartilage tissues' |
| 细胞培养与OA模型 | 原代人软骨细胞分离方法、IL-1β处理浓度和时间 阅读提示:详见Methods 'Isolation of human primary chondrocytes' |
| 外泌体提取与鉴定 | 外泌体提取方法、鉴定标志物、粒径范围 阅读提示:详见Methods 'Isolation and identification of BMSCs derived exosomes' |
| 外泌体共培养 | 外泌体浓度和共培养时间 阅读提示:详见Methods 'Exosome uptake by chondrocytes'及图注 |
| 基因操作 | 转染试剂、质粒/病毒载体、转染时间 阅读提示:详见Methods 'Cell transfection' |
| 铁死亡检测 | 各检测试剂盒具体步骤和样本处理 阅读提示:详见Methods 'GSH, MDA and Fe2+ assays' |
| 机制验证 | 双荧光素酶报告基因和RIP实验的具体条件 阅读提示:详见Methods 'Dual-luciferase reporter assay'和'RNA immunoprecipitation' |