B7-H3敲低效率验证
筛选最有效的shRNA序列以抑制B7-H3表达
将三种特异性shRNA(sh-B7-H3-RNA1/2/3)及阴性对照转染至CNE2和5-8F细胞,通过RT-qPCR和western blot检测B7-H3表达水平。
B7-H3 promotes nasopharyngeal carcinoma progression by regulating CD8+ T cell exhaustion.
包含体外细胞实验(增殖、凋亡、迁移、侵袭、EMT)、体内裸鼠移植瘤模型、共培养及免疫检测(流式、ELISA、Co-IP)等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
人鼻咽癌细胞系CNE2 高转移性鼻咽癌细胞系5-8F 裸鼠异种移植瘤模型 鼻咽癌患者CD8+肿瘤浸润淋巴细胞
B7-H3敲低效率:使用三种shRNA(sh-B7-H3-RNA1/2/3)转染CNE2和5-8F细胞,通过RT-qPCR和western blot筛选最有效序列 细胞培养条件:DMEM高糖培养基,添加10%胎牛血清,37°C、5% CO2 稳定敲低细胞筛选:使用600 μg/mL嘌呤霉素筛选,随后300 μg/mL维持培养28天 体内实验:裸鼠皮下接种5×10^6稳定转染细胞,肿瘤体积公式(长×宽^2)/2,每2天测量 抗4-1BB抗体处理:体内腹腔注射5 mg/kg,每周两次;体外共培养时使用2 μg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选最有效的shRNA序列以抑制B7-H3表达
将三种特异性shRNA(sh-B7-H3-RNA1/2/3)及阴性对照转染至CNE2和5-8F细胞,通过RT-qPCR和western blot检测B7-H3表达水平。
评估B7-H3对NPC细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭和EMT的影响
通过CCK-8实验、克隆形成实验、流式细胞术(Annexin V/PI)、Transwell实验、划痕实验和western blot检测相关蛋白表达。
验证B7-H3敲低对肿瘤生长的影响
将稳定敲低B7-H3或对照的CNE2和5-8F细胞皮下注射入裸鼠,监测肿瘤体积和体重,并通过IHC和TUNEL染色分析增殖和凋亡。
研究B7-H3与4-1BB相互作用对CD8+ T细胞功能的影响
从NPC患者组织中分离CD8+ TIL,与CNE2细胞共培养(1:1),使用抗4-1BB或抗IgG抗体处理,检测IFN-γ和TNF-α水平、4-1BB+CD8+ T细胞比例及肿瘤细胞凋亡。
在体内验证B7-H3与4-1BB相互作用对肿瘤生长和免疫的影响
将稳定敲低B7-H3并表达萤光素酶的CNE2细胞注射入裸鼠,腹腔注射抗4-1BB或抗IgG抗体(5 mg/kg,每周两次),通过活体成像监测肿瘤生长,并检测肿瘤组织及血清中的免疫指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Gibco | -- |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | MedChemExpress | -- |
| 慢病毒感染 | CMV-luc-Neo慢病毒 | GenePharma | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| G418抗生素 | -- | -- | |
| 报告基因检测 | 被动裂解缓冲液 | YBscience | #YB-191208 |
| 荧光素酶底物 | -- | -- | |
| 细胞分离 | CD8+磁珠 | Miltenyi | 130-121-560 |
| 共培养实验 | 抗4-1BB抗体 | Abcam | -- |
| 抗IgG抗体 | Abcam | -- | |
| 免疫共沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | Thermo, Pierce | #26149 |
| 4-1BB抗体 | Abcam | #ab270527 | |
| B7-H3抗体 | Abcam | #ab134161 | |
| 兔IgG抗体 | Proteintech | #30000-0-AP | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| 抗B7-H3抗体 | Abcam | #ab227670 | |
| 抗N-钙粘蛋白抗体 | Abcam | #ab18203 | |
| 抗E-钙粘蛋白抗体 | Abcam | #ab40772 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Abcam | #ab182858 | |
| 抗Bax抗体 | Abcam | #ab182733 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | #ab181602 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Abcam | ab6721 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | TaKaRa | -- |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA去除剂) | Takara | -- | |
| TB Green预混Ex Taq II | TaKaRa | #RR820 | |
| Transwell实验 | Matrigel基质胶 | Corning Costar | -- |
| Transwell小室 | Corning Costar | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | Beyotime | -- |
| 流式细胞术 | FITC标记抗人CD8a抗体 | Elabscience | #E-AB-F1110C |
| Annexin V-FITC | -- | -- | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 动物实验 | 抗4-1BB抗体 | Abcam | #ab252559 |
| 抗IgG抗体 | Abcam | #ab133470 | |
| 免疫组化 | 抗人Ki67抗体 | Abcam | #ab16667 |
| 抗人E-钙粘蛋白抗体 | Abcam | #ab15148 | |
| 抗人Bax抗体 | Abcam | #ab32503 | |
| RP标记的山羊抗兔IgG二抗 | Abcam | #ab6721 | |
| DAB显色液 | Beyotime | #P0203 | |
| 活体成像 | d-荧光素钠盐底物 | MedChemExpress (MCE) | #HY-12591 |
| TUNEL实验 | Cy3 TUNEL凋亡检测试剂盒 | Solarbio | #T2195 |
| DAPI染色液 | Solarbio | #C0065 | |
| ELISA | 人IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience | #E-EL-H0108c |
| 人TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | #E-EL-H0109c | |
| 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience | #E-EL-M0048c | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | #E-EL-M3063 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC)、培养基(DMEM高糖)、FBS浓度(10%)、培养条件(37°C、5% CO2)、传代次数(复苏后5-10代内使用) 阅读提示:Methods 2.1 |
| 基因敲低 | shRNA序列(见表1)、转染试剂(Lipofectamine 3000)、转染时间(4-6小时)、筛选浓度(600 μg/mL Puromycin)、维持浓度(300 μg/mL) 阅读提示:Methods 2.2 及表1 |
| 体外功能实验 | CCK-8检测时间点(0、24、48、72小时)、Transwell侵袭实验(Matrigel包被、8-μm孔径、孵育48小时)、划痕实验(细胞密度5×10^5/孔、观察24小时) 阅读提示:Methods 2.9-2.11 |
| 体内异种移植模型 | 小鼠品系(裸鼠)、性别(雌性)、年龄(6-7周)、体重(20±2 g)、细胞接种量(5×10^6)、肿瘤体积计算公式(长×宽^2/2) 阅读提示:Methods 2.13 |
| 共培养实验 | CD8+ TIL分离(CD8+磁珠)、CNE2与TIL比例(1:1)、共培养时间(24小时)、抗4-1BB抗体浓度(2 μg/mL) 阅读提示:Methods 2.5 |
| 体内抗体处理 | 抗4-1BB剂量(5 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、频率(每周两次)、肿瘤细胞(CNE2-luc) 阅读提示:Methods 2.13 |
| 统计方法 | 统计检验(非配对t检验或单因素方差分析)、显著性阈值(p<0.05) 阅读提示:Methods 2.19 |