诱导内质网应激
建立内质网应激模型,模拟神经退行性疾病中的蛋白错误折叠状态。
使用300 nM Thapsigargin预处理SH-SY5Y细胞30分钟、1小时或4小时,以阻断SERCA泵,破坏钙稳态,诱导内质网应激。
The ER Stress Induced in Human Neuroblastoma Cells Can Be Reverted by Lumacaftor, a CFTR Corrector.
使用SH-SY5Y细胞模型,通过Western blot、RT-PCR、流式细胞术和钙成像等方法验证了内质网应激、氧化应激和凋亡相关指标,但缺乏体内实验和多层级验证。
SH-SY5Y人神经母细胞瘤细胞系
Thapsigargin预处理浓度和时间:300 nM,30 min、1 h、4 h Lumacaftor给药浓度和时间:2 μM,24 h 细胞培养条件:DMEM/F12培养基,10% FBS,100 U/mL青霉素,100 μg/mL链霉素,37°C,5% CO2 细胞活力检测:MTT法,细胞接种密度4.5×10^3/孔 统计方法:非参数Mann-Whitney U检验,p<0.05被认为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立内质网应激模型,模拟神经退行性疾病中的蛋白错误折叠状态。
使用300 nM Thapsigargin预处理SH-SY5Y细胞30分钟、1小时或4小时,以阻断SERCA泵,破坏钙稳态,诱导内质网应激。
评估Lumacaftor对已诱导的内质网应激的干预效果。
在去除Thapsigargin后,向细胞加入含或不含2 μM Lumacaftor的新鲜培养基,处理24小时。
分析Lumacaftor对UPR关键蛋白(BiP、ATF4、ATF6、p-PERK)的影响。
通过Western blotting检测细胞裂解物中BiP、ATF4、ATF6、PERK/p-PERK的表达水平,并以actin或tubulin作为内参。
评估IRE1α通路的激活状态。
通过RT-PCR检测XBP1 mRNA的未剪接(452 bp)和剪接(426 bp)形式。
评估Lumacaftor对细胞内钙稳态的影响。
使用Fura 2-AM荧光指示剂,在无钙培养基中,通过加入TG(1 nM)或Ionomycin(1 μM)测量内质网钙释放和胞质钙浓度。
评估Lumacaftor对胞质和线粒体ROS的影响。
使用H2DCF-DA探针检测胞质ROS,使用MitoSOX Red探针检测线粒体超氧化物,通过流式细胞术测量。
评估Lumacaftor对内质网应激诱导的凋亡的影响。
通过流式细胞术检测hypodiploid nuclei(亚二倍体核)百分比和caspase 4阳性细胞百分比。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Euroclone | -- |
| 胎牛血清 | Euroclone | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | Lumacaftor (Vx-809) | Selleckchem | S1565 |
| 毒胡萝卜素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | 抗Grp78/BiP抗体 | Cell Signaling | 3177 |
| 抗ATF6抗体 | Cell Signaling | 658805 | |
| 抗ATF4抗体 | Proteintech | 10835-1-AP | |
| 抗PERK抗体 | Cell Signaling | 3192 | |
| 抗MnSODIII抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271170 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | OriGene | TA811000 | |
| 抗微管蛋白抗体 | -- | sc-5286 | |
| 抗caspase 4抗体 | -- | sc-1229 | |
| 抗兔二抗 | Bethyl Laboratories | A120-101P | |
| 抗小鼠二抗 | Bethyl Laboratories | A90-137P | |
| 流式分析 | Texas红偶联二抗 | Thermo Fisher Scientific | T6390 |
| ROS检测 | MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | M36008 |
| 细胞活力 | 噻唑蓝四氮唑溴化物 | Sigma-Aldrich | -- |
| ROS检测 | 2',7'-二氯荧光素二乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 凋亡检测 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 钙信号检测 | Fura-2-AM | Sigma-Aldrich | -- |
| 离子霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| RT-PCR | TRI试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | -- | K1622 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:SH-SY5Y;培养基:DMEM/F12,10% FBS,100 U/mL青霉素,100 μg/mL链霉素;培养条件:37°C,5% CO2;传代周期:每周;实验时融合度<80%。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.2 |
| 药物处理 | Thapsigargin预处理浓度:300 nM;处理时间:30 min、1 h、4 h;Lumacaftor浓度:2 μM;处理时间:24 h。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.3 |
| 细胞活力检测 | MTT法;细胞密度:4.5×10^3/孔;MTT浓度:5 mg/mL;孵育时间:1 h;阳性对照:Staurosporine 0.2 μM;检测波长:620 nm。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.4 |
| Western blot | 细胞数:1×10^6/板;裂解液成分;裂解时间30 min;离心:14,000 rpm,15 min,4°C;蛋白定量:Bradford;上样量:60 μg;凝胶浓度:8-10%;转膜;封闭:5%脱脂奶粉,2 h;一抗孵育:4°C过夜;二抗孵育1 h;内参:actin或tubulin。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.5 |
| RT-PCR | RNA提取:TRI Reagent;逆转录:0.5 μg RNA;cDNA量:2 μL;PCR引物序列:F: 5'-C CTT CTG GGT AGA CCT CTG GGA G-3',R: 5'-A AAC AGA GTA GCA GCT CAG ACT GC-3';凝胶:4%琼脂糖,溴化乙锭染色;产物大小:452 bp(未剪接)和426 bp(剪接)。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.6 |
| 钙信号检测 | 细胞密度:3×10^4/孔;Fura 2-AM浓度:5 μM;孵育时间:45 min;检测:340/380 nm荧光比值;TG刺激浓度:1 nM;Ionomycin浓度:1 μM;缓冲液:无钙HBSS/0.5 mM EGTA。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.7 |
| ROS检测 | 细胞密度:8×10^4/孔;H2DCF-DA浓度:10 μM,孵育30 min,37°C;MitoSOX Red浓度:2.5 μM,孵育15 min,37°C;检测:流式细胞仪。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.8 |
| 凋亡检测 | 细胞密度:8×10^4/孔;固定液:2% FBS,4%甲醛,0.1%叠氮钠;透化液:4%甲醛,0.1% Triton X-100,2% FBS,0.1%叠氮钠;caspase 4一抗;Texas-Red二抗;PI浓度:50 μg/mL;检测:流式细胞术。 阅读提示:Materials and Methods, Sections 2.9 and 2.10 |
| 统计分析 | 至少三次独立实验,每次技术重复三次;数据以平均值±标准误表示;使用非参数Mann-Whitney U检验;显著性水平:p<0.05。 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.11 |