诱导视网膜变性模型
建立MNU诱导的视网膜变性小鼠模型,模拟感光细胞退化过程。
对C57BL/6J野生型和Trem2−/−小鼠进行单次腹腔注射MNU(60 mg/kg体重)以诱导视网膜变性。
TREM2-dependent activation of microglial cell protects photoreceptor cell during retinal degeneration via PPARγ and CD36.
包含两种独立小鼠模型(MNU诱导和rd10)及多种验证(TUNEL、免疫荧光、Western blot、RNA-seq、ELISA、flow cytometry),并进行功能验证(PPARγ激动剂、CD36抑制剂)和机制探索。
MNU诱导的C57BL/6J小鼠视网膜变性模型 Trem2−/−小鼠MNU诱导视网膜变性模型 rd10小鼠视网膜变性模型 RhoP23H/WT小鼠视网膜变性模型
MNU剂量:60 mg/kg体重,单次腹腔注射 Trem2−/−小鼠与WT小鼠的基因型对照 GW1929(PPARγ激动剂)剂量:30 mg/kg,腹腔注射两次 SSO(CD36抑制剂)剂量:50 mg/kg,口服灌胃 检测时间点:MNU处理后1天和3天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立MNU诱导的视网膜变性小鼠模型,模拟感光细胞退化过程。
对C57BL/6J野生型和Trem2−/−小鼠进行单次腹腔注射MNU(60 mg/kg体重)以诱导视网膜变性。
观察视网膜变性过程中感光细胞凋亡和小胶质细胞的动态变化。
在不同时间点(12小时至7天)使用TUNEL染色检测感光细胞凋亡,使用IBA1染色检测小胶质细胞浸润,并测量外核层厚度。
确定视网膜变性过程中小胶质细胞是否表达疾病相关小胶质细胞(DAM)特征基因。
使用RNA-seq和qPCR分析WT和rd10小鼠视网膜中DAM特征基因(如Trem2、Axl、Lgals3等)的表达,并通过Western blot验证蛋白水平。
确定TREM2在视网膜变性中的保护作用及其对小胶质细胞功能的影响。
比较MNU处理WT和Trem2−/−小鼠的感光细胞凋亡、小胶质细胞浸润和炎症反应。
鉴定Trem2缺失导致的小胶质细胞基因表达差异,揭示潜在机制。
使用CD11b磁珠分选小胶质细胞,进行低起始量RNA-seq,分析Trem2−/−与WT小胶质细胞的差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
确定PPARγ激活是否能改善Trem2缺失引起的感光细胞变性和小胶质细胞功能障碍。
对MNU处理的Trem2−/−小鼠给予PPARγ激动剂GW1929,评估感光细胞凋亡、小胶质细胞迁移和CD36表达;同时使用PPARγ拮抗剂GW9662处理WT小鼠验证其必要性。
确定CD36是否为PPARγ介导的小胶质细胞保护作用的关键下游分子。
使用CD36抑制剂SSO处理MNU处理的WT小鼠和GW1929处理的Trem2−/−小鼠,观察小胶质细胞迁移和感光细胞变性的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | GW1929 | MedChemExpress | HY-15655 |
| GW9662 | MedChemExpress | HY-16578 | |
| GW0742 | MedChemExpress | HY-13928 | |
| 硫代琥珀酰亚胺油酸钠 | MedChemExpress | HY-112847A | |
| 免疫荧光染色 | 抗IBA1抗体 | Wako | 019-19741 |
| 抗IBA1抗体 | Wako | 011-27991 | |
| 抗CD68抗体 | Bio-Rad | MCA1957 | |
| 抗TREM2抗体 | Abcam | ab305103 | |
| Alexa Fluor 594抗小鼠I-A/I-E抗体 | Biolegend | 107650 | |
| 含DAPI的抗淬灭剂 | ThermoFisher | S36938 | |
| TUNEL检测 | TUNEL标记试剂盒 | Roche | 11684795910 |
| 脂质染色 | 油红O染色试剂盒 | Beyotime | C0158S |
| BODIPY染色试剂盒 | Beyotime | C2053S | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0044 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037 | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0046 | |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 |
| QuickBlock封闭液 | Beyotime | P0252 | |
| 抗CD36抗体 | CST | 28109S | |
| 抗AXL抗体 | Abcam | ab215205 | |
| 抗CD11c抗体 | CST | 97585 | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | 1705061 | |
| 细胞分离 | 神经组织解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-802 |
| CD11b微珠 | Miltenyi Biotec | 130-093-634 | |
| MACS分离柱 | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
| 流式分析 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Absin | abs50001 |
| BD FACSCelesta流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- | |
| RNA测序 | Bioanalyzer 2100 | Agilent Technologies | -- |
| Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| RNA Clean & Concentrator-5 | ZYMO Research | -- | |
| 逆转录和qPCR | PrimeScript RT试剂 | Takara | -- |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | MNU剂量:60 mg/kg体重,单次腹腔注射;小鼠品系:C57BL/6J WT和Trem2−/−;鼠龄:8-10周 阅读提示:Materials and methods: Animal husbandry, the induction of retinal degeneration and treatments |
| 药物处理 | GW1929剂量:30 mg/kg,腹腔注射两次;GW9662剂量:4 mg/kg,腹腔注射两次;SSO剂量:50 mg/kg,口服灌胃 阅读提示:Materials and methods: Animal husbandry, the induction of retinal degeneration and treatments |
| 组织处理 | 固定:4% PFA 1小时;脱水:20%和40%蔗糖;切片厚度:10 μm 阅读提示:Materials and methods: Retinal tissue processing |
| 免疫荧光染色 | 一抗浓度:anti-IBA1 (1:500), anti-CD68 (1:100), anti-TREM2 (1:200), MHC II (1:200);封闭:10%血清;透化:0.2% Triton X-100 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry |
| Western blot | 上样量:10 μg总蛋白;抗体浓度:anti-CD36 (1:1000), anti-TREM2 (1:1000), anti-AXL (1:1000), anti-CD11c (1:1000), anti-β-actin (1:20000) 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| 流式分析 | 细胞染色:Annexin V-FITC和PI;上机:BD FACSCelesta;分析软件:FlowJo 10.8.1 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry |
| RNA-seq | 差异基因标准:|log2FC| > 1, adjusted p-value < 0.05;测序平台:Illumina NovaSeq 6000;数据库:GEO GSE270758 阅读提示:Materials and methods: RNA sequencing and data analysis |