提取、分离与表征
从A. polystachya茎皮中获取并鉴定三萜类化合物,为后续活性筛选提供物质基础。
采用丙酮提取、硅胶柱层析分离得到五种三萜类化合物,通过NMR和HRMS鉴定其结构,并利用HPLC检测纯度。
A comprehensive apoptotic assessment of niloticin in cervical cancer cells: a tirucallane-type triterpenoid from Aphanamixis polystachya (Wall.) Parker.
包含体外细胞实验(MTT、凋亡、细胞周期、线粒体膜电位、抗转移)、分子对接和分子动力学模拟,以及蛋白表达分析(凋亡抗体阵列)等多个独立证据层级,并包含功能验证和机制验证。
HeLa宫颈癌细胞系 MCF-10A正常乳腺上皮细胞系 其他癌细胞系(A549、PANC-1、MDA-MB-231、SiHa)
niloticin浓度:7 μM和11 μM用于凋亡评估,3 μM和6 μM用于抗转移评估 细胞系来源:HeLa、MDA-MB-231来自ATCC;A549、PANC-1来自NCCS;MCF-10A来自Elabscience 处理时间:24小时和48小时用于细胞增殖;24小时用于凋亡;0、24、48小时用于伤口愈合 分子对接蛋白结构:p53 (1TUP)、Fas (3EZQ)、FasL (5L19)、Bax (6EB6)、CDK2 (2UZE)、BCL2 (6O0K)、TNFβ (1TNR)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从A. polystachya茎皮中获取并鉴定三萜类化合物,为后续活性筛选提供物质基础。
采用丙酮提取、硅胶柱层析分离得到五种三萜类化合物,通过NMR和HRMS鉴定其结构,并利用HPLC检测纯度。
评估分离化合物对宫颈癌细胞的抑制活性并选择最具潜力的候选分子。
使用MTT法在HeLa细胞中检测化合物的细胞毒性,并进一步测试尼罗替辛对其他癌细胞系及正常细胞的选择性。
预测尼罗替辛与凋亡相关蛋白的结合亲和力及稳定性,为作用机制提供理论依据。
使用AutoDock Vina进行分子对接,评估尼罗替辛与p53、Fas、FasL、Bax、CDK2、BCL2、TNFβ的结合;通过Desmond进行100 ns分子动力学模拟,分析RMSD。
体外验证尼罗替辛对HeLa细胞的凋亡诱导作用及途径。
使用AO/EB双染、APOPercentage、Annexin V-FACS检测凋亡;通过caspase荧光检测评估caspase-3/8/9活性;通过Hoechst染色和DNA ladder及SERS分析DNA断裂和核浓缩。
研究尼罗替辛对HeLa细胞周期的影响,探索其抑制增殖的机制。
通过PI染色流式分析测定细胞周期各阶段分布,并通过Western blot检测细胞周期调节蛋白(Cdk-2、cyclin A2、cyclin B1、Cdc25)的表达。
检测尼罗替辛对线粒体功能的影响,验证内源性凋亡途径。
使用JC-1染料染色,观察线粒体膜电位变化,通过荧光显微镜检测红/绿荧光强度变化。
评估尼罗替辛抑制宫颈癌细胞克隆形成、迁移和增殖的能力。
通过克隆形成实验评估细胞增殖能力,通过划痕实验评估迁移能力,通过免疫荧光检测Ki67表达。
阐明尼罗替辛诱导凋亡的分子机制,确定涉及的信号通路。
使用人凋亡抗体阵列膜检测43种凋亡相关蛋白的表达变化,并与对照组比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | -- |
| 胎牛血清 | Himedia | -- | |
| 抗生素抗真菌溶液 | Himedia | -- | |
| 乳腺上皮细胞生长培养基 | Lonza | -- | |
| 细胞增殖实验 | MTT | -- | -- |
| Synergy H1多功能酶标仪 | Biotek | -- | |
| 分离纯化 | 硅胶(100-200目) | Merck | -- |
| TLC | 硅胶60 F254薄层板 | Merck | -- |
| NMR | Bruker Avance 500 MHz核磁共振仪 | Bruker | -- |
| HRMS | Thermo Scientific Exactive质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| HPLC | Waters Arc分析型高效液相色谱仪 | Waters | -- |
| 计算机模拟 | SwissADME | -- | -- |
| AutoDock Vina | -- | -- | |
| UCSF Chimera 1.16 | -- | -- | |
| Desmond(Schrödinger套件) | Schrödinger | -- | |
| 凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD Pharmingen | -- |
| caspase检测 | Caspase荧光检测试剂盒 | Abcam | -- |
| DNA ladder | Geneaid基因组DNA小提试剂盒 | Geneaid | GB100 |
| SERS | 金纳米颗粒 | -- | -- |
| WITec拉曼显微镜 | WITec | -- | |
| 细胞周期分析 | BD Cycle Test Plus DNA试剂盒 | BD Pharmingen | 340242 |
| Western blot | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | 23225 |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| Takara Western BloT Hyper HRP底物 | Takara | -- | |
| Chemidoc成像系统 | Biorad | -- | |
| 线粒体膜电位 | JC-1染料 | Sigma Aldrich | -- |
| 抗转移实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Ki67一抗 | Cell Signaling Technology | -- |
| 凋亡蛋白表达 | 人凋亡抗体芯片 | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HeLa细胞培养条件:DMEM培养基+10% FBS+1%抗生素,37°C,5% CO2;MCF-10A细胞培养于MEGM+5%马血清 阅读提示:Materials and methods - Cell culture methods |
| 细胞增殖 | 细胞接种密度8×10^3细胞/100 μL;化合物浓度5-100 μM;处理时间24和48小时 阅读提示:Materials and methods - Cell proliferation assay |
| 凋亡诱导 | 处理浓度7 μM和11 μM;孵育时间24小时 阅读提示:Results - Apoptotic evaluation; Materials and methods - Apoptotic assays |
| caspase检测 | 细胞接种密度3×10^6细胞/6孔板;处理浓度7和11 μM;孵育时间24小时;荧光激发400 nm/发射505 nm 阅读提示:Materials and methods - Caspase fluorometric assay |
| DNA fragmentation | DNA提取试剂盒Geneaid GB100;琼脂糖凝胶浓度0.8%,电压80V;SERS底物AuNPs 40-45 nm,633 nm激光,5 mW功率 阅读提示:Materials and methods - Nucleic acid degradation and DNA fragmentation studies |
| 细胞周期分析 | BD Cycle Test Plus DNA Kit;Western blot检测Cdk-2、cyclin A2、cyclin B1、Cdc25,一抗来源Cell Signaling Technology 阅读提示:Materials and methods - Cell cycle analysis |
| 线粒体膜电位 | JC-1染料处理浓度未明确;孵育时间24小时 阅读提示:Materials and methods - Mitochondrial membrane potential analysis |
| 抗转移评估 | 克隆形成:细胞密度1×10^3细胞/孔,处理浓度3和6 μM,孵育9天;划痕实验:处理浓度3和6 μM,观察0、24、48小时;Ki67免疫荧光:处理浓度3和6 μM,孵育24小时 阅读提示:Materials and methods - Anti-metastatic studies; Immunofluorescence assay of Ki67 |
| 凋亡蛋白表达 | 细胞处理浓度和孵育时间未明确;使用Abcam human apoptotic antibody array membrane 阅读提示:Materials and methods - Apoptotic protein expression |