三部分基序（TRIM）家族的分子特征研究及TRIM31在胃癌中的初步验证

大多数以E3泛素连接酶为特征的TRIM家族成员参与泛素化和肿瘤发生。然而，目前缺乏对该家族在胃癌（GC）中的全面研究。通过结合TCGA和GEO数据库，获得常见的TRIM家族成员（TRIMs），以研究基因表达、基因突变和临床预后。基于TRIMs，进行了共识聚类分析，并开发了风险评估系统和预后模型。特别地，选择具有临床预后和诊断价值的TRIM31进行单基因生物信息学分析、体外实验验证和临床组织微阵列的免疫组织化学分析。合并数据集包含66个TRIMs，其中52个差异表达，43个差异预后。通过共识聚类分析获得的基因簇之间存在显著的生存差异。使用通过多变量Cox回归和LASSO回归鉴定的4个差异表达基因，开发了风险评分系统。较高的风险评分与较差的预后、抑制性免疫细胞浸润和药物耐药性相关。转录组数据和临床样本组织微阵列证实TRIM31在GC中高表达，并与不良预后相关。通路富集分析、细胞迁移和集落形成实验、EdU实验、活性氧（ROS）实验和线粒体膜电位实验揭示，TRIM31可能与细胞周期调控和氧化应激相关通路有关，有助于胃癌发生。本研究调查了TRIM家族在GC中的整体功能和表达谱以及基于该家族的风险评分系统。围绕TRIM31的进一步研究为理解其家族其他成员在GC中的潜在作用机制提供了见解。