建立体外和体内模型并检测Pim-1表达
研究Pim-1在肝脏IR中是否表达变化。
构建MIHA细胞缺氧复氧模型和C57BL/6J小鼠肝脏IR模型,通过Western blot、qPCR、H&E染色和免疫组化检测Pim-1表达。
Pim-1 kinase protects the liver from ischemia reperfusion injury by regulating dynamics-related protein 1.
包含体外细胞缺氧复氧模型、小鼠肝脏IR模型、临床患者样本三个独立证据层级,并进行了功能获得与缺失验证、机制验证(Drp1磷酸化及线粒体易位)和表观调控验证。
MIHA细胞缺氧复氧模型 小鼠肝脏缺血再灌注模型 肝移植患者临床样本
MIHA细胞缺氧复氧处理时间(0, 2, 6, 12小时) 小鼠缺血1小时再灌注时间(0, 6, 12, 24小时) Pim-1抑制剂TCS Pim-1给药剂量5 mg/kg,腹腔注射5天 siRNA敲低和慢病毒过表达Pim-1的MIHA细胞系 临床样本量(n=20),血清ALT/AST检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究Pim-1在肝脏IR中是否表达变化。
构建MIHA细胞缺氧复氧模型和C57BL/6J小鼠肝脏IR模型,通过Western blot、qPCR、H&E染色和免疫组化检测Pim-1表达。
探讨Pim-1表达与肝移植患者肝损伤指标的相关性。
收集肝移植患者再灌注前后肝组织和血清样本,通过qPCR、Western blot、免疫组化检测Pim-1表达,并关联血清ALT/AST水平及临床预后。
验证Pim-1是否抑制缺氧复氧诱导的肝细胞凋亡。
在MIHA细胞中敲低和过表达Pim-1,进行缺氧复氧处理,检测凋亡相关蛋白和TUNEL染色。
验证抑制Pim-1是否加重小鼠肝脏IR损伤。
腹腔注射Pim-1抑制剂TCS Pim-1后建立小鼠肝脏IR模型,通过H&E、免疫组化、TUNEL和血清ALT/AST检测评估损伤。
阐明Pim-1是否通过调控Drp1的磷酸化状态和线粒体转位来保护线粒体。
在体外敲低Pim-1和体内抑制Pim-1的模型中,通过Western blot和免疫荧光检测Drp1磷酸化及线粒体定位。
验证Pim-1维持线粒体形态完整性并抑制凋亡信号。
通过透射电子显微镜观察肝组织和MIHA细胞线粒体形态,并检测细胞色素c在胞质和线粒体的分布。
探讨Pim-1上调是否依赖于H3K9me3的表观遗传修饰。
通过Western blot检测H3K9me3表达,使用ChIP-qPCR检测H3K9me3与Pim-1启动子的结合,使用chaetocin抑制H3K9me3并检测Pim-1表达和启动子活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Cas9X | GUMD-B301 |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Solarbio | T1320 | |
| 胎牛血清 | Cas9X | FBP-C520 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | ThermoFisher | L3000001 |
| 药物处理 | TCS PIM-1 1(Pim-1激酶抑制剂) | Medchem express | HY-18086 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026CN |
| 药物溶解 | 二甲基亚砜 | Solarbio | D8371 |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A321&E-CK-A322 |
| 组织学染色 | H&E染色试剂盒 | Beyotime | C0105S |
| 血清ALT检测 | ALT检测试剂盒 | NJBI | C009-2-1 |
| 血清AST检测 | AST检测试剂盒 | NJBI | C010-2-1 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot化学发光 | BeyoECL Plus化学发光试剂 | Beyotime | P0018S |
| Western blot | PIM-1抗体 | Abcam | ab308006 |
| Caspase3抗体 | Cell Signaling | 9662 | |
| Cleaved Caspase3抗体 | Cell Signaling | 9664 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| p-Drp1抗体 | Cell Signaling | 3455 | |
| T-Drp1抗体 | Cell Signaling | 8570 | |
| H3K9me3抗体 | Abcam | ab8898 | |
| COX IV抗体 | Affinity | AF5468 | |
| H3抗体 | Cell Signaling | 4499 | |
| Bax抗体 | Affinity | AF0120 | |
| Bcl-2抗体 | Affinity | AF6139 | |
| 细胞色素c抗体 | Cell Signaling | 11940 | |
| Mff抗体 | Abcam | ab129075 | |
| Fis1抗体 | Abcam | ab156865 | |
| 线粒体分离 | 线粒体分离试剂 | Beyotime | C3601 |
| RNA逆转录 | GoScript逆转录混合物 | Promega | -- |
| qPCR | GoTaq qPCR预混液 | Promega | -- |
| 色谱分析 | 自动生化分析仪 | Hitachi | Labospect |
| 透射电子显微镜 | 透射电子显微镜 | Hitachi | 7500 |
| 细胞系 | MIHA细胞系 | FENGHUISHENGWU | CL-0469 |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Experimental Animal Center of Qingdao University | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞缺氧复氧模型 | 缺氧时间、复氧时间、细胞培养条件 阅读提示:STAR★Methods: Hypoxia/reoxygenation (HR) model |
| 小鼠肝脏IR模型 | 缺血时间、再灌注时间、小鼠品系、给药剂量 阅读提示:STAR★Methods: Mouse model of hepatic ischemia‒reperfusion and drug treatment |
| Pim-1敲低和过表达 | siRNA序列、慢病毒构建、转染条件、筛选浓度 阅读提示:STAR★Methods: Cell culture and transfection |
| 凋亡检测 | TUNEL试剂盒、染色步骤、定量方法 阅读提示:STAR★Methods: Terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling (TUNEL) assay |
| Drp1机制研究 | 磷酸化位点、线粒体分离方法、蛋白定量 阅读提示:STAR★Methods: Separation of mitochondria and cytoplasmic proteins |
| 表观调控研究 | ChIP步骤、chaetocin浓度、荧光素酶报告基因构建 阅读提示:STAR★Methods: Chromatin immunoprecipitation assay (ChIP) 和 结果部分 |