Helq敲除mESC的建立与多能性验证
验证Helq缺失是否影响mESC的多能性
使用CRISPR/Cas9技术获得Helq−/− mESCs,通过免疫荧光检测OCT4和NANOG表达,并与WT比较。
HELQ deficiency impairs the induction of primordial germ cell-like cells.
包含体外小鼠PGCLC诱导、基因修复恢复实验、凋亡检测、p53抑制剂拯救实验以及人PGCLC诱导等多个独立证据层级,并包含功能验证。
小鼠胚胎干细胞(mESC) 人胚胎干细胞(hESC) 小鼠PGCLC诱导模型 人PGCLC诱导模型
Helq敲除小鼠胚胎干细胞(Helq−/− mESCs) p53抑制剂(pifithrin-α)处理 单等位基因修复的Helq-R mESCs 人HELQ基因敲除hESC系
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Helq缺失是否影响mESC的多能性
使用CRISPR/Cas9技术获得Helq−/− mESCs,通过免疫荧光检测OCT4和NANOG表达,并与WT比较。
评估Helq缺失对mPGCLC诱导效率的影响
将mESCs诱导为EpiLCs,再通过悬浮培养诱导为mPGCLCs,使用报告基因和FACS分析BV和SC表达。
确认Helq缺失是导致mPGCLC诱导效率降低的原因
利用CRISPR/Cas9和单链DNA寡核苷酸对Helq−/− mESCs进行基因修复,获得Helq-R细胞,并检测mPGCLC诱导效率。
探究Helq缺失是否导致PGCLC诱导过程中细胞凋亡增加
使用Annexin V-FITC/7-AAD染色和TUNEL染色检测WT和Helq−/− EBs在第6天的凋亡细胞比例。
验证p53信号通路是否介导Helq缺失引起的凋亡和诱导效率降低
在mPGCLC诱导过程中加入p53抑制剂pifithrin-α及其类似物,检测BV+细胞比例变化。
评估HELQ缺失对人PGCLC诱导的影响
使用CRISPR/Cas9技术敲除hESC中的HELQ,诱导hPGCLCs,通过FACS分析EpCAM和INTEGRINa6阳性细胞比例,并通过免疫荧光检测OCT4和TFAP2C。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | PD0325901 | TargetMol | T6189 |
| CHIR99021 | TargetMol | T2310 | |
| 白血病抑制因子 | Merck Millipore | ESG1107 | |
| 多聚-L-鸟氨酸 | Sigma | A-004-M | |
| 层粘连蛋白 | Invitrogen | 23017015 | |
| 基质胶 | Corning Inc. | 354277 | |
| mTeSR1培养基 | Stemcell | 85850 | |
| Y-27632 | Tocris | 1254 | |
| 人血浆纤连蛋白 | Merck Millipore | FC010 | |
| 激活素A | R&D Systems | 338-AC | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | R&D Systems | 133-FB | |
| 基因敲除血清替代物 | Gibco | 10828028 | |
| 骨形态发生蛋白4 | R&D Systems | 314-BP-010 | |
| 干细胞因子 | R&D Systems | 255-SC-010 | |
| 表皮生长因子 | R&D Systems | 236-EG | |
| 白血病抑制因子 | R&D Systems | 7734-LF-500 | |
| TrypLE Select | Life Technologies | -- | |
| TrypLE Express | Gibco | 12604013 | |
| Western blot | 抗HELQ抗体 | Cell Signaling Technology | 19436 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 20536 | |
| 抗兔HRP | ZSJB-Bio | zb2301 | |
| ECL试剂盒 | Yeason | 36208ES60 | |
| 免疫荧光 | Hoechst 33432 | -- | -- |
| LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 抗OCT4抗体 | Abcam | ab19857 | |
| 抗NANOG抗体 | Abcam | ab70482 | |
| 抗OCT4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5279 | |
| 抗SOX2抗体 | Abcam | ab97959 | |
| 抗TFAP2C抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8977 | |
| 流式分析 | APC偶联抗人CD326(EpCAM)抗体 | Biolegend | 324208 |
| BV421偶联抗人/小鼠CD49f(INTEGRINa6)抗体 | Biolegend | 313624 | |
| FACS Calibur流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/7-AAD细胞凋亡检测试剂盒 | Procell | P-CA-202 |
| 一步法TUNEL原位凋亡试剂盒 | Elabscience | E-CK-A322 | |
| 统计分析 | Prism | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | mESC培养条件:N2B27培养基、2i-LIF(PD0325901和CHIR99021浓度)、饲养层细胞;hESC培养条件:Matrigel包被、mTeSR1培养基 阅读提示:Materials and methods: Culture of mouse embryonic stem cells (mESCs) and human embryonic stem cells (hESCs) |
| 小鼠PGCLC诱导 | EpiLC诱导:细胞密度、纤维连接蛋白浓度、activin A和bFGF浓度、时间;mPGCLC诱导:起始细胞数、培养基成分(15% KSR和Dox)、培养时间(6天) 阅读提示:Materials and methods: Induction of EpiLCs and mPGCLCs |
| 人PGCLC诱导 | iMeLC诱导:细胞密度、CHIR99021浓度、Y-27632浓度、时间(40-48小时);hPGCLC诱导:细胞数(3000)、细胞因子浓度(BMP4、SCF、EGF、LIF) 阅读提示:Materials and methods: Induction of hPGCLCs |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/7-AAD检测步骤和TUNEL染色步骤 阅读提示:Materials and methods: Cell apoptosis analysis |
| p53抑制剂处理 | pifithrin-α浓度和处理时间 阅读提示:Results: p53 inhibitor can partially rescue the efficiency of the induction of mPGCLCs from the Helq−/− line |